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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Dissection of Mammalian Biological Clock System at a Molecular Level

Research Project

Project/Area Number 24227001
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

深田 吉孝  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (80165258)

Project Period (FY) 2012-10-26 – 2017-03-31
Keywords体内時計 / サーカディアンリズム / シグナル・伝達 / 脳・神経 / 光生物
Outline of Annual Research Achievements

《1》入力系:OPN4新規シグナル経路の二次メッセンジャーを検出するため、これまでに複数の遺伝子改変マウス系統を樹立したが、何れもレポータ遺伝子の発現量が低く、この経路の活性化を検出するには不十分であることが判明した。そこで新たに、アデノ随伴ウィルスと遺伝子改変マウスを組み合わせたCre/loxP組換え系を用いたところ、十分な外来遺伝子発現をipRGCにおいて誘導することができた。
《2》脳機能:海馬依存性の学習後のERK活性化状態を検出したところ、海馬CA1におけるERKの活性化が主観的夜に見られた。これまでの実験結果と合わせると、海馬依存性の記憶の効率は膜ラフト内のSCOP/K-Ras の量に依存し、ERK の活性化を介して決定されることが判明し、記憶効率の概日変動が生まれる分子メカニズムを明らかにすることができた。一方、マウスの不安様行動にも概日変動がみられることを見出し、この変動は扁桃体基底外側部の概日時計がSCOP量の概日変動を介して生み出すことを明らかにした。
《3》分子時計: RNAのA-to-I編集酵素であるADAR2が概日時計によって転写制御され、RNAが時刻依存的にA-to-I編集されていることを見出した。RNA-Seq解析の結果、Adar2欠損マウスにおいては、多数の転写産物で見られたA-to-I RNA編集リズムが停止するだけでなく、多くのRNA量のリズム性も顕著に低下していることが判明した。このような特徴を示す転写産物のde novo転写は一日を通して一定であり、転写後調節によって多くのRNAの量的リズムが生み出されているという新しい概念を提唱することができた。さらに、Adar2欠損マウスは、CRY2の異常蓄積により時計振動が短周期化すると共に、血中の遊離脂肪酸リズムが鈍くなり、高脂肪食の負荷により体重が異常増加することが分かった。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (37 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (25 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Invited: 9 results) Book (3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] マンチェスター大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      マンチェスター大学
  • [Int'l Joint Research] シンガポール国立大学(シンガポール)

    • Country Name
      SINGAPORE
    • Counterpart Institution
      シンガポール国立大学
  • [Journal Article] ADARB1 catalyzes circadian A-to-I editing and regulates RNA rhythm.2017

    • Author(s)
      Hideki Terajima, Hikari Yoshitane, Haruka Ozaki, Yutaka Suzuki, Shigeki Shimba, Shinya Kuroda, Wataru Iwasaki, and Yoshitaka Fukada
    • Journal Title

      Nat. Genet.

      Volume: 49 Pages: 146-151

    • DOI

      10.1038/ng.3731

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 体内時計によるADAR2を介したリズミックなA-to-I RNA編集とRNAリズムの出力制御2017

    • Author(s)
      寺嶋秀騎、深田吉孝
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: - Pages: -

  • [Journal Article] USP7 and TDP-43: Pleiotropic regulation of Cryptochrome protein stability paces the oscillation of the mammalian circadian clock.2016

    • Author(s)
      Arisa Hirano, Tomoki Nakagawa, Hikari Yoshitane, Masaaki Oyama, Hiroko Kozuka-Hata, Darin Lanjakornsiripoan, and Yoshitaka Fukada.
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 11 Pages: e0154263

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0154263

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] SCOP/PHLPP1β in the basolateral amygdala regulates circadian expression of mouse anxiety-like behavior.2016

    • Author(s)
      Jun J. Nakano, Kimiko Shimizu, Shigeki Shimba, Yoshitaka Fukada
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 6 Pages: 33500

    • DOI

      10.1038/srep33500

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] SCOP/PHLPP1β mediates circadian regulation of long-term recongnition memory.2016

    • Author(s)
      Kimiko Shimizu, Yodai Kobayashi, Erika Nakatsuji, Shigeki Shimba, Maya Yamazaki, Kenji Sakimura and Yoshitaka Fukada.
    • Journal Title

      Nat. Commun,

      Volume: 7 Pages: 12926

    • DOI

      10.1038/ncomms12926

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 時計タンパク質の翻訳後修飾による体内時計制御2016

    • Author(s)
      吉種光、深田吉孝
    • Journal Title

      生体の科学

      Volume: 67 Pages: 512-516

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.11477/mf.2425200542

  • [Presentation] Molecular basis in clock genes to control synchronous circadian oscillation2017

