• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2013 Fiscal Year Annual Research Report

計算生体力学による微小循環系の細胞の機能と環境の相互作用の解明

Research Project

Project/Area Number 24680048
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

今井 陽介  東北大学, 工学(系)研究科(研究院), 特任准教授 (60431524)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywordsバイオメカニクス / 計算力学 / 赤血球 / 細胞 / GPU計算
Research Abstract

微小循環系の細胞流動を計算するため,これまでに,赤血球を始めとする細胞を内部流体と膜からなるカプセルで近似し,膜の固体力学に対する有限要素法と,細胞内外の流体力学に対する境界要素法あるいは格子ボルツマン法と連立し,Graphics Processing Unit(GPU)を用いて計算する計算手法を開発してきた.平成25年度はこれによる大規模パラメトリック計算を用いて,様々な条件下における細胞流動現象を解析した.
赤血球流動によって生じる力学環境を定量化するため,準希薄カプセル懸濁液と濃厚カプセル懸濁液のレオロジー解析をそれぞれ実施し,粒子応力テンソルおよび自己拡散テンソルを算出し,それらとカプセルの変形および配向角度との関係を明らかにした.
白血球の流動について,管径,白血球の変形能,赤血球体積率に対する大規模パラメトリック計算を実施し,細動脈相当のせん断速度においても,赤血球の追い越し挙動によって白血球の Margination が効果的に生じることを示した.また,細動脈相当のせん断速度では,Marginationした白血球と血管壁間の距離は,接着を可能とする距離に比べ十分小さくないことを明らかにした.
がん細胞の流動についても同様のパラメトリック計算を実施し,管径が大きくなると,白血球と同じく Train から Margination へと運動が移行することを示した.
さらに,血小板血栓形成に関する膜タンパクのligand-receptor結合を計算力学モデル化し,shear-induced platelet aggregation の影響を明らかにした.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

本研究課題において開発した細胞流動のGPU計算手法は,当初の予測を超える計算速度を有していたため,研究計画を上回る速度で研究が進行し,さらに計画を超える範囲の大規模パラメトリック計算が可能となっている.赤血球流動の大規模計算についてJournal of Biomechanical Science and Engineering の JBSE Graphics of the Year Award, 細胞懸濁液のGPU計算とレオロジー特性について流体ー構造連成計算の国際会議にてPoster Award (Second Place)を受賞し,また,白血球やがん細胞の流動について,生体力学のアジア太平洋最大の国際会議 7th Asian-Pacific Conference on Biomechanics
にて APCB 2013 Award を受賞した.生体医工学,計算力学,GPUに関する国内外の学会において招待講演を依頼されるなど非常に注目されており,当初の計画以上に進展していると判断している.

Strategy for Future Research Activity

当初の計画どおり,平成26年度は,マラリア感染赤血球による微小循環障害,白血球の生理機能,がん細胞の血行性転移に関連する流動および接着現象について,それぞれがどのような共通点をもち,どのような相違点があるのか明らかにする.またこれまでに開発してきた細胞モデルを血管内皮細胞に応用する.

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

次年度使用額は,今年度の研究を効率的に推進したことに伴い発生した未使用額である.
平成26年度請求額とあわせ,平成26年度の研究遂行に使用する予定である.

  • Research Products

    (19 results)

All 2014 2013

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Hydrodynamic interaction between two red blood cells in simple shear flow: its impact on the rheology of a semi-dilute suspension2014

    • Author(s)
      Omori, T., Ishikawa, T., Imai, Y., Yamaguchi, T.
    • Journal Title

      Computational Mechanics

      Volume: 54 Pages: 933-941

    • DOI

      10.1007/s00466-014-0997-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Numerical analysis of a red blood cell flowing through a thin micropore2014

    • Author(s)
      T. Omori, H. Hosaka, Y. Imai, T. Yamaguchi, T. Ishikawa
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 89 Pages: 013008

    • DOI

      10.1103/PhysRevE.89.013008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fluctuation of cilia-generated flow on the surface of the tracheal lumen2014

