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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Deepening and new development of mathematical study on cell adhesion

Research Project

Project/Area Number 20H01823
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionRyukoku University

Principal Investigator

村川 秀樹  龍谷大学, 先端理工学部, 教授 (40432116)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 野津 裕史  金沢大学, 数物科学系, 教授 (00588783)
佐藤 純  金沢大学, 新学術創成研究機構, 教授 (30345235)
富樫 英  神戸大学, 医学研究科, 助教 (90415240)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2025-03-31
Keywords応用数学 / 数値解析学 / 数理生物学 / 細胞接着 / 細胞選別
Outline of Annual Research Achievements

細胞接着及び細胞選別現象について、数十万から数百万の細胞数からなる組織レベルの巨視的現象、数十から数百程度の細胞数からなる細胞レベルの微視的現象の双方について研究を行っている。微視的現象の数理モデリング研究については、前年度までに完遂しており、本年度は、その応用について検討を進めた。巨視的現象に対する研究については次のようにいくつかの進展があった。
1) 細胞選別現象に対する数理モデルを簡略化した2成分偏微分方程式系について時間離散化を行い、その時間離散スキームについての解析を進めた。
2) 細胞接着に基づく細胞選別現象は、細胞同士の直接の接触に起因する走性、いわば走触性によって引き起こされる。細胞接着に対する細胞集団モデルでは、非局所移流項によって走触性が表現されている。一方で、細胞が産生する化学物質を介して他の細胞とコンタクトを取り、適切な場所に移動する細胞の性質は走化性と呼ばれる。これは、局所的な偏微分方程式によって記述される。走触性現象と走化性現象には、相違点もあれば、共通点もある。これらの相違点や共通点を数理的に解析することにより、現象の数理的構造の解明に近づくことができる。本年度は、この共通点についての解析を進めるために、簡略化した問題を空間1次元において考察し、解析的結果を得た。簡略化しない問題及び空間多次元問題の解析についても検討を行った。
3) 生物の脳の神経細胞はカラム構造と呼ばれる円柱状の構造を作っており、多数のカラムが六角格子状に規則的に並ぶことによって、脳の複雑な処理を可能にしている。カラム構造は脳の機能単位であり、カラム構造形成のメカニズム、カラム配列のメカニズムを理解することは神経科学における重要な研究課題である。昨年度に引き続き、カラム配列のメカニズムの解明に数理モデリングと数値実験の立場から研究した。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (39 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (30 results) (of which Int'l Joint Research: 15 results,  Invited: 22 results) Funded Workshop (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Oxford(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Oxford
  • [Int'l Joint Research] Technical University Dresden(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Technical University Dresden
  • [Int'l Joint Research] University of Lyon(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      University of Lyon
  • [Journal Article] An energy estimate and a stabilized Lagrange-Galerkin scheme for a multiphase flow model2024

    • Author(s)
      A. Rudiawan, A. Zak, M. Benes, M. Kimura, H. Notsu
    • Journal Title

      Applied Mathematics Letters

      Volume: 153 Pages: 109059

    • DOI

      10.1016/j.aml.2024.109059

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] From soap bubbles to multicellular organisms: Unraveling the role of cell adhesion and physical constraints in tile pattern formation and tissue morphogenesis2024

    • Author(s)
      Hideru Togashi, Steven Ray Davis, Makoto Sato
    • Journal Title

      Developmental Biology

      Volume: 506 Pages: 1ー6

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2023.11.007

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Numerical solution to a free boundary problem for the Stokes equation using the coupled complex boundary method in shape optimization settings2023

    • Author(s)
      J.F.T. Rabago, H. Notsu
    • Journal Title

      Applied Mathematics and Optimization

      Volume: 89 Pages: 2

    • DOI

      10.1007/s00245-023-10065-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ハエからヒトまで共通する神経回路形成機構2023

    • Author(s)
      佐藤 純
    • Journal Title

      Clinical Neuroscience

      Volume: 12 Pages: 1556-1561

  • [Presentation] Relationship between haptotaxis and chemotaxis in cell sorting phenomena2024

    • Author(s)
      H. Murakawa
    • Organizer
      MATRIX-RIMS Tandem Workshop: Evolutionary Partial Differential Equations and Applications
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞選別の数理: 走触性と走化性の関係2024

    • Author(s)
      村川 秀樹
    • Organizer
      非線形現象の数値シミュレーションと解析2024
    • Invited
  • [Presentation] A Keller-Segel type approximation to a population dynamics model of cell-cell adhesion2024

    • Author(s)
      H. Murakawa
    • Organizer
      Reaction Diffusion Equations and Nonlinear Dispersive Equations
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Stabilized Lagrange-Galerkin schemes for viscous and viscoelastic flow problems2024

    • Author(s)
      H. Notsu
    • Organizer
      Computational Mathematics and Applications Seminar (Mathematical Institute, University of Oxford, UK)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 混相流モデルのための有限要素スキーム2024

