• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2014 Fiscal Year Annual Research Report

スプリット有機分子触媒の創成および化学的シグナル増幅系への応用

Research Project

Project/Area Number 24350040
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

井原 敏博  熊本大学, 自然科学研究科, 教授 (40253489)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 櫻井 敏彦  鳥取大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (10332868)
今堀 龍志  東京理科大学, 工学部, 講師 (90433515)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
KeywordsDNA / 触媒反応 / コンジュゲート / 協同性 / 加水分解 / 金属錯体
Outline of Annual Research Achievements

平成26年度は、基質を取り込むための環境としてβ-シクロデキストリン(βCyD)を用いることにした。DNA末端にβCyDを化学修飾し(CyD–DNA)DNAテンプレートの特定の箇所にこれを配置する。対となるDNAとしてこれまでに合成してきたBrønstedの酸や塩基を修飾したDNAコンジュゲートを使用することができる。また、今回、2,2’-ジピコリルアミン(DPA)を修飾したDNA(dpa-DNA)を新たに合成し、これを亜鉛錯体としてCyD–DNAと併せて使用することにした。
CyD–DNAコンジュゲートの合成法は申請者らのこれまでの研究により既に確立されており、期待通り調製することができた。dpa-DNAの合成の先行例はなかったが、DPAをペプチドに修飾した例を参考にして合成することができた。これらDNAコンジュゲートの合成、および以下で述べる色素系エステルの合成においては購入したフラッシュクロマト装置を使用した。両DNAコンジュゲート、および両者と相補的なタンデム配列を有する鋳型DNA存在下、色素系のエステルを基質として、DNAを反応場とした加水分解反応の促進を観察した。しかしながら、あらゆるすべてのDNAコンジュゲートの組合わせに関して、リン酸エステルの加水分解の促進を観察することはできなかった。そこで、より活性なカルボン酸エステル(p-ニトロフェノールのエステル)を基質として合成して使用した。その結果、dpa-DNAとCyD–DNAコンジュゲートの組合わせにおいて、加水分解反応の有意な加速を確認することができた。修飾分子(DPA、βCyD)とDNAを繋ぐリンカーの長さ、鋳型DNA中の活性部位近傍の塩基配列、pH、温度などを変化させることで最適な条件を探す必要がある。超分子化学、分析化学の観点から将来性のある興味深い結果である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Metal Ion-directed Dynamic Splicing of DNA through Global Conformational Change by Intramolecular Complexation2015

    • Author(s)
      T. Ihara, H. Ohura, C. Shirahama, T. Furuzono, H. Shimada, H. Matsuura, Y. Kitamura
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 6 Pages: 6640

    • DOI

      10.1038/ncomms7640

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Alteration of DNAzyme Activity by Silver Ion2014

    • Author(s)
      S. Urata, T. Miyahata, H. Matsuura, Y. Kitamura, T. Ihara
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 43 Pages: 1020-1022

    • DOI

      10.1246/cl.140197

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Potentiometric DNA Sensing Platform Using Redox-Active DNA Probe Pair for Sandwich-Type Dual Hybridization at Indicator Electrode Surface2014

    • Author(s)
      K. Nakano, T. Kimura, Y. Kitamura, T. Ihara, R. Ishimatsu, T. Imato
    • Journal Title

      Journal of Electroanalytical Chemistry

      Volume: 720-721 Pages: 71-75

    • DOI

      10.1016/j.jelechem.2014.03.029

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In Situ Oxygenous Functionalization of a Graphite Electrode for Enhanced Affinity toward Charged Species and a Reduced Graphene Oxide Mediator2014

    • Author(s)
      M. R. Karim, Y. Ikeda, T. Ide, S. Sugito, K. Toda, YM. R. Karim, Y. Ikeda, T. Ide, S. Sugimoto, K. Toda, Y. Kitamura, T. Ihara, T. Matsui, T. Tani. Kitamura, T. Ihara, T. Matsui, T. Taniguchi, M. Koinuma, Y. Matsumoto, S. Hayami
    • Journal Title

      New Journal of Chemistry

      Volume: 38 Pages: 2120-2127

    • DOI

      10.1039/c3nj01471a

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Stimuli-responsive DNA Splicing through Global Conformational Change2015

    • Author(s)
      Toshihiro Ihara, Hiroyuki Ohura, Hidenaga Kodani, Shoma Urata, Yusuke Kitamura
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会2015
    • Place of Presentation
      日本大学船橋キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] Biosensing Based on Catalytic Formation of Luminous Metal Complexes on DNA2015

    • Author(s)
      Rie Ozaki, Yukina Azuma, Yusuke Kitamura, Toshihiro Ihara
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会2015
    • Place of Presentation
      日本大学船橋キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] Signal Amplification in Gene Analysis Based on Graphene Oxide and DNA Circuit2015

    • Author(s)
      Takaaki Miyahata, Tomoya Matsuo, Yusuke Kitamura, Toshihiro Ihara
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会2015
    • Place of Presentation
      日本大学船橋キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 核酸の動的構造をプログラムして増幅型バイオセンサをつくる2015

    • Author(s)
      井原敏博、宮端孝明、尾崎理依、大浦博之、北村裕介
    • Organizer
      第17回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      三翠園(高知)
    • Year and Date
      2015-01-08 – 2015-01-09
  • [Presentation] 相互作用をプログラミングして核酸を分析する2014

    • Author(s)
      井原敏博
    • Organizer
      14-1バイオ・高分子研究会
    • Place of Presentation
      にっしょうかん新館(長崎)
    • Year and Date
      2014-09-26 – 2014-09-27
    • Invited
  • [Presentation] 機能性核酸複合体を反応場とした触媒反応の検索2014

    • Author(s)
      野崎晃広、二村朱香、北村裕介、井原敏博
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] 金属配位基を骨格中に組み込んだ人工核酸によるDNAzymeの活性制御2014

    • Author(s)
      古谷英長、大浦博之、成合裕哉、白浜千里、古園智大、北村裕介、井原敏博
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] Bioanalyses through cooperative work of DNA conjugates2014

    • Author(s)
      Toshihito Ihara
    • Organizer
      Sichuan University Research Seminor
    • Place of Presentation
      Sichuan University
    • Year and Date
      2014-05-12 – 2014-05-12
    • Invited
  • [Remarks] 井原研究室

    • URL

      http://133.95.131.186/~toshi/

URL: 

Published: 2016-06-01  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi