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2015 Fiscal Year Annual Research Report

アカハライモリのモデル動物化を加速する分野横断研究:技術・情報基盤構築と実践適用

Research Project

Project/Area Number 24240062
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

千葉 親文  筑波大学, 生命環境系, 准教授 (80272152)

Project Period (FY) 2012-05-31 – 2016-03-31
Keywords動物 / 生理学 / 発生・分化 / 環境 / ゲノム
Outline of Annual Research Achievements

アカハライモリの資源・技術・情報基盤研究を様々な研究分野に展開するために、以下の項目について研究を行った。
1.トランスジェニック(TG)適用技術の開発/実践適用 1)イモリの再生モデルとしての地位を確立すべく、眼と肢の再生について、TG技術を駆使した細胞追跡および遺伝子解析を実践した。肢再生について、イモリが他の両生類と異なり、幼生期と変態後の成体で再生メカニズムを転換することを明らかにした。成体イモリの高い網膜再生能力が網膜外傷性疾患の初期メカニズムを改変することで進化した可能性を明らかにした。水晶体の遺伝子発現が繰り返し再生によって影響を受けない(若い状態を維持する)ことを明らかにした。水晶体再生過程において虹彩細胞を追跡する実験系を確立した。以上の結果から、イモリの特殊性と有用性があらためて示された。2)遺伝子編集技術も導入し、アルビノイモリなど様々な分野に利用可能なイモリ系統を生産した。
2.遺伝子情報の集積・解析/データベース 1)アカハライモリの全転写産物(mRNA)情報-TOTAL transcriptome-を、他の脊椎動物の遺伝子情報と比較することで特徴づけた(イモリはヒトの約90%の遺伝子に対応する相同遺伝子をもつ)。データベースIMORIにおいて組織特異的な遺伝子発現情報を公開した。2)比較transcriptome解析により、肢再生過程で発現するイモリ固有遺伝子の単離に成功した。再生、精子形成、嗅受容、胚発生において単一細胞レベルの遺伝子発現解析を始めた。今後、これらの成果を国際誌で発表することによるIMORIの有用性を示す。
3.イモリの保護・保全/資源化 1)屋外自然繁殖施設(いもりの里)において、卵から亜成体まで効率よく飼育することが可能になった。今後、成体の維持条件を改善し、自然繁殖を試みる。2)研究活動への理解を深めてもらうため、市民向けイベントや公開講座を開催した。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (17 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (5 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Dayton(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of Dayton
  • [Journal Article] A developmentally regulated switch from stem cells to dedifferentiation for limb muscle regeneration in newts.2016

    • Author(s)
      Tanaka, H.V., Ng, N.C.Y., Yu, Z.Y., Casco-Robles M.M., Maruo, F., Tsonis, P.A. and C, Chiba.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 7:11069. Pages: 1-8

    • DOI

      10.1038/ncomms11069

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Memory Efficient de novo Assembly Algorithm using Disk Streaming of K-mers.2016

    • Author(s)
      Endo, Y., Toyama, F., Chiba, C., Mori, H. and Shoji, K.
    • Journal Title

      Proceedings of the 9th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies (BIOSTEC 2016)

      Volume: 3 Pages: 266-271

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression of two classes of Pax6 transcripts in reprogramming retinal pigment epithelium cells of the adult newt.2016

    • Author(s)
      Inami, W., Islam. M.R., Nakamura, K., Yoshikawa, T., Yasumuro, H., Casco-Robles, M.M., Toyama, F., Maruo, F. and Chiba, C.
    • Journal Title

      Zoological Science

      Volume: 33 Pages: 21-30

    • DOI

      10.2108/zs150111

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A robust transcriptional program in newts undergoing multiple events of lens regeneration.2015

    • Author(s)
      Sousounis, K., Qi, F., Yadav, M.C., Millan, J.L., Toyama, F., Chiba, C., Eguchi, Y., Eguchi, G. and Tsonis, P.A.
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 10.7554/eLife.09594 Pages: 1-17

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.7554/eLife.09594

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Confirmation of the absence of tetrodotoxin and its analogues in the juveniles of the Japanese fire-bellied newt, Cynops pyrrhogaster, captive-reared from eggs in the laboratory using HILIC-LC-MS.2015

    • Author(s)
      Kudo, Y., Chiba, C., Konoki, K., Cho, Y. and Yotsu-Yamashita, M.
    • Journal Title

      Toxicon

      Volume: 101 Pages: 101-105

    • DOI

      10.1016/j.toxicon.2015.05.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A memory efficient short read de novo assembly algorithm.2015

    • Author(s)
      Endo, Y., Toyama, F., Chiba, C., Mori, H. and Shoji, K.
    • Journal Title

      IPSJ Transactions on Bioinformatics

      Volume: 8 Pages: 2-8

    • DOI

      http://doi.org/10.2197/ipsjtbio.8.2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The newt (Cynops pyrrhogaster) RPE65 promoter: molecular cloning, characterization and functional analysis.2015

    • Author(s)
      Casco-Robles, M.M., Miura, T. and Chiba, C.
    • Journal Title

      Transgenic Research

      Volume: 24 Pages: 463-473

    • DOI

      10.1007/s11248-014-9857-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 成体イモリの網膜再生過程におけるRPE細胞のリプログラミング:シングルセルトランスクリプトーム解析2015

    • Author(s)
      半沢汐里、千葉親文、外山史
    • Organizer
      第86回日本動物学会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ:新潟コンベンションセンター(新潟県新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-17
  • [Presentation] 成体イモリの網膜再生-ナチュラルリプログラミングのsingle cell解析2015

    • Author(s)
      千葉親文
    • Organizer
      第1回次世代両生類研究会
    • Place of Presentation
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2015-08-24
    • Invited
  • [Presentation] 私たちはイモリのように再生できるのか?-アカハライモリに学ぶ体組織再生の戦略-2015

    • Author(s)
      千葉親文
    • Organizer
      第5回細胞再生医療研究会
    • Place of Presentation
      臨床研究情報センター(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-07-26
    • Invited
  • [Presentation] 動物が魅せるナチュラルな体細胞リプログラミングと網膜再生2015

    • Author(s)
      千葉親文
    • Organizer
      第221回つくばブレインサイエンス・セミナー
    • Place of Presentation
      筑波大学(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2015-07-21
    • Invited
  • [Remarks] イモリ網膜再生のページ

    • URL

      http://www.biol.tsukuba.ac.jp/~chichiba/

  • [Remarks] イモリネットワーク Japan Newt Research Community

    • URL

      http://imori-net.org/

  • [Remarks] IMORI

    • URL

      http://antler.is.utsunomiya-u.ac.jp/imori/

  • [Remarks] 筑波大学 注目の研究

    • URL

      http://www.tsukuba.ac.jp/attention-research/p201603301800.html

  • [Remarks] Scientists solved the Spallanzani's dilemma

    • URL

      http://phys.org/news/2016-03-scientists-spallanzani-dilemma.html

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Published: 2017-01-06   Modified: 2022-01-28  

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