    • Author(s)
      Teruya Tamaru, Genki Kawamura, Hikari Yoshitane,Yoshitaka Fukada, Takeaki Ozawa, Ken Takamatsu
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      アクトシティ浜松(静岡県 浜松市)
    • Year and Date
      2017-03-30
    • Invited
  • [Presentation] ADAR2 catalyzes circadian A-to-I editing and regulates RNA rhythm2017

    • Author(s)
      Hikari Yoshitane, Hideki Terajima, Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      アクトシティ浜松(静岡県 浜松市)
    • Year and Date
      2017-03-30
    • Invited
  • [Presentation] Molecular Mechanism of circadian regulation of recognition memory2017

    • Author(s)
      Kimiko Shimizu, Yodai Kobayashi, Erika Nakatsuji, Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      アクトシティ浜松(静岡県 浜松市)
    • Year and Date
      2017-03-30
    • Invited
  • [Presentation] ユビキチン化酵素FBXL3 とFBXL21が概日時計振動を安定に維持する作用機序2017

    • Author(s)
      野辺 加織、吉種 光、深田 吉孝
    • Organizer
      時間生物フォーラム東京2017
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都 文京区)
    • Year and Date
      2017-02-21
  • [Presentation] 細胞のストレス応答は哺乳類の概日時計を制御する2017

    • Author(s)
      今村 聖路、吉種 光、深田 吉孝
    • Organizer
      時間生物フォーラム東京2017
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都 文京区)
    • Year and Date
      2017-02-21
  • [Presentation] 概日時計は細胞ストレスに応答する2016

    • Author(s)
      今村 聖路、吉種 光、服部 一輝、山口 光男、名黒 功、一條 秀憲、深田 吉孝
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-02
  • [Presentation] A-to-I RNA編集酵素は体内時計からの出力リズムの鍵分子である2016

    • Author(s)
      吉種 光、寺嶋 秀騎、尾崎 遼、岩崎 渉、深田 吉孝
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-02
  • [Presentation] ユビキチン化酵素FBXL21によるCRYタンパク質の安定化機構2016

    • Author(s)
      野辺 加織、吉種 光、平野 有沙、深田 吉孝
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-02
  • [Presentation] 長期記憶の概日リズムを生み出す分子メカニズム2016

    • Author(s)
      清水 貴美子、小林 洋大、仲辻 英里香、深田 吉孝
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-01
    • Invited
  • [Presentation] A-to-I RNA編集酵素は体内時計からの出力リズムの鍵分子である2016

    • Author(s)
      吉種 光、寺嶋 秀騎、尾崎 遼、岩崎 渉、深田 吉孝
    • Organizer
      第23回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂 (愛知県 名古屋市)
    • Year and Date
      2016-11-16
  • [Presentation] SCOP-dependent circadian regulation of memory formation for novel object2016

    • Author(s)
      Kimiko Shimizu, Erika Nakatsuji, Yodai Kobayashi, Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      Neuroscience 2016
    • Place of Presentation
      San Diego Convention Center:Halls B-H(USA San Diegoc )
    • Year and Date
      2016-11-16
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] RNA編集酵素ADAR2は概日性エピトランスクリプトームを制御する2016

    • Author(s)
      深田 吉孝
    • Organizer
      第23回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂 (愛知県 名古屋市)
    • Year and Date
      2016-11-13
    • Invited
  • [Presentation] 細胞ストレスと概日時計の分子的連関2016

    • Author(s)
      今村 聖路、吉種 光、服部 一輝、山口 光男、名黒 功、一條 秀憲、深田 吉孝
    • Organizer
      第23回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂 (愛知県 名古屋市)
    • Year and Date
      2016-11-12
  • [Presentation] 出力リズムを担うDBPとE4BP4のDNA結合配列の探索2016

    • Author(s)
      浅野 吉政、吉種 光、尾崎 遼、鈴木 穣、寺嶋 秀騎、岩崎 渉、深田 吉孝
    • Organizer
      第23回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂 (愛知県 名古屋市)
    • Year and Date
      2016-11-12
  • [Presentation] Hippocampal clock-dependent circadian regulation of recognition memory2016

    • Author(s)
      Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      IGER International Symposium on Biological Rhythms
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県 名古屋市)
    • Year and Date
      2016-11-11
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Molecular mechanism of a link between cellular stress and circadian clock2016

