2022 Fiscal Year Annual Research Report
Investigation of development mechanism and preemptive medicine for IDH-mutant glioma based on genomic analysis of normal brain tissues
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22H03186
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
荒川 芳輝 京都大学, 医学研究科, 講師 (20378649)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
垣内 伸之 京都大学, 白眉センター, 特定准教授 (90839721)
中川 正宏 京都大学, 医学研究科, 特定准教授 (10431850)
棗田 学 新潟大学, 脳研究所, 助教 (00515728)
土井 大輔 京都大学, iPS細胞研究所, 特定拠点講師 (10587851)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2026-03-31
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| Keywords | グリオーマ / 正常脳 / IDH変異型クローン / 先制医療 / 3次元的網羅的ゲノム解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
グリオーマは、腫瘍内多様性のために、単一の細胞内シグナルを標的とする薬剤では治癒困難である。そこで、グリオーマ発生前の早期診断、早期予防治療の開発が必要である。IDH変異型グリオーマでは、IDHがドライバー遺伝子である。正常脳組織、特に若年の正常脳組織においてIDH変異を有するクローンの存在や発生部位、IDH変異を有するクローンが乏突起膠腫、星細胞腫へと異なったクローン拡大に至る分子基盤は明らかとなっていない。そこで、本研究では、正常脳組織のゲノム解析によるIDH変異型グリオーマ発生の分子基盤を解明し、先制医療を開発することを目的とした。デジタルPCRでIDH変異を同定した新潟大学脳研究所所蔵の正常脳組織を用いてIDH変異の免疫染色解析を行い、IDH変異クローンの局在の同定を試みた。しかし、明らかなIDH変異クローンの集積する部位は確認できなかった。そこで、新たに微少検体から少数クローンの存在を同定するディープシークエンス法の開発を行った。今後、ディープシークエンス法による少数の遺伝子変異クローンの同定を進める。IDH変異型グリオーマとその周囲正常脳組織を用いて単一細胞RNA/DNA同時解析を行ったが、IDH変異型グリオーマ周囲の正常脳に存在するIDH変異クローンは、腫瘍と同様の変異を有することから、同じ腫瘍クローンの浸潤であることが確定した。iPS細胞で作成した大脳オルガノイドの樹立のためにhuman induced pluripotent stem（iPS）細胞にIDH1変異を導入するためのベクターを開発した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
デジタルPCRでIDH変異を同定した新潟大学脳研究所所蔵の正常脳組織を用いてIDH変異の免疫染色解析を行ったが、IDH変異クローンの局在が確認できなかったため、新たな解析手法を開発する必要があったため。
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| Strategy for Future Research Activity |
新たに微少検体から少数クローンの存在を同定するディープシークエンス法の開発を行った。今後、ディープシークエンス法による少数の遺伝子変異クローンの同定を進める。
IDH1変異を導入したhuman induced pluripotent stem（iPS）細胞を樹立する。
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Research Products
(11 results)
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[Journal Article] A novel <i>SREBF1::NACC1</i> gene fusion in an unclassifiable intracranial tumour2022
Author(s)
Takeuchi Yasuhide、Mineharu Yohei、Arakawa Yoshiki、Hara Masayuki、Oichi Yuki、Kamata Takahiko、Fukuyama Keita、Yamamoto Yoshihiro、Yamanaka Toshiyuki、Kakiuchi Nobuyuki、Hiratomo Emi、Hirata Masahiro、Yokoo Hideaki、Hirose Takanori、Minamiguchi Sachiko、Ogawa Seishi、Muto Manabu、Miyamoto Susumu、Haga Hironori
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Journal Title
Neuropathology and Applied Neurobiology
Volume: 48
Pages: 1～7
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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