2014 Fiscal Year Annual Research Report
糖鎖機能の統合的理解を目指した糖鎖改変マウスのＮ－統合グライコプロテオーム解析
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24241073
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| Research Institution | National Institute of Advanced Industrial Science and Technology |
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Principal Investigator |
成松 久 独立行政法人産業技術総合研究所, 糖鎖創薬技術研究センター, 招聘研究員 (40129581)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 糖鎖 / 糖転移酵素 / 糖タンパク質 / 糖ペプチド / グライコプロテオミクス解析 / IGOT法 / 糖鎖機能 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本課題では、各糖転移酵素に特異的な標的タンパク質の大規模同定を行うために、糖転移酵素の遺伝子ノックアウト(KO)マウス群を用い、糖鎖キャリア分子（糖ペプチド）をレクチン捕集して、野生型マウスとKOマウスとの比較グライコプロテオーム解析を行った。昨年度までに、野生型及びB4galt1(-/-)マウス肝臓より、そのキャリアタンパク質を1000分子種以上同定し、標的分子の分子性状に共通した特徴・傾向を見出した。今年度はLewis x構造（Galβ1-4(Fucα1-3)GlcNAc-R）を合成する、α1,3-フコース転移酵素9（Fut9）に着目し、KOマウスを用いた解析を行った。Fut9(-/-)マウス腎臓のグライコームを質量分析法により解析した結果、Lewis型フコースの消失だけでなく、様々な構造変化が検出された。ついで、Lewis型フコース糖鎖と結合しているキャリア分子を同定するため、AALレクチンによってフコシル化糖鎖ペプチドを捕集し、IGOT-LC/MS法(Kaji et al (2003) Nat Biotechnol.)で候補タンパク質および糖鎖付加位置を同定した。また、野生型マウスにおけるAAL結合糖ペプチドには、Lewis型フコースをもたず、コアフコースのみをもつ糖ペプチドも共存するため、糖鎖付加部位ごとのグライコーム情報を取得する新規グライコプロテオミクス技術を用いて、Lewis xキャリアを選別、同定した。以上の様に、グライコプロテオミクスの手法・技術を用いることで、糖転移酵素それぞれの糖鎖のキャリア糖タンパク質群を効率良く同定出来ることが示された。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] WURCS: the Web3 unique representation of carbohydrate structures.2014
Author(s)
Tanaka K, Aoki-Kinoshita KF, Kotera M, Sawaki H, Tsuchiya S, Fujita N, Shikanai T, Kato M, Kawano S, Yamada I, Narimatsu H.
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Journal Title
J Chem Inf Model.
Volume: 54(6)
Pages: 1558-66
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] RNAi screening of human glycogene orthologs in the nematode Caenorhabditis elegans and the construction of the C. elegans glycogene database.2014
Author(s)
Akiyoshi S, Nomura KH, Dejima K, Murata D, Matsuda A, Kanaki N, Takaki T, Mihara H, Nagaishi T, Furukawa S, Ando KG, Yoshina S, Mitani S, Togayachi A, Suzuki Y, Shikanai T, Narimatsu H, Nomura K.
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Journal Title
Glycobiology
Volume: 25(1)
Pages: 8-20
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Glycoproteomics Approach for Identifying Glycobiomarker Candidate Molecules for Tissue Type Classification of Non-small Cell Lung Carcinoma.2014
Author(s)
Hirao Y, Matsuzaki H, Iwaki J, Kuno A, Kaji H, Ohkura T, Togayachi A, Abe M, Nomura M, Noguchi M, Ikehara Y, Narimatsu H.
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Journal Title
J Proteome Res
Volume: 13(11)
Pages: 4705-16
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] GlycoRDF: an ontology to standardize glycomics data in RDF.2014
Author(s)
Ranzinger R, Aoki-Kinoshita KF, Campbell MP, Kawano S, Lutteke T, Okuda S, Shinmachi D, Shikanai T, Sawaki H, Toukach P, Matsubara M, Yamada I, Narimatsu H.
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Journal Title
Bioinformatics
Volume: 31(6)
Pages: 919-25
DOI
Peer Reviewed
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