    • Author(s)
      Kiyomichi Imamura, Hikari Yoshitane, Kazuki Hattori, Mitsuo Yamaguchi, Isao Naguro, Hidenori Ichijo and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      IGER International Symposium on Biological Rhythms
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県 名古屋市)
    • Year and Date
      2016-11-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] SCOP-mediated circadian regulation of memory formation for novel object2016

    • Author(s)
      Kimiko Shimizu, Erika Nakatsuji, Yodai Kobayashi, Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      15th Annual MCCS Molecular and Cellular Cognition Society Symposium
    • Place of Presentation
      Westin San Diego Gaslamp Quarter(USA San Diego )
    • Year and Date
      2016-11-10
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Circadian rhythms of hippocampus-dependent activities in mice2016

    • Author(s)
      Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      29th Conference of the International Society for Chronobiology
    • Place of Presentation
      Sheraton Suzhou(China Suzhou)
    • Year and Date
      2016-10-25
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Circadian regulation of memory for novel objects in mice2016

    • Author(s)
      Kimiko Shimizu,Yodai Kobayashi, Erika Nakatsuji, Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会in仙台
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県 仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-27
    • Invited
  • [Presentation] 哺乳類の概日時計機構におけるRNA編集酵素の重大な役割2016

    • Author(s)
      吉種 光、寺嶋 秀騎、尾崎 遼、鈴木 穣、岩崎 渉、深田 吉孝
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会in仙台
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県 仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-27
  • [Presentation] Farnesylation of Transducin Plays a Dual Role: High Amplification of Light-Signaling and Suppression of Dark-Noise in Rod Cells2016

    • Author(s)
      Daisuke Kojima, Hidetoshi Kassai, Keisuke Sakurai, Takahiko Matsuda, Toshiyuki Okano, Hiroo Imai, Kazuki Nakao, Kei Nakatani, Yoshinori Shichida, Atsu Aiba Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第38回日本比較生理生化学会 東京大会
    • Place of Presentation
      玉川大学(東京都・町田市)
    • Year and Date
      2016-09-02
  • [Presentation] SCOP mediated circadian regulation of long-term recognition memory2016

    • Author(s)
      Kimiko Shimizu, Yodai Kobayashi, Erika Nakatsuji, Kenji Sakimura, Maya Yamazaki, Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第39回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • Year and Date
      2016-07-21
  • [Presentation] Post-transcriptional modification regulates clock oscillation and extends mRNA rhythms2016

    • Author(s)
      Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      SRBR 2016
    • Place of Presentation
      Palm Harbor (USA Florida)
    • Year and Date
      2016-05-25
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The chondrocyte clock gene Bmal1controls cartilage homeostasis and integrity2016

    • Author(s)
      Michal Dudek, Nicole Gossan, Nan Yang, Hee-Jeong Im, Jayalath Ruckshanthi, Hikari Yoshitane, Xin Li, Yoshitaka Fukada, Ray Boot-Handford, Qing-Jun Meng: Dudek M, Gossan N, Yang N, Hee-Jeong Im, Jayalath Ruckshanthi, Hikari Yoshitane, Xin Li, Yoshitaka Fukada, Ray Boot-Handford, Qing-Jun Meng
    • Organizer
      SRBR 2016
    • Place of Presentation
      Palm Harbor (USA Florida)
    • Year and Date
      2016-05-22
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Impact roles of the RNA Editing Enzyme in the mammalian circadian clockwork2016

    • Author(s)
      Hikari Yoshitane, Hideki Terajima, Haruka Ozaki, Yutaka Suzuki, Wataru Iwasaki and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      SRBR 2016
    • Place of Presentation
      Palm Harbor (USA Florida)
    • Year and Date
      2016-05-22
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 概日リズム.『動物学の百科事典』2017

    • Author(s)
      小島大輔、深田吉孝(日本動物学会 監修)
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      丸善出版
  • [Book] 松果体の光受容.『光と生命の事典』2016

    • Author(s)
      深田吉孝(日本光生物学協会 光と生命の事典 編集委員会 編)
    • Total Pages
      436( 212-213 )
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Book] 概日時計の発振メカニズムと時蛋白質の翻訳後修飾.『ブルーライト テキストブック』2016

    • Author(s)
      吉種光、深田吉孝( 坪田 一男 編)
    • Total Pages
      230( 126-131 )
    • Publisher
      金原出版
  • [Remarks] 深田研究室 東京大学

    • URL

      http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/fukada-lab/index-j.html

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-01-31  

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