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2014 Fiscal Year Annual Research Report

グラフェンナノ表面における核酸の定量解析と核酸結合リガンド選択システムの構築

Research Project

Project/Area Number 24350089
Research InstitutionKonan University

Principal Investigator

三好 大輔  甲南大学, フロンティアサイエンス学部, 教授 (50388758)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywordsグラフェン / DNA / 相互作用 / 吸着 / バイオセンサー
Outline of Annual Research Achievements

炭素の単層シートであるグラフェンとその酸化物であるグラフェン酸化物(以下、GOと記す)は、その物理的・電気的・光学的特性から、様々な用途への展開が検討されている。GOは、グラフェンを酸化することで調製される。酸化によりカルボキシル基や水酸基等の官能基がGOに導入されることから、GOは比較的高い水溶性をもつ。このような水溶性をもつナノ界面材料は谷はほとんど例がないことから、GOのバイオ分野への応用が注目されている。例えば、GOが様々な生体分子を吸着して蛍光を消光することを利用するバイオセンサーが数多く報告されている。しかし、生体分子のGOナノ表面における分子物性や、GOに対する吸着挙動はほとんど明らかではない。
そこで本研究では、(1)核酸のGOナノ表面での物性を解明するために、ナノ界面という特殊な分子環境である非理想溶液中での核酸の定量解析を行った。その結果、ナノ表面をはじめとする非理想溶液中では、核酸構造の非塩基対部位が全体構造やその熱力学的安定性に重要な役割を果たすことが示された。これらの成果は、掲載されたジャーナルの当該号の背表紙を飾り、新聞紙面においても。さらに、(2)GOナノ表面と核酸の吸着挙動を熱力学的・速度論的に解析すると同時に、その知見をバイオセンサーの構築に展開した。その結果、GOと核酸の吸着機構が示唆された。さらに、これらの知見を基に様々なタイプのバイオセンサーも構築できた。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Remarks

研究申請者の研究室のHP

  • Research Products

    (30 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 2 results) Presentation (22 results) (of which Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] DNA structures under molecular crowding conditions with a phosphorylcholine derivative (MPC)2015

    • Author(s)
      Yu-mi Ueda, Tomohiro Konno, Kazuhiko Ishihara, Naoki Sugimoto, Daisuke Miyoshi
    • Journal Title

      Transact. Mater. Res. Soc. Japan

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] DNA G-quadruplex detection system employing a protein fibril ligand2015

    • Author(s)
      Ryuichi Maeda, Hidenobu Yaku, Takakazu Nakabayashi, Takashi Murashima, Naoki Sugimoto, Daisuke Miyoshi
    • Journal Title

      Telomere and Telomerase

      Volume: 2 Pages: e691

    • DOI

      10.14800/tt.691

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A mRNA-Responsive G-Quadruplex-Based Drug Release System2015

    • Author(s)
      Hidenobu Yaku, Takashi Murashima, Daisuke Miyoshi, and Naoki Sugimoto
    • Journal Title

      Sensors

      Volume: 15 Pages: 9388-9403

    • DOI

      10.3390/s150409388

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A fluorescent probe for detection of an intracellular prognostic indicator in early-stage cancer2015

    • Author(s)
      Haiwei Ji, Yijia Guan, L Wu, Jinsong Ren, Daisuke Miyoshi, Naoki Sugimoto Xiaogang Qu
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Volume: 51 Pages: 1479-1482

    • DOI

      10.1039/C4CC08789E

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Drastic stabilization of parallel DNA hybridizations by a polylysine comb-type copolymer with hydrophilic graft chain2014

    • Author(s)
      Daisuke Miyoshi, Yu-mi Ueda, Naohiko Shimada, Shu-ichi Nakano, Naoki Sugimoto, Atsushi Maruyama
    • Journal Title

      ChemMedChem

      Volume: 9 Pages: 2156-2163

    • DOI

      10.1002/cmdc.201402157

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Hammerhead ribozyme activity and oligonucleotide duplex stability in mixed solutions of water and organic compounds2014

    • Author(s)
      Shu-ichi Nakano, Yuichi Kitagawa, Daisuke Miyoshi, Naoki Sugimoto
    • Journal Title

      FEBS Open Bio.

