• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2013 Fiscal Year Annual Research Report

ヒト組織中の修飾核酸の病理学的意義

Research Project

Project/Area Number 24659161
Research InstitutionHamamatsu University School of Medicine

Principal Investigator

椙村 春彦  浜松医科大学, 医学部, 教授 (00196742)

KeywordsDNA 付加体 / TET / TDG / IDH / 塩基修復
Research Abstract

ヒト組織中から酸化防止剤存在下で、DNA付加体といわれる種々の修飾核酸あるいは修飾塩基の同定を試みた。
exocyclic etheno DNA adductあるいはそのalkane substituted formを中国の胃癌endemic areaと本邦の胃癌切除例の胃粘膜に同定することができ、7種の付加体の定量的profileが、両groupの判別に役立つことをはじめて示した。これらのalkane substituted exocyclic etheno DNA adduct のうち、比較的小さなものについては、mutagenicity が証明されているものもあり、つぎにこの背景の胃粘膜に生じた胃癌のmutation spectrumを検索した。p53のcoding 領域をしらべた範囲ではあるが、変異部位、変異spectrum とくにtripletで比較した際のmutation signatureに差があるようであった。詳細な統計学的解析を実行中である。
最終年度においては、胃粘膜にみられるさらに小さな付加体としてしられるhmdC (hydroxy methyl deoxy cytidine)をstable isotopeを用いて定量的に測定することに成功し、腫瘍部での低下を発見した。同時にTET1,2,3; IDH1,2; TDGといったCytosineのメチル化をはじめとする修飾に関わる酵素の発現を調べ、TET2の発現とhmdCとの相関などを明らかにした。
胃粘膜は部位による多様性があり、また腫瘍発生部位との距離によりこのような時に変異原性があり、環境要因で変動するDNA付加体の部位別の量の変化を同定することが重要かと思われた。

  • Research Products

    (9 results)

All 2014 2013

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Identification and association study with lung cancer for novel insertion polymorphisms of human endogenous retrovirus.2013

    • Author(s)
      Kahyo T, Sugimura H et al.
    • Journal Title

      Carcinogenesis.

      Volume: 34 Pages: 2531-8

    • DOI

      doi: 10.1093/carcin/bgt253.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lipid peroxidation-induced DNA adducts in human gastric mucosa.2013

    • Author(s)
      Matsuda T, Sugimura H et al.
    • Journal Title

      Carcinogenesis

      Volume: 34 Pages: 121-7

    • DOI

      doi: 10.1093/carcin/bgs327

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SGOL1 variant B induces abnormal mitosis and resistance to taxane in non-smal2013

    • Author(s)
      Matsuura S, Sugimura H et al.
    • Journal Title

      Sci Rep

      Volume: 3 Pages: 3012

    • DOI

      doi: 10.1038/srep03012.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Internal frontier: the pathophysiology of the small intestine.2013

    • Author(s)
      Sugimura H and Osawa S
    • Journal Title

      World J Gastroenterol.

      Volume: 19 Pages: 161-4

    • DOI

      doi: 10.3748/wjg.v19.i2.161.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Visualization of phosphatidylcholine (16:0/16:0) in type II alveolar epithelial cells in the human lung using imaging mass spectrometry.2013

    • Author(s)
      Kurabe N, Sugimura H et al.
    • Journal Title

      Pathol Int.

      Volume: 63 Pages: 195-200

    • DOI

      doi: 10.1111/pin.12050.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] The origin of human cancer, a lesson from molecular epidemiology of gastric cancer2014

    • Author(s)
      Haruhiko Sugimura
    • Organizer
      101st Indian Science Congress
    • Place of Presentation
      Jammu, India
    • Year and Date
      20140203-20140207
    • Invited
  • [Presentation] Quantitative Analysis of 5-hydroxymethylcytosine in Gastric Cancer by Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry2013

    • Author(s)
      Du Chunping, Haruhiko Sugimura et al.
    • Organizer
      the 4th JCA-AACR Special Joint Conference
    • Place of Presentation
      Tokyo Bay Maihama Hotel Club Resort, Chiba, Japan
    • Year and Date
      20131216-20131218
  • [Presentation] Germline CDH1 copy changes in diffuse gastric cancer2013

    • Author(s)
      Yamada H, Sugimura H et al.
    • Organizer
      the 4th JCA-AACR Special Joint Conference
    • Place of Presentation
      Tokyo Bay Maihama Hotel Club Resort, Chiba, Japan
    • Year and Date
      20131216-20131218
  • [Presentation] Towards the Genetics and Genomics of Diffuse Gastric Cancer2013

    • Author(s)
      Hiromi Sakamoto, Haruhiko Sugimura et al.
    • Organizer
      the 4th JCA-AACR Special Joint Conference
    • Place of Presentation
      Tokyo Bay Maihama Hotel Club Resort, Chiba, Japan
    • Year and Date
      20131216-20131218
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi