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2012 Fiscal Year Research-status Report

小児リンパ性白血病新規予後因子IKZF1ターゲティング細胞を用いた治療標的の探索

Research Project

Project/Area Number 24591568
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research Institution独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター)

Principal Investigator

服部 浩佳  独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター), その他部局等, その他 (20624513)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 堀部 敬三  独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター), その他部局等, その他 (30209308)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
KeywordsBCP-ALLモデル細胞
Research Abstract

今年度はBCP-ALLモデル細胞を樹立することを目標とした。本研究では体細胞において実際の小児ALLに見られるIKZF1変異を導入することを目標としており、このモデル細胞の樹立が最も重要であり、また予測通り技術的に最も困難なステップであった。従来の組み替え効率の高い細胞を用いるだけではモデル細胞の作成は困難と判断し、Zinc Finger Nuclease(ZFN)を用いることとした。
まず親株となるNalm-6細胞のexon7-8領域のSNPsをPCRおよびダイレクトシーケンシング法により同定し、多型のない部位にZFNの結合域を設定した。同部位に選択的に結合、DNA切断するZFNが完成したので、これを用いて体細胞ターゲティングをこれから行う予定である。
またモデル細胞が作製出来た場合にIKZF1を確かに欠失しているかどうかを検証するためにIKZF1のWestern blottingを用いた検出系を確立中である。Nalm-6細胞で60kDaの野生型の内因性IKZF1は検出することに成功したが、IK-6等の内因性の変異型を検出することにはまだ成功していない。平行して全長(野生型)およびエクソン4-7欠損型(IK-6発現型)の2つのIKZF1を従来型の強制発現系(Plasmid Vector)を用いて作成し、機能実験を行う予定である。野生型は完成し、Western blottingにて予測されたサイズに蛋白分子が発現することを確認した。IK-6発現プラスミドが完成後、全長発現プラスミドを陽性コントロールとし、これらの強制発現系が機能しているということを確かめる予定である。具体的には、下流の標的遺伝子の発現の変化をRT-PCRを用いて観察する予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

モデル細胞の作成が終了する予定であったが、現在のところ完成していない。その理由はいくつか考えられる。まず、親株のトランスフェクション効率が低いこと、Western blottingによる検出系の確立がやや困難なこと、体細胞遺伝子ターゲティングの目標が実際の患者細胞で起こっているスプライシング異常を模倣することであり、高度な技術が要求されること、等が遅れている理由であると考えられる。
しかし、これを理由に技術的に簡易な方向に研究計画を変更することは今のところ考えていない。なぜなら、実際に臨床医学の現場で役に立つ成果を出すためには実際に患者で起こっている病態を再現することが重要であると考えるからである。

Strategy for Future Research Activity

完成したZinc Finger Nuclease(ZFN)発現プラスミドを用いて体細胞ターゲティングを行う。モデル細胞が作製出来た場合には、Western blottiongおよびRT-PCRを用いてまず目的どおりのIK-6型蛋白分子がはつげんしているかどうかを確認する。次いで機能実験を行う予定である。
モデル細胞系を樹立することに成功すれば、治療応用を目指したスクリーニング系
を確立することを目標として、まず低分子阻害剤・RNAi ライブラリーによるIKZF1変異
細胞においてのみ増殖を選択的に抑制する低分子阻害剤あるいはRNAiを同定していく予定である。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

IKZF1選択的Zinc Finger Nuclease(ZFN)、および体細胞遺伝子ターゲティングを行うための試薬の購入に当てる予定である。その他、IKZF1の転写因子としての機能解析のためには新たな発現ベクター、ルシフェラーゼ発現ベクターによる転写活性測定系、クロマチン免疫沈降解析系等のための試薬を購入する予定である。

  • Research Products

    (2 results)

All 2013 2012

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results)

  • [Journal Article] A-type lamins maintain the positional stability of DNA damage repair foci in Mammalian nuclei.2013

    • Author(s)
      Mahen R, Hattori H, Lee M, Sharma P, Jeyasekharan AD, Venkitaraman AR.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 8 Pages: e61893

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0061893.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A DNA-damage selective role for BRCA1 E3 ligase in claspin ubiquitylation, CHK1 activation, and DNA repair.2012

    • Author(s)
      Sato K, Sundaramoorthy E, Rajendra E, Hattori H, Jeyasekharan AD, Ayoub N, Schiess R, Aebersold R, Nishikawa H, Sedukhina AS, Wada H, Ohta T, Venkitaraman AR.
    • Journal Title

      Curr Biol.

      Volume: 22 Pages: 1659-66

    • DOI

      10.1016/j.cub.2012.07.034.

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2014-07-24  

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