      Volume: 4 Pages: 643-650

    • DOI

      10.1016/j.fob.2014.06.009

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Dangling ends perturb the stability of RNA duplex responsive to surrounding condition2014

    • Author(s)
      H. Tateishi-Karimata, S. Pramanik, S. Nakano, D. Miyoshi and N. Sugimoto
    • Journal Title

      ChemMedChem

      Volume: 9 Pages: 2150-2155

    • DOI

      10.1002/cmdc.201402167

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 細胞内分子クラウディング環境で安定化するDNAの非標準構造2015

    • Author(s)
      三好大輔
    • Organizer
      東京都医学総合研究所 医学研セミナー
    • Place of Presentation
      東京都医学総合研究所
    • Year and Date
      2015-05-08 – 2015-05-08
    • Invited
  • [Presentation] 脱ワトソン-クリックの核酸化学 (12): チオフラビンTを用いた配列特異的RNA四重らせん構造検出法の開発2015

    • Author(s)
      前田龍一、森本一弘、樫田啓、浅沼浩之、杉本直己、三好大輔
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学 船橋キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 脱ワトソン-クリックの核酸化学 (13): 様々な二次構造を形成したDNAとグラフェン酸化物の吸着挙動の速度論的解析2015

    • Author(s)
      上田侑美、造住有輝、杉本直己、三好大輔
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学 船橋キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 脱ワトソン-クリックの核酸化学 (14): RNAの四重らせん構造に対して特異的結合する低分子化合物の開発2015

    • Author(s)
      松野仁志、下農修司、杉本直己、三好大輔
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学 船橋キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] Structural polymorphism of DNA induced and regulated by molecular crowding2015

    • Author(s)
      Daisuke Miyoshi
    • Organizer
      National Univ. of Kaohsiung Dept of Applied Chemistry Seminar
    • Place of Presentation
      National University of Kaohsiung, Kaohsiung, Taiwan
    • Year and Date
      2015-01-06 – 2015-01-06
    • Invited
  • [Presentation] 細胞内分子環境でも機能する分子の合理設計指針2014

    • Author(s)
      三好大輔
    • Organizer
      第3回 エキゾチック自己組織化材料シンポジウム
    • Place of Presentation
      鳥取大学
    • Year and Date
      2014-12-18 – 2014-12-18
    • Invited
  • [Presentation] DNA structure and stability under molecular crowding conditions2014

    • Author(s)
      Daisuke Miyoshi, Yu-mi Ueda, Naohiko Shimada, Shu-ichi Nakano, Naoki Sugimoto, Atushi Maruyama
    • Organizer
      Asian Chemical Biology Conference (ACBC) 2014
    • Place of Presentation
      National University of Singapore
    • Year and Date
      2014-12-15 – 2014-12-17
  • [Presentation] Non-canonical DNA structures under molecular crowding conditions2014

    • Author(s)
      Daisuke Miyoshi
    • Organizer
      School of Physics & Mathematical Science Seminar
    • Place of Presentation
      Nanyang Technological University, Singapore
    • Year and Date
      2014-12-14 – 2014-12-14
    • Invited
  • [Presentation] FRET-based detection of G-quadruplexes in the 5’-UTR cancer related mRNAs2014

    • Author(s)
      R. Maeda, H. Kashida, H. Asanuma, N. Sugimoto, and D. Miyoshi
    • Organizer
      第41回国際核酸化学シンポジウム (ISNAC2014)
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場
    • Year and Date
      2014-11-05 – 2014-11-07
  • [Presentation] Thermodynamics of DNA structures under molecular crowding conditions with naturally-occurring biomolecules2014

    • Author(s)
      Y. Ueda, T. Konno, K. Ishihara, N. Sugimoto, and D. Miyoshi
    • Organizer
      第41回国際核酸化学シンポジウム (ISNAC2014)
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場
    • Year and Date
      2014-11-05 – 2014-11-07
  • [Presentation] 細胞内でも活性を保持できる機能性分子の合理設計に向けた取り組み2014

    • Author(s)
      三好大輔
    • Organizer
      東京農工大学工学部講演会
    • Place of Presentation
      東京農工大学
    • Year and Date
      2014-09-18 – 2014-09-18
    • Invited
  • [Presentation] チオフラビンTを利用した新規四重らせん構造リガンドスクリーニングシステムの開発2014

