2013 Fiscal Year Annual Research Report
先端的ゲノミクスによる先天異常症の腫瘍と発達障害に関与する分子病態の統合的解析
Project/Area Number |
24659491
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
滝田 順子 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (00359621)
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Keywords | 神経芽腫 / 横紋筋肉腫 / 発達障害 / exome解析 / CSMD2 / CNTN6 |
Research Abstract |
発達障害と腫瘍発生の双方に関与する分子病態を解明し、両方の病態に有効な新規分子標的薬開発のための分子学的基盤を構築するために、広汎性発達障害と神経芽腫を併発した患児(症例1)および重度の精神発達障害を合併した横紋筋肉腫の患児(症例2)の初発、再発の腫瘍検体を用いて、HiSeq2000によるexome解析を行った。 症例1におけるexome解析の結果、腫瘍細胞に特異的なアミノ酸置換の変化を伴うsomatic変異は初発検体で5個、再発検体で32個検出された。初発、再発腫瘍で共通する変異はALKの1174ミスセンス変異のみであった。germline変異としては、SNPのデータベースに登録のない、かつアミノ酸置換の変化を伴うものとしては約300個検出された。この中には、家族性のミオクローヌスてんかんの原因遺伝子と考えられるCSMD2のミスセンス変異が含まれていた。CSMD2は胎児脳や中枢神経系で高発現している膜貫通蛋白であるが、機能に関しては十分に解明されていない。うつ病や他の精神疾患との関連性も報告されている。興味深いことに、この遺伝子は神経芽腫で高頻度に欠失している1p34領域に存在するが、本症例の腫瘍でもこの領域の欠失が確認されている。 症例2では、腫瘍細胞に特異的なアミノ酸置換の変化を伴うsomatic変異は初発検体で9個、再発検体で24個検出された。初発、再発腫瘍で共通するドライバー変異は確認されなかった。本症例特異的なgermline変異は約450個検出された。この中に神経発達に関与する接着分子であるCNTN6が含まれていた。この遺伝子は自閉症の発症に関与することが知られており、また卵巣がんなどではがん抑制遺伝子と考えられている。以上の結果より、CSMD2およびCNTN6の異常は、自験例において発達障害と腫瘍発生の双方に関与する標的分子の一つである可能性が示唆された。
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Research Products
(55 results)
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[Journal Article] Biallelic DICER1 mutations in sporadic pleuropulmonary blastoma.2014
Author(s)
Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Shimamura T, Sato Y, Nishimura R, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kato K, Kato M, Hanada R, Nomura Y, Park MJ, Ishida T, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J.
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Journal Title
Cancer Res.
Volume: in press
Pages: Epub
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genome-wide approach to identify second gene targets for malignant rhabdoid tumors using high-density oligonucleotide microarrays.2014
Author(s)
Takita J, Chen Y, Kato M, Ohki K, Sato Y, Ohta S, Sugita K, Nishimura R, Hoshino N, Seki M, Sanada M, Oka A, Hayashi Y, Ogaw S.
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Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 105
Pages: 258-64
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Comparison of intravenous with oral busulfan in allogeneic hematopoietic stem cell transplantation with myeloablative conditioning regimens for pediatric acute leukemia.2013
Author(s)
Kato M, Takahashi Y, Tomizawa D, Okamoto Y, Inagaki J, Koh K, Ogawa A, Okada K, Cho Y, Takita J, Goto H, Sakamaki H, Yabe H, Kawa K, Suzuki R, Kudo K, Kato K.
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Journal Title
Biol Blood Marrow Transplant.
Volume: 19
Pages: 1690-1694
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Mutational analyses of the ATP6V1B1 and ATP6V0A4 genes * in patients with primary distal renal tubular acidosis.2013
Author(s)
Miura K, Sekine T, Takahashi K, Takita J, Harita Y, Ohki K, Park M-J, Hayashi Y, Tajima A, Ishihara M, Hisano M, Murai M, Igarashi T.
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Journal Title
Nephrol Dial Transplant.
Volume: 28
Pages: 2123-2130
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Characterization of genetic lesions in rhabdomyosarcoma using a high-density single nucleotide polymorphism array.2013
Author(s)
Nishimura R, Takita J, Sato-Otsubo A, Kato M Koh K, Hanada R, Tanaka Y, Kato K, Maeda D, Fukayama M, Sanada M, Hayashi Y, Ogawa S.
