2014 Fiscal Year Annual Research Report
造血器腫瘍におけるゲノム構造異常とキメラ転写産物の多様性の解明と臨床応用
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24591407
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
滝 智彦 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (50322053)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
川村 眞智子 公益財団法人東京都医学総合研究所, その他部局等, 研究員 (80450592)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | PVT1 / NSMCE2 / キメラ遺伝子 / RNAシーケンス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
１．Homogeneously staining regions (HSRs)やdouble minute chromosomes (DMs)などの高度ゲノム増幅領域の中で形成されている2種類の新規のキメラ転写産物を同定した。急性骨髄性白血病でしばしばみられる8q24の高度増幅では、増幅はある領域の単純な増幅ではなく、複数の領域の複雑な組み合わせによって形成されている。1臨床検体および細胞株における8q24増幅を詳細に検討し、まずその増幅単位の境界に存在する遺伝子を抽出した。それらの向きと構造を検討し、キメラ遺伝子を形成する可能性が考えられる遺伝子についてプライマーを設定し、さまざまな組み合わせでのRT-PCRによって、臨床検体からPVT1-NSMCE2、細胞株からBF104016-NSMCE2という2種類の新規のキメラ遺伝子を同定した。PVT1とBF104016はいずれも非コード遺伝子であるが、両者に共通したNSMCE2は染色体再構成を抑制する働きが知られている。非コード遺伝子との融合によりNSMCE2の機能が抑制されることがゲノム不安定性につながり、chromothripsis（染色体破砕）によって説明されるようなこのような高度の複雑な増幅に関与している可能性が示唆された。
２．未知のキメラ転写産物の同定のためのRNAシーケンスでは、種々の染色体異常を有する造血器腫瘍6検体の解析を行った。リボゾームRNA除去により、100bpのペアエンドでのシーケンスで平均1.3億塩基（1.1～1.45億塩基）の配列を読み、データについては現在解析途中であるが、defuseとfusionhunterという2種類の解析ソフトによる検討では、今のところ染色体転座に相当すると思われるキメラ転写産物は同定されていない。今後引き続き解析を進めていく。
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[Journal Article] 8q24 amplified segments involve novel fusion genes between NSMCE2 and long noncoding RNAs in acute myelogenous leukemia.2014
Author(s)
Chinen Y, Sakamoto N, Nagoshi H, Taki T, Maegawa S, Tatekawa S, Tsukamoto T, Mizutani S, Shimura Y, Yamamoto-Sugitani M, Kobayashi T, Matsumoto Y, Horiike S, Kuroda J, Taniwaki M.
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Journal Title
J Hematol Oncol
Volume: 7
Pages: 68
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] EVI1 overexpression is a poor prognostic factor in pediatric patients with mixed lineage leukemia-AF9 rearranged acute myeloid leukemia.2014
Author(s)
Matsuo H, Kajihara M, Tomizawa D, Watanabe T, Saito AM, Fujimoto J, Horibe K, Kodama K, Tokumasu M, Itoh H, Nakayama H, Kinoshita A, Taga T, Tawa A, Taki T, Shiba N, Ohki K, Hayashi Y, Yamashita Y, Shimada A, Tanaka S, Adachi S.
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Journal Title
Haematologica
Volume: 99
Pages: e225-227
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Prognostic implications of CEBPA mutations in pediatric acute myeloid leukemia: a report from the Japanese Pediatric Leukemia/Lymphoma Study Group.2014
Author(s)
Matsuo H, Kajihara M, Tomizawa D, Watanabe T, Saito AM, Fujimoto J, Horibe K, Kodama K, Tokumasu M, Itoh H, Nakayama H, Kinoshita A, Taga T, Tawa A, Taki T, Tanaka S, Adachi S.
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Journal Title
Blood Cancer J
Volume: 4
Pages: e226
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Loss of NDRG2 expression activates PI3K-AKT signalling via PTEN phosphorylation in ATLL and other cancers.2014
Author(s)
Nakahata S, Ichikawa T, Maneesaay P, Saito Y, Nagai K, Tamura T, Manachai N, Yamakawa N, Hamasaki M, Kitabayashi I, Arai Y, Kanai Y, Taki T, Abe T, Kiyonari H, Shimoda K, Ohshima K, Horii A, Shima H, Taniwaki M, Yamaguchi R, Morishita K.
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Journal Title
Nat Commun
Volume: 5
Pages: 3393
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Prognostic impact of gained chromosomes in high-hyperdiploid childhood acute lymphoblastic leukemia: a collaborative retrospective study of the Tokyo Children’s Cancer Study Group (TCCSG) and Japan Association of Childhood Leukemia Study (JACLS).2014
Author(s)
Kato M, Imamura T, Manabe A, Hashii Y, Koh K, Sato A, Takahashi H, Hori H, Taki T, Inoue M, Hayashi Y, Horibe K, Tsuchida M, Kojima S, Oda M, Ohara A.
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Journal Title
Br J Haematol
Volume: 166
Pages: 295-298
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] PVT1-NSMCE2 fusion gene enhances BCL-XL expression and drug resistance in leukemic cells.2014
Author(s)
Yoshiaki Chinen, Natsumi Sakamoto, Hisao Nagoshi, Tomohiko Taki, Satoru Kobayashi, Kazuhiro Nishida, Saori Maegawa, Miki Kiyota, Shinsuke Mizutani, Yuji Shimura, Mio Sugitani, Tsutomu Kobayashi, Yosuke Matsumoto, Shigeo Horiike, Junya Kuroda, Masafumi Taniwaki
Organizer
第76回日本血液学会学術集会
Place of Presentation
大阪
Year and Date
2014-10-31 – 2014-11-02
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[Presentation] The prognostic impact of high EVI1-related genes expression in pediatric acute myeloid leukemia.2014
Author(s)
Norio Shiba, Yusuke Hara, Kentaro Ohki, Genki Yamato, Myoung-Ja Park, Tohru Kobayashi, Hitoshi Ichikawa, Daisuke Tomizawa, Tomohiko Taki, Akira Shimada, Manabu Sotomatsu, Hirokazu Arakawa, Keizo Horibe, Souichi Adachi, Akio Tawa, Yasuhide Hayashi
Organizer
第76回日本血液学会学術集会
Place of Presentation
大阪
Year and Date
2014-10-31 – 2014-11-02
