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2012 Fiscal Year Annual Research Report

植物におけるRNAサイレンシング増幅機構の解析

Research Project

Project/Area Number 24248010
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Research InstitutionNational Institute of Agrobiological Sciences

Principal Investigator

飯 哲夫  独立行政法人農業生物資源研究所, 植物科学研究領域, 領域長 (40157813)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 石川 雅之  独立行政法人農業生物資源研究所, 植物科学研究領域, ユニット長 (70192482)
吉川 学  独立行政法人農業生物資源研究所, 植物科学研究領域, 主任研究員 (80391564)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
KeywordsRISC / microRNA / trans-acting siRNA / AGO1 / SGS3
Research Abstract

RNAサイレンシングは、ウイルスなど有害な外来遺伝因子に対する重要な防御機構の一つである。RNAサイレンシングでは、ARGONAUTEタンパク質及び小分子RNAを含むRISC複合体が配列特異的な遺伝子発現調節を司る。植物では、RISCによって切断されたRNA断片を鋳型としたRNA合成を経て二次的siRNAの生成が起き、これがウイルスに対する防御において重要であることが知られている。これまでの研究から二次的siRNAの生成には、22塩基長の小分子RNAとAGO1を含むRISCやSGS3、RDR6、DCL2/4などが関わっていることがわかっている。我々は、22塩基長のmiR173を含んだRISCによって切断されたRNA断片から生じるシロイヌナズナのtrans-acting siRNAをモデルとして、二次的siRNA生成機構の解析を進めている。平成24年度は、二本鎖RNA結合活性を持つSGS3に着目して研究を行った。以前のシロイヌナズナの遺伝学解析によりSGS3はRISC切断RNA断片の安定化に機能していることが示唆されていることから、タバコ脱液胞化細胞抽出液(BYL)を用いてmiR173に結合したAGO1(すなわちRISC)とSGS3、RISC切断RNAそれぞれとの相互作用を調べた。その結果、RISC切断RNAはRISCおよびSGS3と複合体を形成することにより安定化されていることがわかった。またイネ縞葉枯ウイルスのp2及びトマト黄化葉巻ウイルスのV2は、SGS3と相互作用することによりRNAサイレンシングの増幅を抑制すると考えられている。そこで、これらの相互作用を確認するために、それぞれの宿主植物からSGS3をクローニングし、それらのmRNAをBYLで翻訳してタンパク質を調製し、免疫沈降を行ったが相互作用は確認できなかった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

平成24年度に計画していた実験のほぼ全てを遂行し、得られた成果をPNAS誌に発表できたため。

Strategy for Future Research Activity

上記のとおり平成24年度には、RNAサイレンシングの増幅経路において、RISCによって切断されたRNAがSGS3により安定化されるまでのステップを試験管内で再現し、当該過程の分子機構の一端を明らかにすることができた。そこで平成25年度は、次のステップと考えられるRISC切断RNAへのRNA依存性RNA合成酵素RDR6のリクルートメントとそれによる二本鎖RNA合成の分子機構を解析する。そのために、まずタバコのRDR6をクローニングし、BYLを使った試験管内翻訳反応によりRDR6タンパク質を調製し、二本鎖RNA合成活性を調べる。活性が確認できれば、AGO1-SGS3-RISC切断RNAの複合体にRDR6がリクルートされるかどうかを調べる。また、平成24年度にSGS3相互作用が確認できなかったSGS3とp2及びV2のサプレッサータンパク質が、実際にサプレッサー能を有するかを、p2またはV2を発現するシロイヌナズナの形質転換体を作製し、それら形質転換体におけるtrans-acting siRNAの蓄積を調べることにより明らかにする。

Research Products

(4 results)

All 2013 2012

All Journal Article Presentation

  • [Journal Article] 3’ fragment of miR173-programmed RISC-cleaved RNA is protected from degradation in a complex with RISC and SGS32013

    • Author(s)
      Manabu Yoshikawa
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      Volume: 110 Pages: 4117-4122

    • DOI

      10.1073/pnas.1217050110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cytoplasmic assembly and selective nuclear import of Arabidopsis Argonaute4/siRNA complexes2012

    • Author(s)
      Ruiqiang Ye
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 46 Pages: 859-870

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2012.04.013

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Toward controlling tobamovirus multiplication2012

    • Author(s)
      Masayuki Ishikawa
    • Organizer
      2012 FFTC-TUA International Seminar on Emerging Infectious Diseases of Food Crops in Asia
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20121020-20121021
    • Invited
  • [Presentation] SGS3による切断RNA-RISC複合体の安定化2012

    • Author(s)
      吉川学
    • Organizer
      第14回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20120718-20120720

URL: 

Published: 2014-07-24  

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