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Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 104
Pages: 856-864
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] ADORA2A polymorphism predisposes children to encephalopathy with febrile status epilepticus.2013
Author(s)
Shinohara M, Saitoh M, Nishizawa D, Ikeda K, Hirose S, Takanashi J, Takita J, Kikuchi K, Kubota M, Yamanaka G, Shiihara T, Kumakura A, Kikuchi M, Toyoshima M, Goto T, Yamanouchi H, Mizuguchi M.
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Journal Title
Neurology
Volume: 80
Pages: 1571-1576
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Aggressive transformation of juvenile myelomonocytic leukemia associated with duplication of oncogenic KRAS in consequence of acquired uniparental disomy.2013
Author(s)
Kato M, Yasui N, Seki M, Kishimoto H, Sato-Otsubo A, Hasegawa D, Kiyokawa N, Hanada R. Ogawa S, Manabe A, Takita J, Koh K.
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Journal Title
J Pediatr.
Volume: 162
Pages: 1285-1288
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Genetic Landscapes Of Childhood T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia.2013
Author(s)
Seki M, Nishimura R, Hoshino N, Okuno Y, Yoshida K, Shiraishi Y, Sanada M, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
American Society of Hematology 2013
Place of Presentation
New Orleans, U.S.A.
Year and Date
20131207-20131210
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[Presentation] Genome-wide analysis of relapsed T cell acute lymphoblastic leukemia.2013
Author(s)
Seki M, Hoshino N, Nishimura R, Okuno Y, Shiraishi Y, Yoshida K, Kato M, Koh K, Hanada R, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 75th Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology
Place of Presentation
Sapporo
Year and Date
20131011-20131013
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[Presentation] Whole-exome resequencing reveals novel pathogenetic gene mutations in pediatric AML.2013
Author(s)
Shiba N, Yoshida K, Okuno Y, Shiraishi Y, Nagata Y, Kon A, Chiba K, Tanaka H, Ohki K, Kato M, Terui K, Park MJ, Kanazawa T, Takita J, Kudo K, Arakawa H, Ito E, Sanada M, Miyano S, Ogawa S, Hayashi Y:
Organizer
The 75th Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology,
Place of Presentation
Sapporo
Year and Date
20131011-20131013
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[Presentation] Identification of Somatic and Germline Mutations using Whole exome sequencing of hepatoblastoma.2013
Author(s)
Hoshino N, Nishimura R, Seki M, Okuno Y, Shiraishi Y, Sato Y, Yoshida K, Miyano S, Hahashi Y, Iwanaka T, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 45th Congress of the International Society of Paediatric Oncology
Place of Presentation
Hong Kong
Year and Date
20130925-20130928
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[Presentation] The Genetic landscapes of rhabdomyosarcoma.2013
Author(s)
Nishimura R, Yoshida K, Shiraishi Y, Okuno Y, Seki M, Hoshimo N, Sanada M, Hayashi Y, Miyano S, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 45th Congress of the International Society of Paediatric Oncology
Place of Presentation
Hong Kong
Year and Date
20130925-20130928
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[Presentation] ターゲットキャプチャーを用いた神経芽腫におけるエピジェネティック関連遺伝子の網羅的ゲノム解析.2013
Author(s)
星野論子, 西村力, 関正史, 奥野友介, 吉田健一, 白石友一, 宮野悟, 林泰秀, 小川誠司, 岩中督, 滝田順子
Organizer
第50回 日本小児外科学会学術集会
Place of Presentation
東京
Year and Date
20130530-20130601
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[Presentation] Exome sequencing analysis in rhabdomyosarcoma including metastatic or relapsed tumors.2013
Author(s)
Nishimura R, Yoshida K, Shiraishi Y, Okuno Y, Seki M, Hoshino N, Sanada M, Hayashi Y, Miyano S, Ogawa S, Takita J
Organizer
9th ASPR Congress
Place of Presentation
Malaysia
Year and Date
20130509-20130512
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[Presentation] Genome-wide approach to identify gene targets of pleuropulmonary blastoma.2013
Author(s)
Seki M, Nishimura R, Okuno Y, Yoshida K, Shiraishi Y, Sanada M, Kato K, Hayashi Y, Miyano S, Ogawa S, Takita J
Organizer
American Association for Cancer Research 2013
Place of Presentation
Washington DC, U.S.A.
Year and Date
20130406-20130410
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[Presentation] T細胞性ALLにおける網羅的ゲノム解析
Author(s)
樋渡光輝, 関正史, 西村力, 星野論子, 奥野雄介, 白石悠一, 吉田健一, 林泰秀, 加藤元博, 康勝好, 花田良二, 宮野悟, 小川誠司, 滝田順子
Organizer
北関東小児がん学会
Place of Presentation
群馬
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