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2012 Fiscal Year Annual Research Report

先端医療技術の開発における臨床試験の計画と統計解析に関する研究

Research Project

Project/Area Number 24240042
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Research InstitutionThe Institute of Statistical Mathematics

Principal Investigator

松井 茂之  統計数理研究所, 大学共同利用機関等の部局等, 教授 (80305854)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 江口 真透  統計数理研究所, 大学共同利用機関等の部局等, 教授 (10168776)
手良向 聡  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (20359798)
松浦 正明  公益財団法人がん研究会, その他部局等, 研究員 (40173794)
森田 智視  横浜市立大学, 大学病院, 教授 (60362480)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords先端医療技術 / 臨床試験 / 統計解析 / バイオマーカー / 個別化医療 / 予測解析
Research Abstract

H24年度は、先端医療技術の開発早期に実施される探索的臨床試験に焦点をあて、「早期臨床試験班」と「バイオマーカー開発班」を立ち上げて研究テーマの整理を主に行った。早期臨床試験班では、過去5年間に発表されたがん第I-II相試験の100以上の文献を収集して試験デザインについてのレビューを行った。併せて、過去10年間の生物統計学関連雑誌に掲載された試験デザインの方法論に関する文献も収集してレビューを行った。分子標的治療の臨床試験については早期臨床試験の現状とデザインの方法論に関して総説論文を作成した。バイオマーカー開発班では、がん臨床研究の枠組みで過去5年間に発表されたゲノムワイド研究をレビューし、同時に、マイクロアレー遺伝子発現量の公開データをダウンロードし、データベースの作成を行った。これと平行して、バイオマーカーの開発・検証のための統計的方法論についての文献レビューを行い、その成果を総説論文として発表した。さらに、バイオマーカーを用いた臨床試験デザインの比較を数値計算とシミュレーションに基づいて行い、その成果を論文にまとめ、投稿準備中である。他にも、がんの異質性を検出する統計的方法の提案などを行い、その一部を論文として発表した。
一方、H24年8月末に国際計量生物学会(International Biometric Conference)が開催され、本研究の成果の一部を発表し、併せて、海外協力者との綿密な研究打ち合わせを行った。その中で、早期臨床試験、バイオマーカー開発含めた個別化医療の臨床試験全体に関わる統計的課題・方法論についてのハンドブック的な本を執筆することとなった。研究代表者はそこでの筆頭エディターとして今後この本の出版に向けて海外・国内研究者と調整をすることとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

H24年度は、本研究プロジェクトの初年度として研究課題の抽出と整理、並びに、遺伝子データベースの構築が主な目標であった。二つの研究班「早期臨床試験班」、「バイオマーカー開発班」ともに効率的に研究課題の整理に取り組み、成果物としての総説論文の作成までを行うことができた。総説論文の一部はH24年度中に発表できたものもあるが、大半はH25年度以降、学術雑誌や書籍での出版予定である。上記の活動で同定された一部の研究課題についても取り組みは始まっており、既に論文として発表できたものもある。これも順次、学術雑誌にて発表を行っていく予定である。遺伝子データベースについても整備が進み、今後の研究で活用できるものが出来上がった。以上より、当初の目標はほぼ達成でき、順調に進んでいると考える。

Strategy for Future Research Activity

H24年度の活動によって、今後取り組むべき課題が整理され、多くの新たな課題も同定された。H24年度で立ち上げた研究班内でまずは多くの課題の背後にある基盤的な研究テーマ(たとえば、ベイズ流適応的臨床試験デザインとその性能比較、ゲノムワイドデータ解析での予後マーカー(主効果)と治療効果予測マーカー(交互作用)の検出法と性能比較など)から重点的に取り組む。その一方で、前年度に得られた成果(多くは総説論文)については順次、学術論文、書籍を通して出版する。遺伝子データベースについては次年度に公開されるデータを追加するなどの更新を行う。さらに、研究代表者が筆頭エディターを務める個別化医療・予測医療のハンドブックの執筆・編集も進める。

  • Research Products

    (22 results)

All 2013 2012

All Journal Article (17 results) (of which Peer Reviewed: 16 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Cancer Outlier Analysis Based on Mixture Modeling of Gene Expression Data2013

    • Author(s)
      Mori K, Oura T, Noma H, Matsui S
    • Journal Title

      Computational and Mathematical Methods in Medicine

      Volume: Article ID 693901 Pages: 1-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic Biomarkers for Personalized Medicine: Development and Validation in Clinical Studies2013

    • Author(s)
      Matsui S
    • Journal Title

      Computational and Mathematical Methods in Medicine

      Volume: Article ID 865980 Pages: 1-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multiple Suboptimal Solutions for Prediction Rules in Gene Expression Data2013

    • Author(s)
      Komori O, Prichard M, Eguchi S
    • Journal Title

      Computational and Mathematical Methods in Medicine

      Volume: Article ID 798189 Pages: 1-14

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Updated Overall Survival Results from A Randomized Phase III Trial Comparing Gefitinib with Carboplatin-Paclitaxel for Chemo-Naïve Non-Small Cell Lung Cancer with Sensitive EGFR Gene Mutations (NEJ002)2013

    • Author(s)
      Inoue A, Kobayashi K, Maemondo M et al.
    • Journal Title

      Annals of Oncology

      Volume: 24 Pages: 54-59

    • DOI

      10.1093/annonc/mds214

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] High expressions of ATP-binding cassette transporter ABCC11 in the breast tumors are associated with aggressive subtypes and worse disease-free survival2013

