• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

Chromatin remodeling mechanism coupled with DNA damage response

Research Project

Project/Area Number 22H02546
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

小布施 力史  大阪大学, 大学院理学研究科, 教授 (00273855)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywordsヘテロクロマチン / DNA損傷応答 / クロモセンター
Outline of Annual Research Achievements

DNAに損傷が起こると、損傷領域周辺のクロマチンがオープンな構造に再編され、修復因子複合体の形成を促進し、修復が終了したのちには元 のクロマチン構造に戻すというモデルが提唱され、その現象やメカニズムの一端が明らかにされつつある。しかしながら、損傷チェックポイントの下流において、クロマチンリモデリング複合体がどのようなしくみでチェックポイントや損傷部位・修復反応と連携しているのか不明な点が多い。本課題は、私たちが見出した新規ヘテロクロマチン因子とクロマチンリモデリング複合体との相互作用の機能が、修復反応のどのステップで、どのように働きかけているのか明らかにすることを目的としている。
マウス細胞がもつ巨大なヘテロクロマチン領域(クロモセンター)にAHDC1は局在する。本年度は、クロモセンターにおけるDNA損傷修復について、解析を行う系の樹立を試みた。クロモセンターはセントロメア近傍の巨大な繰り返し配列(メジャーサテライト)に形成されることが知られている。メジャーサテライト特異的にDNA2本鎖切断を導入するために、CRISPR-Cas9を安定に発現する細胞を樹立した。この細胞に、メジャーサテライトに対するガイドRNA発現プラスミドを導入することにより、クロモセンター特異的に二本鎖切断が導入されていることがgamma-H2AXのシグナルにより確認された。また、CRISPR-Cas9を安定に発現する細胞に対して、AHDC1を欠失した細胞株を樹立することに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度の成果として、マウスNIH3T3細胞において、巨大なヘテロクロマチン領域であるクロモセンター特異的に2本左切断を導入することができる細胞を樹立することができた。また、この細胞においてAHDC1を欠失した株を樹立することができた。これらの細胞株は、AHDC1のヘテロクロマチン領域での損傷応答にける機能を調べるために大変有用であるため。

Strategy for Future Research Activity

今回立ち上げた、マウスNIH3T3細胞において、巨大なヘテロクロマチン領域であるクロモセンター特異的に2本鎖切断を導入することができる細胞株、この細胞を親株にAHDC1を欠失した細胞株を用いて、AHDC1が発現していない細胞におけるDNA損傷に対する影響を調べることが可能となった。また、それを踏まえて、前年度までに用意したクロマチンリモデリング因子との相互作用が著しく減退した変異AHDC1をAHDC1を欠失した細胞株に戻して解析することにより、AHDC1とクロマチンリモデリング因子との相互作用の意義を解明する。

  • Research Products

    (8 results)

All 2024 2023

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Structural evidence for protein-protein interaction between the non-canonical methyl-CpG-binding domain of SETDB proteins and C11orf462024

    • Author(s)
      Mahana Yutaka、Ariyoshi Mariko、Nozawa Ryu-Suke、Shibata Sachiko、Nagao Koji、Obuse Chikashi、Shirakawa Masahiro
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 32 Pages: 304~315.e5

    • DOI

      10.1016/j.str.2023.12.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional domains of nuclear long noncoding RNAs: Insights into gene regulation and intracellular architecture2023

    • Author(s)
      Obuse Chikashi、Hirose Tetsuro
    • Journal Title

      Current Opinion in Cell Biology

      Volume: 85 Pages: 102250~102250

    • DOI

      10.1016/j.ceb.2023.102250

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Replication dynamics identifies the folding principles of the inactive X chromosome2023

    • Author(s)
      Poonperm Rawin、Ichihara Saya、Miura Hisashi、Tanigawa Akie、Nagao Koji、Obuse Chikashi、Sado Takashi、Hiratani Ichiro
    • Journal Title

      Nature Structural & Molecular Biology

      Volume: 30 Pages: 1224~1237

    • DOI

      10.1038/s41594-023-01052-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dominant-negative variants in CBX1 cause a neurodevelopmental disorder2023

    • Author(s)
      Kuroda Yukiko、Iwata-Otsubo Aiko、Dias Kerith-Rae、他30名、Obuse Chikashi、Roscioli Tony、Izumi Kosuke
    • Journal Title

      Genetics in Medicine

      Volume: 25 Pages: 100861~100861

    • DOI

      10.1016/j.gim.2023.100861

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inner nuclear membrane proteins Lem2 and Bqt4 interact with different lipid synthesis enzymes in fission yeast2023

    • Author(s)
      Hirano Yasuhiro、Kinugasa Yasuha、Kubota Yoshino、Obuse Chikashi、Haraguchi Tokuko、Hiraoka Yasushi
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 174 Pages: 33~46

    • DOI

      10.1093/jb/mvad017

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] RNA polymerase II リン酸化は、転写と共役したヌクレオソーム再構築を促進してエピジェネ ティックな遺伝子発現不均質性を抑制する2023

    • Author(s)
      梶谷卓也、加藤太陽、木村宏、 大川恭行、小布施力史、沖昌也、Damien Hermand、John Lis、村上洋太
    • Organizer
      第46回 IMBSJ 日本の子 子生物年会
  • [Presentation] 分裂酵母の核膜孔複合体における Sec13 の機能2023

    • Author(s)
      淺川東彦、大槻千鶴 、長尾恒治、信藤知子、深川竜郎、 小布施力史、平岡 泰、原口徳子
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム 第56 回 研究報告会
  • [Presentation] 分裂酵母における BioID 法の最適化と有効性評価2023

    • Author(s)
      山田紗矢、山本孝治、川上 慶、西野耕平、小迫英尊、 小布施力史、田中克典
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム 第56 回 研究報告会

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi