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2014 Fiscal Year Annual Research Report

細胞外電子移動を基軸とした生体電子移動論の開拓

Research Project

Project/Area Number 24000010
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

橋本 和仁  東京大学, 大学院工学系研究科, 教授 (00172859)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中村 龍平  理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (10447419)
中西 周次  東京大学, 大学院工学系研究科, 准教授 (40333447)
Project Period (FY) 2012-05-29 – 2017-03-31
Keywords細胞外電子移動 / 代謝経路制御 / 微生物エネルギー変換 / 生体電子移動ダイナミクス / 電気化学的制御 / 微生物腐食 / 集団同期能現象 / 光合成細菌
Outline of Annual Research Achievements

研究課題1-細胞内電子伝達経路の電極電位制御
電極呼吸するGeobacter菌の網羅的代謝解析を行った結果、炭素代謝経路が電極電位依存的に大きく切り替わることが示された。また、これまでに開発してきた生体親和型電子伝達ポリマーを改良し、酵母(真核生物)の代謝の電気化学制御に新たに成功した。さらに、光合成細菌の電気化学的代謝制御に関する研究も継続して行い、Euglenaにおいて電気化学的に制御された細胞外電子移動により強光阻害を緩和することができることを明らかにした。
研究課題2-生体内電子移動のダイナミクス追跡
光によるCO軸配位子交換反応を用い、鉄酸化細菌Acidithiobacillusの電気化学的炭素固定経路の追跡を試みた。その結果、Acidithiobacillusが電極から電子を獲得しCO2固定を行う能力を有すること、その際の電子伝達系がaa3複合タンパク質を介した鉄酸化代謝経路と類似していることが示された。
研究課題3-細胞間情報伝達による集団同期能現象
微生物の集団同期能に関与するシグナル分子の単離・同定において、単一物質とみられるサンプルを得て解析を進めたところ、当初の予想に反し当該サンプルに複数の物質が含まれることが判明した。研究遂行上この分子を単離・精製することが不可欠であるため、サンプル分離および構造解析の方法について再検討を行い、クロマトグラフィーを用いた分離条件の実験を進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究課題1では、今年度は、昨年度までに光合成細菌で実現してきた細胞内電子伝達経路の電極電位制御法を他の微生物へと展開することを目的として研究を推し進めた。電子伝達ポリマーの分子構造(分子量と組成比)を改良することで、これまでに実現していなかった酵母代謝の電気化学制御を達成し、上記手法の適用範囲を広げることができた。また、酸化還元電位が低い新しい電子伝達ポリマーの合成に成功した。
研究課題2においては、CO2固定能を有する化学独立細菌の生体内電子移動反応のin vivo観測を目的とし研究を推し進めてきた。CO光応答性を有する代謝電流の一部が、ルビスコを介した炭素固定代謝に利用されていることが明らかとなり、化学独立細菌の生体電子移動を計測するための系の構築に成功した。
電流生成菌の集団同期現象の解明を目指す研究課題3に関しては、シグナル分子の分離が予想以上に困難であり時間が掛かっているが、条件検討の確立は着実に進んでいる。それにより、今後のシグナル分子の同定、ひいては新しい細胞間情報伝達機構の解明にむけて、その技術的基盤の構築を進めることができた。

Strategy for Future Research Activity

細胞内電子伝達経路の電極電位制御については、新たに合成した低酸化還元電位の電子伝達ポリマーを用いて微生物への電子注入と、それによる代謝制御に挑戦する。また、電子伝達ポリマーの構造最適化をさらに進め、光合成細菌の代謝のより精密な制御を試みる。
また、生体内電子移動計測においては、外膜タンパク質解析ならびに遺伝子発現解析により電気を一次エネルギー源とした生物学的炭素固定(電気合成代謝)経路の同定を試みる。
集団同期能機構解明においては、未知なるシグナル分子の同定が不可欠であることから、シグナル分子の構造決定を行うため、これまでに確立した大スケール培養実験を進め、分離条件の検討をさらに進めていく。

  • Research Products

    (48 results)

All 2015 2014

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (41 results) (of which Invited: 15 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Light-induced cell aggregation of Euglena gracilis towards economically feasible biofuel production2014

    • Author(s)
      Hideshi Ooka, Takumi Ishii, Kazuhito Hashimoto, Ryuhei Nakamura
    • Journal Title

      RSC Adv.

      Volume: 4 Pages: 20693-20698

    • DOI

      10.1039/c4ra02101k

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cell-secreted Flavins Bound to Membrane Cytochromes Dictate Electron Transfer Reactions to Surfaces with Diverse Charge and pH2014

    • Author(s)
      Akihiro Okamoto, Shafeer Kalathil, Xiao Deng, Kazuhito Hashimoto, Ryuhei Nakamura, Kenneth H. Nealson
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 4 Pages: 5628

    • DOI

      10.1038/srep05628

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bound Flavin Model Suggests Similar Electron-TransferMechanisms in Shewanella and Geobacter2014

    • Author(s)
      Akihiro Okamoto, Ryuhei Nakamura, Kenneth H. Nealson, Kazuhito Hashimoto
    • Journal Title

      ChemElectroChem

      Volume: 1 Pages: 1808-1812

    • DOI

      10.1002/celc.201402151

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of Ionic Strength on the Rate of Extracellular Electron Transport in Shewanella oneidensis MR-1 through Bound-Flavin Semiquinones2014

    • Author(s)
      Shafeer Kalathil, Kazuhito Hashimoto, Akihiro Okamoto
    • Journal Title

      ChemElectroChem

      Volume: 1 Pages: 1840-1843

    • DOI

      10.1002/celc.201402195

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Flavin Redox Bifurcation as a Mechanism for Controlling the Direction of Electron Flow during Extracellular Electron Transfer2014

    • Author(s)
      Akihiro Okamoto, Kazuhito Hashimoto, Kenneth H. Nealson
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 53 Pages: 10988-10991

    • DOI

      10.1002/anie.201407004

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 電気化学的代謝制御による嫌気微生物腐食の制御2015

    • Author(s)
      中村龍平, 岡本章玄, 川市智史, 茂木岳人, 橋本和仁
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス (岡山県岡山市)
    • Year and Date
      2015-03-28
    • Invited
  • [Presentation] プロトン共役する細胞外電子移動2015

    • Author(s)
      岡本章玄, 徳納吉秀, 橋本和仁
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス/薬学部 (千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-27
  • [Presentation] Desulfovibrio ferrophilus strain IS5 Extracts Electrons from Solid Compounds by Outer Membrane c-type Cytochromes2015

    • Author(s)
      Deng Xiao, Akihiro Okamoto, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス/薬学部 (千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-27
  • [Presentation] Shewanella oneidensis MR-1による嫌気アンモニア酸化2015

    • Author(s)
      齋藤淳貴, 岡本章玄, 橋本和仁
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス/薬学部 (千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-27
  • [Presentation] Dark carbon fixation pathway in biocathode of Shewanella oneidensis MR-12015

    • Author(s)
      LA CAVA Eugenio, Akihiro Okamoto, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス/薬学部 (千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-27
  • [Presentation] 生体電子移動論より探る生物進化と自己修復2015

    • Author(s)
      中村龍平
    • Organizer
      日本化学会第95春季大会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス/薬学部 (千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26
    • Invited
  • [Presentation] 生体親和性電子伝達ポリマーを介した細胞外電子移動がもたらす大腸菌の代謝変化2015

    • Author(s)
      石川聖人, 加藤創一郎, 橋本和仁, 中西周次
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス/薬学部 (千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26
  • [Presentation] 人工的な細胞外電子移動による大腸菌呼吸鎖への介入2015

    • Author(s)
      石川聖人, 加藤創一郎, 橋本和仁, 中西周次
    • Organizer
      化学工学会第80年会
    • Place of Presentation
      芝浦工業大学豊洲キャンパス(東京都江東区)
    • Year and Date
      2015-03-21
  • [Presentation] プロトン共役する鉄還元細菌Shewanellaの細胞外電子移動過程2015

