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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Deepening and new development of mathematical study on cell adhesion

Research Project

Project/Area Number 20H01823
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionRyukoku University

Principal Investigator

村川 秀樹  龍谷大学, 先端理工学部, 准教授 (40432116)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 野津 裕史  金沢大学, 数物科学系, 教授 (00588783)
佐藤 純  金沢大学, 新学術創成研究機構, 教授 (30345235)
富樫 英  神戸大学, 医学研究科, 助教 (90415240)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2025-03-31
Keywords応用数学 / 数値解析学 / 数理生物学 / 細胞接着 / 細胞選別
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、大きく4つの研究[研究A]~[研究D]を並行して行っている。2021年度の研究内容は以下のとおりである。
[研究A]昨年度に引き続き、細胞選別現象に対する数理モデルの数値解析及び解析に向けた準備を行った。2成分問題について、その正則化の方法や時間離散スキームの解析方法について研究し、次年度の解析に向けた準備が整った。また、細胞集団モデルの数値的・解析的取り扱いを煩雑にしている非局所移流項を、線形拡散と反応の組み合わせによって表現するための近似について新たな知見が得られ、次年度の解析に向けた下準備を行った。
[研究B]生物の脳の神経細胞はカラム構造と呼ばれる円柱状の構造を作っており、多数のカラムが六角格子状に規則的に並ぶことによって、脳の複雑な処理を可能にしている。カラム構造は脳の機能単位であり、カラム構造形成のメカニズム、カラム配列のメカニズムを理解することは神経科学における重要な研究課題である。昨年度に引き続き、カラム配列のメカニズムの解明に数理モデリングと数値実験の立場から研究した。細胞間の接着・誘因や反発に着目し、数値実験を進めた。
[研究C]昨年度に引き続き、細胞接着力と細胞膜の表面張力の関係について、数理と実験の両側面から研究した。単純な原理のみからなる微視的現象に対する数理モデル及び数値解法を構成した。上皮細胞の形態形成を例に、我々の手法の有用性を確かめた。論文としてまとめ、[研究C]は完遂した。
[研究D]聴覚、視覚、嗅覚などの感覚を司る感覚器官において、センサーの役割を担う細胞とそれを支える支持細胞は互い違いに並んだ構造をしている。初年度の研究において、この構造の形成メカニズムに差次界面張力仮説による説明が有効であることが示唆された。今年度は、界面張力と接着・収縮・硬さ・内圧等との関係性について実験と数値実験の観点から調査した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の研究計画通りに順調に遂行しているため。

Strategy for Future Research Activity

研究は当初の研究計画通りに順調に進んでいる。2022年度も交付申請書に記載した研究実施計画通りに、研究を進める。

  • Research Products

    (20 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 5 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Oxford(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Oxford
  • [Int'l Joint Research] Technical University Dresden(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Technical University Dresden
  • [Int'l Joint Research] University of the Philippines Diliman(フィリピン)

    • Country Name
      PHILIPPINES
    • Counterpart Institution
      University of the Philippines Diliman
  • [Journal Article] A numerical algorithm for modeling cellular rearrangements in tissue morphogenesis2022

    • Author(s)
      Rhudaina Z Mohammad, Hideki Murakawa, Karel Svadlenka, Hideru Togashi
    • Journal Title

      Communications biology

      Volume: 5(1) Pages: 239

    • DOI

      10.1142/S0218202520500487

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 細胞選別の数理モデル : ミクロ的視点とマクロ的視点2021

    • Author(s)
      村川 秀樹
    • Journal Title

      数理科学

      Volume: 59(9) Pages: 30-36

  • [Journal Article] Intracellular trafficking of Notch orchestrates temporal dynamics of Notch activity in the fly brain2021

    • Author(s)
      Wang, M., Han, X., Liu, C., Takayama, R., Yasugi, T., Ei, S., Nagayama, M., Tanaka, Y. and Sato, M.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 2083

    • DOI

      10.1038/s41467-021-22442-3

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Glial insulin regulates cooperative or antagonistic Golden goal/Flamingo interactions during photoreceptor axon guidance2021

    • Author(s)
      Takechi, H., Hakeda-Suzuki, S., Nitta, Y., Ishiwata, Y., Iwanaga, R., Sato, M., Sugie, A. and Suzuki, T.
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 10 Pages: e66718

    • DOI

      10.7554/eLife.66718

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Second-order finite difference approximations of the upper-convected time derivative2021

    • Author(s)
      D.O. Medeiros, H. Notsu, C.M. Oishi
    • Journal Title

      SIAM Journal on Numerical Analysis

      Volume: 59 Pages: 2955-2988

    • DOI

      10.1137/20M1364990

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Twin vortex computer in fluid flow2021

    • Author(s)
      K. Goto, K. Nakajima, H. Notsu
    • Journal Title

      New Journal of Physics

      Volume: 23 Pages: 063051

    • DOI

      10.1088/1367-2630/ac024d

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 「市松模様を作る細胞」実験生物学と理論のDUOトーク2022

    • Author(s)
      村川秀樹
    • Organizer
      生物多様性コロキウム (MACS共催)
    • Invited
  • [Presentation] 細胞間接着の数理モデリング とその応用2021

    • Author(s)
      村川秀樹
    • Organizer
      複雑系知能セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Micro-and macroscopic models for cell sorting2021

    • Author(s)
      村川秀樹
    • Organizer
      CREST 「現代の数理科学と連携するモデリング手法の構築」 成果報告公開シンポジウム 2021
  • [Presentation] 細胞選別の数理モデル:ミクロ的視点とマクロ的視点2021

    • Author(s)
      村川秀樹
    • Organizer
      2021年度 日本数理生物学会年会
  • [Presentation] Mathematical models of cell sorting: micro- and macroscopic perspectives2021

    • Author(s)
      H. Murakawa
    • Organizer
      54th Annual Meeting of Japan Society of Developmental Biologists
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Tiling mechanisms of the compound eye through geometrical tessellation2021

    • Author(s)
      M. Sato
    • Organizer
      The 51st NIPS International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Dscam1 regulates column formation through lineage-dependent repulsion 13th GfE school2021

    • Author(s)
      M. Sato
    • Organizer
      Stem cells, development, and regeneration: the emergence of new tissues
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Tiling mechanisms of the compound eye through geometrical tessellation2021

    • Author(s)
      M. Sato
    • Organizer
      RIMS Workshop, Mathematical Mechanobiology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Twin vortex computer in fluid flow2021

    • Author(s)
      H. Notsu, K. Goto, K. Nakajima
    • Organizer
      International Conference: Differential Equations for Data Science 2021 (DEDS2021)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 感覚器における『市松模様』の細胞パターンを制御する分子機構2021

    • Author(s)
      富樫英
    • Organizer
      京都大学理学研究科 生物多様性コロキウム
    • Invited
  • [Presentation] 細胞パターン形成における細胞間相互作用と接着分子のダイナミクス2021

    • Author(s)
      富樫英
    • Organizer
      第73回 日本細胞生物学会大会
    • Invited

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Published: 2023-12-25  

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