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2012 Fiscal Year Annual Research Report

休眠段階におけるリボソームのタンパク質合成抑制機構の解明

Research Project

Project/Area Number 23770206
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

加藤 貴之  大阪大学, 生命機能研究科, 助教 (20423155)

Keywords100Sリボソーム / 飢餓的ストレス / 低温電子顕微鏡 / 単粒子像解析
Research Abstract

生物は様々な環境変化に対するストレス応答機構を備えているが、最も身近なストレスである飢餓状態ですら、その応答のメカニズムは解明されていない。グラム陰性菌、陽性菌共に、飢餓的ストレスに曝されると、70Sリボソームが2量体化した100Sリボソームを形成し、タンパク質の合成を抑制する。しかし、100Sリボソームがどのようにしてタンパク質合成を抑制しているのか、70S同士はどのように結合しているのかなど、多くのことが明らかにされていない。そこで、ストレス応答時の100Sリボソーム形成とタンパク質合成抑制のメカニズムを明らかにするために、それぞれのリボソームを単離精製し、低温電子顕微鏡を用いた構造解析を行った。大腸菌(グラム陰性)の100Sリボソームはお互いの30Sのもっとも突き出たS2タンパク質が、相手側のS3、S4、S5が形成するポケットにはまり込むようにして結合していた。S3、S4、S5によって形成されるポケットはmRNAの入り口であり、これは100Sリボソーム形成によってmRNAがリボソームに入って行くのを抑制することでタンパク質合成を抑制していることが明らかとなった。一方、黄色ブドウ球菌(グラム陽性)の場合、お互いの30Sを介して結合している点では大腸菌と同じだが、S2は結合に関与しておらず、互いのmRNAの出口を塞ぐような位置で結合していることが明らかとなった。これらの結合様式の違いは、100Sリボソーム形成因子であるHPFの違いによるものと仮説を立て、大腸菌HFPと類似のHPFを持つErvinia、黄色ブドウ球菌と類似のHPFを持つ乳酸菌を用いて同様の実験を行ったところ、Erviniaでは大腸菌と、乳酸菌では黄色ブドウ球菌と同様の結合をしていることが明らかとなり、この仮説が正しいことが証明された。

  • Research Products

    (13 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (12 results)

  • [Journal Article] Architecture of a flagellar apparatus in the fast-swimming magnetotactic bacterium MO-1.2012

    • Author(s)
      Ruan, J., Kato, T., Santini, C.-L., Miyata, T., Kawamoto, A., Zhang, W.-J., Bernadac, A., Wu, L.-F. & Namba, K.
    • Journal Title

      Proc. Natl Acad. Sci. USA

      Volume: 109 Pages: 20643-20648

    • DOI

      doi:10.1073/pnas.1215274109

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural analysis of the flagellar hook-basal body with the C ring by electron cryomicroscopy.2013

    • Author(s)
      Miyata, T
    • Organizer
      Nagoya Symposium -Frontiers in Structural Physiology-
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      20130122-20130124
  • [Presentation] Structure and domain movement of FliD cap from Cryo-EM map of cap-junction complex.2013

    • Author(s)
      Makino, F
    • Organizer
      Nagoya Symposium -Frontiers in Structural Physiology-
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      20130122-20130124
  • [Presentation] Cryo-EM analysis of the FljB filament-implications for immune escape.2013

    • Author(s)
      Toma, S.
    • Organizer
      Nagoya Symposium -Frontiers in Structural Physiology-
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      20130122-20130124
  • [Presentation] Structural analysis of 100S ribosomes in two different types of bacteria.2013

    • Author(s)
      Kato, T
    • Organizer
      Nagoya Symposium -Frontiers in Structural Physiology-
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      20130122-20130124
  • [Presentation] 低温電子顕微鏡による細菌べん毛キャップ連結部複合体の3次元像再構成

    • Author(s)
      牧野文信
    • Organizer
      第9回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      長浜ロイヤルホテル(滋賀県)
  • [Presentation] Elucidation of the directional switching mechanism of the bacterial flagellar motor.

    • Author(s)
      Miyata, T.
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Presentation] Structure and domain movement of FliD cap from Cryo-EM map of cap-junction complex.

    • Author(s)
      牧野文信
    • Organizer
      2012年度べん毛研究交流会
    • Place of Presentation
      よろこびの宿 しん喜(群馬県)
  • [Presentation] Differences between the Salmonella typhimurium FljB and FliC flagellar filament structures.

    • Author(s)
      當間頌子
    • Organizer
      2012年度べん毛研究交流会
    • Place of Presentation
      よろこびの宿 しん喜(群馬県)
  • [Presentation] The structure of the flagellar cap-junction complex by electron cryomicroscopy.

    • Author(s)
      Makino, F.
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Presentation] Survival strategy of bacteria under the starvation stress by 100S ribosome formation.

    • Author(s)
      Kato, T.
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Presentation] バクテリアには二つのタイプの100Sリボソームが存在する

    • Author(s)
      上田雅美
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡県)
  • [Presentation] 飢餓的ストレス条件下における細菌の生存戦略.

    • Author(s)
      加藤貴之
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡県)

URL: 

Published: 2014-07-24  

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