2013 Fiscal Year Annual Research Report
遺伝子機能を特異的に制御する新規機能性ポリアミドの開発
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24310155
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
板東 俊和 京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (20345284)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | Py-Imポリアミド / 特定遺伝子制御 / DNA塩基配列認識 |
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| Research Abstract |
特定遺伝子発現の化学的な機能分子による制御法の実現に向けて、申請者はDNAの遺伝子配列中の１塩基対の変異体の差異を認識する能力を持つ機能性ピロール(Py)-イミダゾール(Im)ポリアミドの研究開発を進めている。将来的に、培養細胞内の特定遺伝子の発現を機能性Py-Imポリアミドの配列特異性によって制御可能であることを証明し、遺伝子発現制御分子としての有用性を示していく。2013年度も島津製Fmoc固相合成機を活用し、合成条件を工夫、改善しながら、標的塩基配列に対応する機能性Py-Imポリアミドを合成、機能評価を進めた。その結果を以下に示す。
(1)SAHA (suberoylanilide hydroxamic acid)をPy-Imポリアミドに連結させた誘導体によって、ヒト皮膚線維芽細胞(HDF)中の様々な遺伝子を特異的に活性化した。(2)ヒトテロメア配列を標的とする蛍光性タンデム型Py-Imポリアミドの合成、機能評価を行なった。(3)システインークロロアセチル基との間の反応を利用した環状Py-Imポリアミド二量体を合成した。(4)アルキル化能を有するPy-Imポリアミドについて、Kras遺伝子配列の１塩基の変異型を認識可能であることを報告した。
Fmoc固相合成技術を基盤とする本研究の進展により、培養細胞中の特定遺伝子群に対して特異的に作用する機能性Py-Imポリアミドが開発できると考える。現在、SAHA以外のエピジェネチックスを制御する可能性のある機能性Py-Imポリアミドの新規合成を進めており、得られる知見、実験結果をまとめ、論文として投稿する予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
論文として報告する作業が遅れている研究もあるが、全体として研究の核となる研究知見は見出されており、機能性Py-Imポリアミドの研究を広く展開することができた。二年目の研究実績として、概ね順調に進展していると考える。
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| Strategy for Future Research Activity |
CAG繰り返し配列を標的とするPy-Imポリアミドの合成、機能評価の結果を論文として報告する。
加えて、次世代シークエンサーを用いたDNA塩基配列認識能評価の結果得られている知見、実験結果も論文としてまとめていく。
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[Journal Article] Distinct DNA-based epigenetic switches trigger transcriptional activation of silent genes in human dermal fibroblasts2014
Author(s)
Pandian, G. N.; Taniguchi, J.;Junetha, S.; Sato, S.; Han, L.; Saha, A.; Anandhkumar, C.; Bando, T.; Nagase, H.; Thangavel, V.; Taylor, R. D.; Sugiyama, H.
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Journal Title
Sci. Rep.
Volume: 4
Pages: 3843
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] A Synthetic Small Molecule Enforces Targeted Transcriptional Activation of Germ Cell Genes in a Human Somatic Cell2013
Author(s)
Han, L.; Pandian, G. N.; Junetha, S.;Sato, S.; Anandhkumar, C.; Taniguchi, J.; Saha, A.; Bando, T.; Nagase, H.; Sugiyama, H.
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Journal Title
Angew. Chem. Int. Ed.
Volume: 52
Pages: 13410-13413
DOI
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