    • Author(s)
      A. N. F. Rudiawan, A. Zak, M. Benes, 木村正人, 野津裕史
    • Organizer
      日本数学会(大阪公立大学)
  • [Presentation] 物理系の微分方程式を用いたリザバー計算2024

    • Author(s)
      野津裕史
    • Organizer
      AI・データ利活用研究会 第64回
    • Invited
  • [Presentation] Intrinsically disordered regions (IDR) of Afadin regulate junctional compartment formation and positioning of adherens junctions.2024

    • Author(s)
      Hideru Togashi
    • Organizer
      JST PRESTO International Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Unraveling the Dynamics of Cellular Patterning in Animal Tissues: Insights from Self-Organizing Principles2024

    • Author(s)
      Hideru Togashi
    • Organizer
      Institute of Physics, Academia Sinica, Taipei
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞選別現象における走触性と走化性の関係2023

    • Author(s)
      村川秀樹
    • Organizer
      第3回はこだて現象数理研究集会
    • Invited
  • [Presentation] A Keller-Segel type approximation to a cell population dynamics model2023

    • Author(s)
      H. Murakawa
    • Organizer
      10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A Keller-Segel type approximation to a nonlocal cell population model2023

    • Author(s)
      H. Murakawa
    • Organizer
      Topics on Neuroscience, Collective Migration and Parameter Estimation
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 多細胞集団の運動を記述する数理モデルに対する近似2023

    • Author(s)
      村川秀樹
    • Organizer
      反応拡散系パターンダイナミクスの新展開
    • Invited
  • [Presentation] Discretization of a model governing the motion of two cell populations2023

    • Author(s)
      H. Murakawa
    • Organizer
      The 13th AIMS Conference on Dynamical Systems
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A mass-preserving two-step Lagrange-Galerkin scheme for convection-diffusion problems2023

    • Author(s)
      H. Notsu
    • Organizer
      Seminar on Partial Differential Equations (Institute of Mathematics, Czech Academy of Sciences, Prague)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Reservoir computing with fluid flows2023

    • Author(s)
      H. Notsu, K. Goto, K. Nakajima
    • Organizer
      Advances in Computational Mechanics (ACM 2023, The University of Texas at Austin, Austin, Texas, US)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A Lagrangian moving mesh method2023

    • Author(s)
      H. Notsu
    • Organizer
      Biwako Workshop on Mathematical Biology (Shiga, Japan)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 粘弾性流体の数値シミュレーション2023

    • Author(s)
      野津裕史
    • Organizer
      二軸押出研究会
    • Invited
  • [Presentation] 粘弾性流体の数値シミュレーション2023

    • Author(s)
      野津裕史
    • Organizer
      自己組織化セミナー in 金沢
    • Invited
  • [Presentation] 流れを用いたバーチャル物理リザバー計算2023

    • Author(s)
      野津裕史
    • Organizer
      複雑系知能セミナー(公立はこだて未来大学)
    • Invited
  • [Presentation] A total design of finite element schemes for flow problems2023

    • Author(s)
      H. Notsu
    • Organizer
      北大 MMC セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 反応拡散モデルと遺伝学実験を組み合わせた多細胞パターン形成機構の解明2023

    • Author(s)
      佐藤純
    • Organizer
      反応拡散系パターンダイナミクスの新展開
  • [Presentation] Lineage Dependent Column Formation in the fly brain2023

    • Author(s)
      Makoto Sato
    • Organizer
      Biwako Workshop on Mathematical Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 神経系のタイリング機構2023

    • Author(s)
      佐藤純
    • Organizer
      脳神経回路の形成・動作と制御の現在と未来
  • [Presentation] Tiling mechanisms of the compound eye through geometrical tessellation2023

    • Author(s)
      Makoto Sato
    • Organizer
      Mathematical Biology from genes to cells to humans
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Tiling in the nervous system2023

    • Author(s)
      佐藤純
    • Organizer
      第13回分子高次機能研究会
  • [Presentation] 視覚システムの統合機構の解明2023

    • Author(s)
      佐藤純
    • Organizer
      数学と脳科学の連携に向けたワークショップ
  • [Presentation] Cell-cell communications that control column formation in the fly brain2023

    • Author(s)
      Makoto Sato
    • Organizer
      The 3rd Asia Pacific Drosophila Neurobiology Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 数理科学を駆動力とした神経発生研究2023

    • Author(s)
      佐藤純
    • Organizer
      第17回神経発生討論会/第20回成体脳のニューロン新生懇談会 合同大会
  • [Presentation] The Mosaic Pattern of Sensory Epithelium is Essential for Sensory Function2023

    • Author(s)
      Hideru Togashi
    • Organizer
      Biwako workshop on mathematical biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 接着の偏在によるモザイク形成メカニズム2023

    • Author(s)
      富樫英
    • Organizer
      第7回さきがけ「多細胞」領域会議
    • Invited
  • [Funded Workshop] Biwako Workshop on Mathematical Biology2023

  • [Funded Workshop] RIMS Conference「Multidisciplinary Research on Nonlinear Phenomena: Modeling, Analysis and Applications」2023

URL: 

Published: 2024-12-25  

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