    • Author(s)
      岡本章玄, 徳納吉秀, 橋本和仁
    • Organizer
      電気化学会第82回大会
    • Place of Presentation
      横浜国立大学(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2015-03-17
  • [Presentation] 非共有結合性フェノチアジン誘導体反応中心による微生物細胞外電子移動の促進2015

    • Author(s)
      徳納吉秀, 岡本章玄, 橋本和仁
    • Organizer
      電気化学会第82回大会
    • Place of Presentation
      横浜国立大学(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2015-03-17
  • [Presentation] 硫化鉄の電解反応を促す微生物防蝕メカニズム2015

    • Author(s)
      椎橋麻里奈, 岡本章玄, 橋本和仁
    • Organizer
      電気化学会第82回大会
    • Place of Presentation
      横浜国立大学(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2015-03-17
  • [Presentation] In situ光導波路分光を用いた多電子水酸化反応中間体の検出2015

    • Author(s)
      大岡英史, 山口晃, 橋本和仁, 中村龍平
    • Organizer
      電気化学会第82回大会
    • Place of Presentation
      横浜国立大学(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2015-03-17
  • [Presentation] レドックスポリマーによる微細藻類に対する強光阻害緩和/Reducing Photo-inhibition in microbial cellular growth by transmembrane redox-poIymers2014

    • Author(s)
      中西周次, 戸島裕希, 橋本和仁
    • Organizer
      第24回日本MRS年次大会
    • Place of Presentation
      横浜情報文化センター(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-12-12
    • Invited
  • [Presentation] 電気化学から視る微生物と鉱物の相互作用2014

    • Author(s)
      中村龍平
    • Organizer
      微生物腐食分科会
    • Place of Presentation
      中央大学駿河台記念館 (東京都千代田区)
    • Year and Date
      2014-12-05
    • Invited
  • [Presentation] Charge accumulation during oxygen evolution catalysis on iridium oxide and manganese oxide2014

    • Author(s)
      Hideshi OOKA, Akira YAMAGUCHI, Kazuhito HASHIMOTO, Ryuhei NAKAMURA
    • Organizer
      2014 International Conference on Artificial Photosynthesis(ICARP2014)
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県淡路市)
    • Year and Date
      2014-11-26
  • [Presentation] Chemical-Thermal-Electricity Energy Conversion In the Deep Ocean2014

    • Author(s)
      中村龍平
    • Organizer
      The 2nd RIKEN-SJTU Workshop on Energy and Environment
    • Place of Presentation
      理化学研究所(埼玉県和光市)
    • Year and Date
      2014-11-18
    • Invited
  • [Presentation] Euglena gracilis Z に対する電気化学的強光阻害緩和法2014

    • Author(s)
      戸島裕希, 石川聖人, 加藤創一郎, 岡本章玄, 中西周次, 橋本和仁
    • Organizer
      ユーグレナ研究会第30回記念大会
    • Place of Presentation
      東大寺総合文化センター (奈良県奈良市)
    • Year and Date
      2014-11-08
  • [Presentation] 微生物と鉱物を利用した化学・電気・熱エネルギー変換2014

    • Author(s)
      中村龍平
    • Organizer
      日本放線菌学会第56回学術講演会
    • Place of Presentation
      北里研究所(東京都港区)
    • Year and Date
      2014-11-07
    • Invited
  • [Presentation] Electrochemical Suppression for Microbially Influenced Corrosion Under an Anaerobic Condition2014

    • Author(s)
      Akihiro Okamoto, Satoshi Kawaichi, Taketo Mogi, Deng Xiao, Marina Shiihashi, Ryuhei Nakamura, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      環境微生物系合同大会2014
    • Place of Presentation
      アクトシティ浜松コングレスセンター(静岡県浜松市)
    • Year and Date
      2014-10-23
  • [Presentation] Electrolysis of corroded iron FeS2 suppresses anaerobic microbial corrosion promoted by Desulfovibrio vulgaris2014

    • Author(s)
      椎橋麻里奈, 岡本章玄, 橋本和仁
    • Organizer
      環境微生物系合同大会2014
    • Place of Presentation
      アクトシティ浜松コングレスセンター (静岡県浜松市)
    • Year and Date
      2014-10-23
  • [Presentation] 生体親和性電子伝達ポリマーによる微生物代謝の電気化学制御2014

    • Author(s)
      中西周次
    • Organizer
      環境微生物系合同大会2014
    • Place of Presentation
      アクトシティ浜松コングレスセンター(静岡県浜松市)
    • Year and Date
      2014-10-22
    • Invited
  • [Presentation] 好熱性繊維状鉄還元細菌の細胞外電子伝達能および細胞繊維導電性2014

    • Author(s)
      川市智史, 橋本和仁, 中村龍平
    • Organizer
      環境微生物系合同大会2014
    • Place of Presentation
      アクトシティ浜松コングレスセンター(静岡県浜松市)
    • Year and Date
      2014-10-22
  • [Presentation] Electrochemical Regulation of the Cyanobacterial Circadian Oscillation2014

    • Author(s)
      Shuji NAKANISHI, Kazuhito HASHIMOTO
    • Organizer
      2014 ECS and SMEQ Joint International Meeting
    • Place of Presentation
      カンクン(メキシコ)
    • Year and Date
      2014-10-08
    • Invited
  • [Presentation] 電気化学的手法による微細藻類ミドリムシに対する強光阻害緩和2014

    • Author(s)
      戸島裕希, 石川聖人, 加藤創一郎, 岡本章玄, 中西周次, 橋本和仁
    • Organizer
      2014年電気化学秋季大会
    • Place of Presentation
      北海道大学高等教育推進機構(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-27
  • [Presentation] 硫酸還元菌Desulfovibrio ferrophilusの細胞外電子移動追跡2014

    • Author(s)
      Deng Xiao, Akihiro Okamoto, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      2014年電気化学秋季大会
    • Place of Presentation
      北海道大学高等教育推進機構(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-27
  • [Presentation] ペリプラズムpH追跡による細胞外電子移動酵素のプロトン移動能検討 In-vivo periplasmic pH assay for studying proton export by outer membrane cytochromes in extracellular electron transport2014

    • Author(s)
      Yoshihide Tokunou, Akihiro Okamoto, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-26
  • [Presentation] プロトン駆動力を細胞外へと捨てる微生物外膜タンパク質Proton discarded to cell exterior via outer-membrane bound enzyme2014

    • Author(s)
      Akihiro Okamoto, Shafeer Kalathil, Yoshihide Tokunou, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-26
  • [Presentation] Electrolysis of Corrosion Products FeS2 suppresses Anaerobic Microbial Corrosion2014

    • Author(s)
      Marina Shiibashi, Akihiro Okamoto, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      第20回日中知能材料学会(SIEMME'20)
    • Place of Presentation
      成都(中国)
    • Year and Date
      2014-09-22
  • [Presentation] Study for proton export in extracellular electron transport by in-vivo periplasmic pHassay2014

    • Author(s)
      Yoshihide Tokunou, Akihiro Okamoto, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      第20回日中知能材料学会(SIEMME'20)
    • Place of Presentation
      成都(中国)
    • Year and Date
      2014-09-22
  • [Presentation] Extracellular electron transfer process of sulfate-reducing bacteria Desulfovibrio ferrophilus2014

    • Author(s)
      Deng Xiao, Akihiro Okamoto, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      第20回日中知能材料学会(SIEMME'20)
    • Place of Presentation
      成都(中国)
    • Year and Date
      2014-09-22
  • [Presentation] シアノバクテリア概日時計の電気化学的計測2014

    • Author(s)
      中西周次, タンアナンクンポンピトラー, 石川聖人, 加藤創一郎, 橋本和仁
    • Organizer
      第66回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-11
  • [Presentation] Unification of Extracellular Electron Transport Mechanisms in Shewanella and Geobacter Species2014

    • Author(s)
      Akihiro OKAMOTO
    • Organizer
      The 65th Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry
    • Place of Presentation
      ローザンヌ(スイス)
    • Year and Date
      2014-09-02
  • [Presentation] Biocompatible trans-membrane electron mediators for electrochemical regulation of the cyanobacterial circadian clock2014

