2014 Fiscal Year Annual Research Report
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24592285
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| Research Institution | Tokyo Women's Medical University |
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Principal Investigator |
猪狩 勝則 東京女子医科大学, 医学部, 准教授 (80343557)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 薬剤反応性遺伝子 / メトトレキサート / 関節リウマチ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
他のプロジェクトで実施したゲノムワイド関連解析（GWAS）で得られたゲノムワイド多形情報を利用して一次スクリーニングを行った。GWASのプラットフォームにはGenome-Wide Human SNP Array 6.0（アフィメトリクス社）を使用した。Qualitycontrol(QC)および遺伝統計解析の解析プログラムにはフリーソフトウェアであるPLINKを用いた。薬剤反応性としてDAS28変化量を従属変数とし、説明変数に各SNPと調整因子(投与前の疾患活動性、MTX平均投与量、性)を加えたロジスティック回帰分析を行った。解析対象となった患者数は132名であった。その結果、ゲノムワイド水準に達したSNPはなく、申請段階で基準としたP < 1X10-5をクリアしたSNPも存在しなかった。26SNPがP < 1X10-4をクリアしたため、バリデーションを行ったがやはり有意な結果が得られなかった。
この時点で幸い他のプロジェクトとして追加のGWASタイピングを行うことになったので、あらためて一次スクリーニングからやり直すこととなった。GWASのプラットフォームにはHuman Omni Express（イルミナ社）を使用した。この時点で収集していたほぼすべてのDNAサンプルとなる2393例でタイピングを行った。あらためて同様の作業を行い、QC後に607,811SNP、MTX投与データのある678名が解析対象となった。その結果、やはりゲノムワイド水準に達したSNPはなかったが、P < 1X10-5をクリアしたSNPが3つ得られた。18番染色体上のCCBE1（P = 0.0000047）、1番染色体上のRCSD1（P = 0.0000058）、8番染色体上のEFR3A（P = 0.0000084）の近傍もしくはイントロンに存在するSNPであった。一次スクリーニングでほぼ全てのDNAサンプルを使用したため、バリデーションのために新たなDNAサンプルの収集が必要となった。平成27年4月時点で520を超えるサンプル収集に成功している。
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[Journal Article] Construct validity, reliability, response rate, and association with disease activity of the quick disabilities of the arm, shoulder and hand questionnaire in the assessment of rheumatoid arthritis.2015
Author(s)
Ochi K, Iwamoto T, Saito A, Ikari K, Toyama Y, Taniguchi A, Yamanaka H, Momohara S.
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Journal Title
Mod Rheumatol.
Volume: X
Pages: X
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] An association between the 74th amino acid position of HLA-DRB1 and ACPA levels of Japanese ACPA-positive RA.2015
Author(s)
Terao C, Suzuki A, Ikari K, Kochi Y, Ohmura K, Katayama M, Nakabo S, Yamamoto N, Suzuki T, Iwamoto T, Yurugi K, Miura Y, Maekawa T, Takasugi K, Kubo M, Saji H, Taniguchi A, Momohara S, Yamamoto K, Yamanaka H, Mimori T, Matsuda F.
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Journal Title
Arthritis Rheumatol.
Volume: X
Pages: X
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] A main contribution of DRB1*04:05 among shared epitope and involvement of 57th DRB1 amino acid in association with joint destruction in ACPA(+) RA.2015
Author(s)
Terao C, Yano K, Ikari K, Furu M, Yamakawa N, Yoshida S, Hashimoto M, Ito H, Fujii T, Ohmura K, Yurugi K, Miura Y, Maekawa T, Taniguchi A, Momohara S, Yamanaka H, Mimori T, Matsuda F.
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Journal Title
Arthritis Rheumatol.
Volume: X
Pages: X
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Effects of smoking and shared epitope on the production of ACPA and RF in a Japanese adult population: The Nagahama Study.2014
Author(s)
Terao C, Ohmura K, Ikari K, Kawaguchi T, Takahashi M, Setoh K, Nakayama T, Kosugi S, Sekine A, Tabara Y, Taniguchi A, Momohara S, Yamanaka H, Yamada R, Matsuda F, Mimori T; on behalf of the Nagahama Study Group.
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Journal Title
Arthritis Care Res (Hoboken).
Volume: 66
Pages: 1818-27
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Recent trends in orthopedic surgery aiming to improve quality of life for those with rheumatoid arthritis: data from a large observational cohort.2014
Author(s)
Momohara S, Inoue E, Ikari K, Ochi K, Ishida O, Yano K, Sakuma Y, Yoshida S, Koyama T, Koenuma N, Taniguchi A, Yamanaka H.
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Journal Title
J Rheumatol.
Volume: 41
Pages: 862-6
DOI
Peer Reviewed
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