    • Author(s)
      Yamada A, Ishikawa T, Ota I et al.
    • Journal Title

      Breast Cancer Research and Treatment

      Volume: 137 Pages: 773-782

    • DOI

      10.1007/s10549-012-2398-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of a gene expression database and related analysis programs for evaluation of anticancer compounds.2013

    • Author(s)
      Ushijima M, Mashima T, Tomida A et al.
    • Journal Title

      Cancer Sci

      Volume: 104 Pages: 360-368

    • DOI

      10.1111/cas.12071

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Developing and validating continuous genomic signatures in randomized clinical trials for predictive medicine2012

    • Author(s)
      Matsui S, Simon R, Qu P et al.
    • Journal Title

      Clinical Cancer Research

      Volume: 18 Pages: 6065-6073

    • DOI

      10.1158/1078-0432.CCR-12-1206

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An extension of the Receiver Operating Characteristic curve and AUC-optimal classification2012

    • Author(s)
      Takenouchi T, Komori O, Eguchi S
    • Journal Title

      Neural Computation

      Volume: 24 Pages: 2789-2824

    • DOI

      10.1162/NECO_a_00336

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Bayesian predictive sample size selection design for single-arm exploratory clinical trials.2012

    • Author(s)
      Teramukai S, Daimon T, Zohar S
    • Journal Title

      Statistics in Medicine

      Volume: 20 Pages: 4243-4254

    • DOI

      10.1002/sim.5505

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 代替エンドポイントの統計学的評価2012

    • Author(s)
      手良向聡
    • Journal Title

      臨床評価

      Volume: 40 Suppl XXXI Pages: 191-195

  • [Journal Article] Prior effective sample size in conditionally independent hierarchical models.2012

    • Author(s)
      Morita S, Thall PF, Mueller P
    • Journal Title

      Bayesian Analysis

      Volume: 7 Pages: 591-614

    • DOI

      10.1214/12-BA720

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Homozygous c.14576G>A variant of RNF213 predicts early-onset and severe form of moyamoya disease2012

    • Author(s)
      Kumagai K, Sakai K, Kusayama Y et al.
    • Journal Title

      Neurology

      Volume: 78 Pages: 803-810

    • DOI

      10.1212/WNL.0b013e318249f71f

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Impacts and predictors of cytotoxic anticancer agents in different breast cancer subtypes2012

    • Author(s)
      Ishikawa T, Shimizu D, Yamada A et al.
    • Journal Title

      Oncol Res.

      Volume: 20 Pages: 71-79

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ASCL1- coexpression profiling but not single gene expression profiling defines lung adenocarcinomas of neuroendocrine nature with poor prognosis.2012

    • Author(s)
      Fujiwara T, Hiramatsu M, Isagawa T et al.
    • Journal Title

      Lung Cancer

      Volume: 75 Pages: 119-125

    • DOI

      10.1016/j.lungcan.2011.05.028

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Aging-associated inflammation in healthy Japanese individuals and patients with Werner syndrome2012

    • Author(s)
      Goto M, Sugimoto K, Hayashi S et al.
    • Journal Title

      Exp Gerontol.

      Volume: 47 Pages: 936-939

    • DOI

      10.1016/j.exger.2012.08.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detailed features of palisade vessels as a marker of the esophageal mucosa revealed by magnifying endoscopy with narrow band imaging.2012

    • Author(s)
      Kumagai Y, Yagi M, Aida J et al.
    • Journal Title

      Dis Esophagus.

      Volume: 25 Pages: 484-490

    • DOI

      10.1111/j.1442-2050.2011.01283.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hyperactivation of 4E-binding protein 1 as a mediator of iguanide-induced cytotoxicity during glucose deprivation.2012

    • Author(s)
      Matsuo J, Tsukumo Y, Saito S et al.
    • Journal Title

      Mol. Cancer Ther.

      Volume: 11 Pages: 1082-1091

    • DOI

      10.1158/1535-7163.MCT-11-0871

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Developing and validating continuous genomic signatures in randomized clinical trials2012

    • Author(s)
      Matsui S
    • Organizer
      XXVIth International Biometric Conference, Invited Session, Design and Analysis of Clinical Trials for Predictive Medicine: New Paradigm and Challenges
    • Place of Presentation
      Kobe
    • Year and Date
      20120826-20120831
    • Invited
  • [Presentation] Networking clinical biostatisticians in Japan2012

    • Author(s)
      Matsui S
    • Organizer
      XXVIth International Biometric Conference, Invited Session, International Collaborations and Networking of the Biometricians to Develop Statistical Methodologies and to Solve Global Statistical Issues
    • Place of Presentation
      Kobe
    • Year and Date
      20120826-20120831
    • Invited
  • [Presentation] Information geometry in statistics2012

    • Author(s)
      Eguchi S
    • Organizer
      The 2nd Institute of Mathematical Statistics Asia Pacific Rim Meeting
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      20120602-20120604
    • Invited
  • [Presentation] 臨床試験における統計的デザイン2012

    • Author(s)
      手良向聡
    • Organizer
      日本外科学会第9回臨床研究セミナー
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉)
    • Year and Date
      20120414-20120414
    • Invited
  • [Book] Crowley J.J. and Hoering A. (ed.) Handbook of Statistics in Clinical Oncology, 3rd edition. Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton2012

    • Author(s)
      Matsui S, Noma H.
    • Total Pages
      569-590
    • Publisher
      Analysis of DNA microarrays

URL: 

Published: 2014-07-24   Modified: 2023-03-16  

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