    • Author(s)
      Shuji NAKANISHI
    • Organizer
      International Union of Materials Research Societies-International Conference in Asia 2014(IUMRS-ICA2014)
    • Place of Presentation
      福岡大学(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2014-08-29
    • Invited
  • [Presentation] Trace amount of cell-secreted flavin dictates extracellular electron transport rate in Shewanella and Geobacter species2014

    • Author(s)
      Akihiro OKAMOTO
    • Organizer
      15th International Symposium on Microbial Ecology(ISEM15)
    • Place of Presentation
      ソウル(韓国)
    • Year and Date
      2014-08-26
    • Invited
  • [Presentation] Electron Transport Mechanisms at Bacterial/Electrode Interface2014

    • Author(s)
      Akihiro OKAMOTO
    • Organizer
      Electrofuel and Biorefinery シンポジウム
    • Place of Presentation
      済州(韓国)
    • Year and Date
      2014-08-25
    • Invited
  • [Presentation] Regulation and Detection of Circadian Clock by Electrochemically-controlled Extracellular Electron Transfer2014

    • Author(s)
      Pornpitra Tunanunkul, KoichiNishio, Yue Lu, Souichiro Kato, Shuji Nakanishi, Kazuhito Hashimoto
    • Organizer
      The 30th Anniversary Meeting Sapporo Symposium on Biological Rhythm
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2014-07-27
  • [Presentation] Electrochemical Regulation of the Cyanobacterial Circadian Oscillation2014

    • Author(s)
      Shuji NAKANISHI
    • Organizer
      Gordon Research Conferences
    • Place of Presentation
      ジローナ(スペイン)
    • Year and Date
      2014-07-13
    • Invited
  • [Presentation] Low-Voltage Electroreduction of CO2 : A Lesson from Geoelectrochemistry in the Seabed2014

    • Author(s)
      中村龍平
    • Organizer
      225th Electrochemical Society Meeting
    • Place of Presentation
      フロリダ(アメリカ)
    • Year and Date
      2014-05-13
    • Invited
  • [Presentation] Microbial Respiration with Iron Minerals : Impacts on Ecosystems and Industry2014

    • Author(s)
      中村龍平
    • Organizer
      The 3rd RIKEN-SNU Workshop on Chemical Biology for Health and Resource Sciences
    • Place of Presentation
      理化学研究所(埼玉県和光市)
    • Year and Date
      2014-04-21
  • [Presentation] Biocompatible trans-membrane electron mediators for electrochemical regulation of the cyanobacterial circadian clock2014

    • Author(s)
      Shuji NAKANISHI
    • Organizer
      International Symposium on Microbial Electrochemistry and its Application in Bio/Mimetic Energy Conversion(ISMEEC2014)
    • Place of Presentation
      北京(中国)
    • Year and Date
      2014-04-12
    • Invited
  • [Presentation] Bound Flavin Cofactor Model Unifies Extracellular Electron Transport Mechanism in Shewanella and Geobacter Species2014

    • Author(s)
      Akihiro OKAMOTO
    • Organizer
      International Symposium on Microbial Electrochemistry and its Application in Bio/Mimetic Energy Conversion (ISMEEC2014)
    • Place of Presentation
      北京(中国)
    • Year and Date
      2014-04-12
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 含窒素化合物含有水の処理方法2014

    • Inventor(s)
      中西周次, 岡本章玄, 橋本和仁, 加藤創一郎, Kakathil, Shafeer, 磯和俊男, 石間智生
    • Industrial Property Rights Holder
      東京大学アクアス株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2014-221438
    • Filing Date
      2014-10-30
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 含窒素化合物含有水の処理装置、および、含窒素化合物含有水の処理方法2014

    • Inventor(s)
      中西周次, 岡本章玄, 橋本和仁, 加藤創一郎, 磯和俊男, 石間智生
    • Industrial Property Rights Holder
      東京大学アクアス株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2014-258428
    • Filing Date
      2014-12-22

URL: 

Published: 2016-06-01  

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