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2012 Fiscal Year Annual Research Report

計算生体力学による微小循環系の細胞の機能と環境の相互作用の解明

Research Project

Project/Area Number 24680048
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (A)

Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

今井 陽介  東北大学, 大学院・工学研究科, 助教 (60431524)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywordsバイオメカニクス / 計算力学 / 赤血球 / 細胞 / GPU計算
Research Abstract

微小循環系の細胞流動を計算するため,赤血球を始めとする細胞を内部流体と膜からなるカプセルで近似し,膜の固体力学に対する有限要素法と,細胞内外の流体力学に対する境界要素法あるいは格子ボルツマン法と連立する計算力学モデルを開発した.これをGraphics processing unit(GPU)計算として完全実装し,様々な条件下での細胞流動を大規模パラメトリック計算するための手法を構築した.
赤血球流動によって生じる力学環境を定量化するため,せん断流れおよび管内流れにおける赤血球の変形量,張力,さらに粒子応力テンソル,自己拡散テンソルを解析した.これにより,管内流れにおいて赤血球の変形量は管中央,中間部,管壁近傍の三つの領域に区分できることを明らかにした.
血小板血栓,白血球の免疫機能,マラリア感染による微小循環閉塞,がん細胞の血行性転移などに関わる細胞の接着現象はマルチステップの現象であり,この最初のステップは,細胞が管壁近傍へと移動するMarginadonである.細胞の大きさ,硬さ,赤血球体積率,血管径をパラメータとする大規模パラメトリック計算を行い,これらの細胞と赤血球の三次元的な相互作用の詳細とMarginadonとの関係を明らかにした.
血小板は血管の損傷部に一次血栓を形成する.過去の研究では赤血球から受けるせん断力によって血栓が小さくなると報告されていたが,これらの研究では赤血球の変形能を無視していた.赤血球が変形能をもつ場合にはこれは誤りであり,血管壁と血栓の隙間を赤血球は大変形をして通過するため,血栓の大きさや形成速度に与える影響が小さいこと,一方で赤血球の変形量は血栓形成によって増大することを明らかにした.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

平成24年度に開発した細胞流動のGPU計算手法は,京コンピュータで実施される規模の計算を研究室のクラスタで実行できるものであり,バイオメカニクス分野はもちろん計算力学分野においても最先端であるとして,国内外の学会で招待講演を依頼されるなど非常に注目されている.また,当初の計画では平成25年度に実施予定であった赤血球と血栓の相互作用についても雑誌論文を発表し,また膜タンパクのligand-receptor結合の計算力学モデルについても既に開発を始めており,成果だけでなく進捗状況も計画を上回るものである.

Strategy for Future Research Activity

当初の計画どおり,平成25年度はligand-receptor結合の計算力学モデルの開発を完了し,Marginationに続くTethehng,Rolling,Firmadhesionの接着過程について大規模パラメトリック計算を実施し,血小板,白血球,マラリア感染赤血球,がん細胞の接着現象と細胞環境の相互作用を解明していく.

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

次年度使用額は,今年度の研究を効率的に推進したことに伴い発生した未使用額であり,平成25年度請求額とあわせ,平成25年度の研究遂行に使用する予定である.

  • Research Products

    (13 results)

All 2013 2012

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Membrane tension of red blood cells pairwisely interacting in simple shear flow2013

    • Author(s)
      T. Omori
    • Journal Title

      Journal of Biomechanics

      Volume: 46 Pages: 548-553

    • DOI

      10.1016/j.jbiomech.2012.09.017

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Shear-induced diffusion of red blood cells in a semi-dilute suspension2013

    • Author(s)
      T. Omori
    • Journal Title

      Journal of Fluid Mechanics

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quantification of red blood cell deformation at high-hematocrit blood flow in microvessels2012

    • Author(s)
      D. Alizadehrad
    • Journal Title

      Journal of Biomechanics

      Volume: 45 Pages: 2684-2689

    • DOI

      10.1016/j.jbiomech.2012.08.026

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Computationalanalysis on the mechanical interaction between thrombus and red blood cells: Possible causes of membrane damage of red blood cells at microvessels2012

    • Author(s)
      H. Kamada
    • Journal Title

      Medical Engineering and Physics

      Volume: 34 Pages: 1411-1420

    • DOI

      10.1016/j.medengphy.2012.01.003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tension of red blood cell membrane in simple shear flow2012

    • Author(s)
      T. Omori
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 86 Pages: 056321

    • DOI

      10.1103/PhysRevE.86.056321

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Computational biomechanics of blood flow from cellular to organ scales2013

    • Author(s)
      T. Yamaguchi
    • Organizer
      Advances in Computational Mechanics 2013
    • Place of Presentation
      San Diego, California, USA(招待講演)
    • Year and Date
      2013-02-26
  • [Presentation] Application of GPU computing to physiological flow simulations2013

    • Author(s)
      Y. Imai
    • Organizer
      Advances in Computational Mechanics 2013
    • Place of Presentation
      San Diego, California, USA(招待講演)
    • Year and Date
      2013-02-26
  • [Presentation] Analysis of Red Blood Cell Behavior in a Narrow Tube2012

    • Author(s)
      H. Hosaka
    • Organizer
      American Physical Society 65th Annual DFD Meeting
    • Place of Presentation
      San Diego, California, USA
    • Year and Date
      2012-11-19
  • [Presentation] Off-plane motion of a non-spherical capsule in simple shear flow2012

    • Author(s)
      T. Omori
    • Organizer
      American Physical Society 65th Annual DFD Meeting
    • Place of Presentation
      San Diego, California, USA
    • Year and Date
      2012-11-19
  • [Presentation] Gradient diffusion 6f red blood cells in blood flow through a Y-shape microchannel2012

    • Author(s)
      C. Cuang
    • Organizer
      American Physical Society 65th Annual DFD Meeting
    • Place of Presentation
      San Diego, California, USA
    • Year and Date
      2012-11-18
  • [Presentation] Development of a GPU-Implemented BEM solver for biological cell suspensions2012

    • Author(s)
      Y. Imai
    • Organizer
      International Computational Mechanics Symposium 2012
    • Place of Presentation
      Kobe
    • Year and Date
      2012-10-11
  • [Presentation] Lateral migration of capsules in a near-wall shear flow2012

    • Author(s)
      S. Nix
    • Organizer
      International Computational Mechanics Symposium 2012
    • Place of Presentation
      Kobe
    • Year and Date
      2012-10-11
  • [Presentation] Computational analysis on the mechanical interaction between a thrombus and re2012

    • Author(s)
      H. Kamada
    • Organizer
      6th European Congress on Computational Methods in Applied Science and Engineering
    • Place of Presentation
      Vienna, Austria
    • Year and Date
      2012-09-13

URL: 

Published: 2014-07-16  

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