    • Author(s)
      前田龍一, 鮎澤隼哉, 中林孝和, 村嶋貴之, 杉本直己, 三好大輔
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] 様々な二次構造をもつDNAとグラフェン酸化物の吸着機構の解明2014

    • Author(s)
      上田 侑美, 岩木 研太, 杉本 直己, 三好 大輔
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] カチオン性くし型共重合体によるDNA三重らせん構造の特異的安定化2014

    • Author(s)
      三好 大輔, 嶋田 直彦, 中野 修一, 杉本 直己, 丸山 厚
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] High throughput screening for DNA G-quadruplex specific ligands2014

    • Author(s)
      Ryu-ichi Maeda, Toshiya Ayusawa, Naoki Sugimoto, Daisuke Miyoshi
    • Organizer
      3rd Swiss-Japan Chemical Biology Symposium 2014
    • Place of Presentation
      University of Bern
    • Year and Date
      2014-09-02 – 2014-09-03
  • [Presentation] Target mRNA-Triggered Drug Release from G-quadruplex-Based Drug Delivery Carrier2014

    • Author(s)
      Hidenobu Yaku, Takashi Murashima, Daisuke Miyoshi, Naoki Sugimoto
    • Organizer
      The 15th IUMRS-International Conference in Asia
    • Place of Presentation
      Fukuoka Univ.
    • Year and Date
      2014-08-24 – 2014-08-30
  • [Presentation] DNA structures under molecular crowding conditions with choline phosphate derivative (MPC)2014

    • Author(s)
      Yu-mi Ueda, Tomohiro Konno, Kazuhiko Ishihara, Naoki Sugimoto, Daisuke Miyoshi
    • Organizer
      The 15th IUMRS-International Conference in Asia
    • Place of Presentation
      Fukuoka Univ.
    • Year and Date
      2014-08-24 – 2014-08-30
  • [Presentation] DNA G-quadruplex detection system by use of a protein fibril ligand2014

    • Author(s)
      Ryuichi Maeda, Takakazu Nakabayashi, Valérie Gabelica, Hidenobu Yaku, Takashi Murashima, Naoki Sugimoto, Nobuhiro Ohta, Daisuke Miyoshi
    • Organizer
      The 15th IUMRS-International Conference in Asia
    • Place of Presentation
      Fukuoka Univ.
    • Year and Date
      2014-08-24 – 2014-08-30
  • [Presentation] 様々な二次構造を持つDNAとヒストン模倣ペプチドの相互作用解析2014

    • Author(s)
      村田耕平、Pramanik Smritimoy、臼井健二、杉本直己、三好大輔
    • Organizer
      第46回若手ペプチド夏の勉強会
    • Place of Presentation
      京都府立青少年海洋センター
    • Year and Date
      2014-08-03 – 2014-08-05
  • [Presentation] 細胞と試験管を繋ぐ細胞環境化学模倣系2014

    • Author(s)
      三好大輔
    • Organizer
      研究拠点形成事業 ナノバイオ国際共同研究教育拠点  第3回若手国内シンポジウム/NanoBio第7回若手ネットワーキングシンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学
    • Year and Date
      2014-06-13 – 2014-06-14
  • [Presentation] 核酸四重らせん構造リガンドの新規スクリーニングシステムの開発2014

    • Author(s)
      前田龍一、中林孝和、村嶋貴之、杉本直己、三好大輔
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第9 回年会
    • Place of Presentation
      大阪大学 豊中キャンパス
    • Year and Date
      2014-06-11 – 2014-06-13
  • [Presentation] カチオン性くし型共重合体のDNA構造特異的相互作用: パラレル二重鎖選択的安定化2014

    • Author(s)
      丸山 厚・嶋田 直彦・三好 大輔・上田 侑美・中野 修一・杉本 直己
    • Organizer
      第63回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場,
    • Year and Date
      2014-05-28 – 2014-05-30
  • [Remarks] 甲南大学フロンティアサイエンス学部分子設計化学研究室

    • URL

      http://www.pi.konan-u.ac.jp/miyoshi/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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