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2023 Fiscal Year Annual Research Report

希少遺伝子疾患の新規遺伝子同定と治療戦略を見据えた病態解析

Research Project

Project/Area Number 22H03047
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionNational Center for Global Health and Medicine

Principal Investigator

三宅 紀子  国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, 疾患ゲノム研究部 部長 (40523494)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywords網羅的ゲノム解析 / 病的バリアント / 単一遺伝子疾患
Outline of Annual Research Achievements

希少遺伝性疾患の症例収集については、協力医療機関も増え国内外の10施設からの検体提供が得られており昨年度1年間で86症例(患者のみで)を新規にリクルートすることができた。発端者を対象に、主に全エクソーム解析を行い、必要に応じて全ゲノム解析やRNA-Sequencingを行った。それらの解析パイプラインも最新のアノテーションの付加や、コピー数解析、ホモ接合性領域検出ができるよう解析フローも改良した。
解析症例の中から、繰り返す感染症を呈する兄弟例の解析により新規の疾患遺伝子候補を同定した。分子特性に応じた機能解析を行い、新規の発症メカニズムを解明し、現在論文投稿中である。また、今までKDM4B遺伝子のヘテロ接合性バリアントにより表現型が多様な知的障害が起こることが報告されていたが、我々は両アレル性KDM4Bバリアントにより症候性知的障害が起こることを世界で初めて報告した(Takada et al., Human phenotype caused by biallelic KDM4B frameshift variant. Clin Genet. 2024 Jan;105(1):72-76)。
その外にも世界でまだ数例しか報告されていない新規の希少遺伝子疾患の病的バリアントを同定し、現在3報の論文を投稿・作成中である。また、他施設との共同研究として、新規のX連鎖性症候性知的障害(Am J Hum Genet. 2024 Mar 7;111(3):487-508)、新規の脊椎骨端異形成症(Am J Hum Genet. 2023 Jul 6;110(7):1068-1085.)などを報告した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定数よりも多い症例数の集積があり、順次網羅的ゲノム解析を進められている。また少しずつ協力医療機関を増やすことができており、今後も症例集積が期待できる。

Strategy for Future Research Activity

現在行っている症例収集・網羅的ゲノム解析を継続し、新規疾患遺伝子候補に関しては積極的に機能解析、国際共同研究を進め、新規疾患遺伝子の同定および病態解明を行う。既知の疾患遺伝子のバリアントであっても、新規のバリアントや臨床症状に特徴がある症例に等に関しては、科学的に新しい知見がある場合には積極的に発表する。国内外での発表を積極的に行い、多施設共同研究を進める。

  • Research Products

    (15 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 6 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] Washington University School of Medicine/University of Southern California/Medical College of Wisconsin(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Washington University School of Medicine/University of Southern California/Medical College of Wisconsin
    • # of Other Institutions
      5
  • [Int'l Joint Research] Chungnam National University(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      Chungnam National University
  • [Int'l Joint Research] Murdoch Children's Research Institute/Monash University/The University of Adelaide(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      Murdoch Children's Research Institute/Monash University/The University of Adelaide
  • [Int'l Joint Research] Hospital de Puerto Montt/Universidad San Sebastian(チリ)

    • Country Name
      CHILE
    • Counterpart Institution
      Hospital de Puerto Montt/Universidad San Sebastian
  • [Int'l Joint Research] Manchester University/University of Oxford(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Manchester University/University of Oxford
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      4
  • [Journal Article] Variants in ZFX are associated with an X-linked neurodevelopmental disorder with recurrent facial gestalt2024

    • Author(s)
      Shepherdson James L.、Hutchison Katie、Don Dilan Wellalage、others、Matsumoto Naomichi、McCarrier Julie、McCarthy Josephine、Miyake Noriko、Moey Lip Hen、others, Shinawi Marwan
    • Journal Title

      The American Journal of Human Genetics

      Volume: 111 Pages: 487~508

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2024.01.007

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Human phenotype caused by biallelic <i>KDM4B</i> frameshift variant2023

    • Author(s)
      Takada Sanami、Silva Sebastian、Zamorano Ivonne、Perez Andrea、Iwabuchi Chisato、Miyake Noriko
    • Journal Title

      Clinical Genetics

      Volume: 105 Pages: 72~76

    • DOI

      10.1111/cge.14409

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mastocytosis in a Case of Noonan Syndrome Caused by a De Novo Pathogenic &lt;i&gt;CBL&lt;/i&gt; Variant2023

    • Author(s)
      Kawaguchi Tatsuya、Okanishi Tohru、Okazaki Tetsuya、Aoki Chisako、Kasagi Noriko、Adachi Kaori、Yoshida Yuichi、Miyake Noriko、Matsumoto Naomichi、Maegaki Yoshihiro
    • Journal Title

      Yonago Acta Medica

      Volume: 66 Pages: 463~466

    • DOI

      10.33160/yam.2023.11.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Craniosynostosis in molecularly diagnosed <scp>Kabuki</scp> syndrome: Prevalence and clinical implications2023

    • Author(s)
      Nishi Eriko、Miyake Noriko、Kawamura Rie、Hosoki Kana、Hasegawa Yuiko、Matsumoto Naomichi、Okamoto Nobuhiko
    • Journal Title

      American Journal of Medical Genetics Part A

      Volume: 194 Pages: 268~278

    • DOI

      10.1002/ajmg.a.63424

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detailed Courses and Pathological Findings of Colonic Perforation without Diverticula in Sisters with Musculocontractural Ehlers?Danlos Syndrome Caused by Pathogenic Variant in CHST14 (mcEDS-CHST14)2023

    • Author(s)
      Kobayashi Tomoko、Fujishima Fumiyoshi、Tokodai Kazuaki、Sato Chiaki、Kamei Takashi、Miyake Noriko、Matsumoto Naomichi、Kosho Tomoki
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 14 Pages: 1079~1079

    • DOI

      10.3390/genes14051079

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Null and missense mutations of ERI1 cause a recessive phenotypic dichotomy in humans2023

    • Author(s)
      Guo Long、Salian Smrithi、Xue Jing-yi、Rath Nicola、Rousseau Justine、Kim Hyunyun、Ehresmann Sophie、Moosa Shahida、Nakagawa Norio、Kuroda Hiroshi、others、Miyake Noriko、Matsumoto Naomichi、others、Ikegawa Shiro、Campeau Philippe M.
    • Journal Title

      The American Journal of Human Genetics

      Volume: 110 Pages: 1068~1085

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2023.06.001

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genotype-phenotype correlation in human monogenic diseases2023

    • Author(s)
      Noriko Miyake
    • Organizer
      JSUOG Fetal Ultrasound Advanced Training Course
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ゲノム解析最前線:ここまで診断できる小児神経疾患2023

    • Author(s)
      三宅紀子
    • Organizer
      第 65 回日本小児神経学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 希少単一遺伝子疾患の 疾患遺伝子同定と病態解明2023

    • Author(s)
      三宅紀子
    • Organizer
      第217回日本小児科学会長崎地方会
    • Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

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