    • Author(s)
      K. Kiyota, H. Ueno, K. Numayama-Tsuruta, T. Haga, Y. Imai, T. Ishikawa, T. Yamaguchi
    • Journal Title

      American Journal of Physiology Lung Cellular and Molecular Physiology

      Volume: 306 Pages: L144-L151

    • DOI

      10.1152/ajplung.00117.2013

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Separation of motile bacteria using drift velocity in a microchannel2014

    • Author(s)
      T. Ishikawa, T. Shioiri, K. Numayama-Tsuruta, H. Ueno, Y. Imai, T. Yamaguchi
    • Journal Title

      Lab on a Chip

      Volume: 14 Pages: 1023-1032

    • DOI

      10.1039/C3LC51302E

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Antral recirculation in the stomach during gastric mixing2013

    • Author(s)
      Y. Imai, I. Kobayashi, S. Ishida, T. Ishikawa, M. Buist, T. Yamaguchi
    • Journal Title

      American Journal of Physiology Gastrointestinal and Liver Physiology

      Volume: 304 Pages: G536-G542

    • DOI

      10.1152/ajpgi.00350.2012

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Shear-induced diffusion of red blood cells in a semi-dilute suspension2013

    • Author(s)
      T. Omori, T. Ishikawa, Y. Imai, T. Yamaguchi
    • Journal Title

      Journal of Fluid Mechanics

      Volume: 724 Pages: 154-174

    • DOI

      10.1017/jfm.2013.159

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Computational study on thrombus formation regulated by platelet glycoprotein and blood flow shear2013

    • Author(s)
      H. Kamada, Y. Imai, M. Nakamura, T. Ishikawa, T. Yamaguchi
    • Journal Title

      Microvascular Research

      Volume: 89 Pages: 95-106

    • DOI

      10.1016/j.mvr.2013.05.006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Entrapment of ciliates at the water-air interface2013

    • Author(s)
      J. Ferracci, H. Ueno, K. Numayama-Tsuruta, Y. Imai, T. Yamaguchi, T. Ishikawa
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 8 Pages: e75238

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0075238

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Rheological analysis of dense capsule suspension under Stokes flow condition2014

    • Author(s)
      D. Matsunaga, Y. Imai, T. Yamaguchi, T. Ishikawa
    • Organizer
      Advances in Computational Fluid-Structure Interaction and Flow Simulation
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      20140319-20140321
  • [Presentation] Numerical analysis of margination of a cancer cell in microcirculation2013

    • Author(s)
      N. Takeishi, Y. Imai, T. Yamaguchi, T. Ishikawa
    • Organizer
      5th Aisa Pacific Congress on Computational Mechanics
    • Place of Presentation
      Singapore, Singapore
    • Year and Date
      20131211-20131214
  • [Presentation] A numerical analysis of a capsule containing multiple small capsules in simple shear flow2013

    • Author(s)
      Y. Ichikawa, Y. Imai, D. Matsunaga, T. Yamaguchi, T. Ishikawa
    • Organizer
      5th Aisa Pacific Congress on Computational Mechanics
    • Place of Presentation
      Singapore, Singapore
    • Year and Date
      20131211-20131214
  • [Presentation] Viscoelasticity of dilute capsule suspension under Stokes flows2013

    • Author(s)
      D. Matsunaga, Y. Imai, T. Yamaguchi, T. Ishikawa
    • Organizer
      66th Annual Meeting of the APS Division of Fluid Dynamics
    • Place of Presentation
      Pittsburgh, USA
    • Year and Date
      20131124-20131126
  • [Presentation] Integrated nano-biomechanics for physiological flow problems2013

    • Author(s)
      T. Yamaguchi, Y. Imai, T. Omori, H. Ueno, K. Numayama-Tsuruta, T. Ishikawa
    • Organizer
      7th Asian Pacific Conference on Biomechanics
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      20130829-20130831
    • Invited
  • [Presentation] A numerical analysis of the rheology of capsule suspensions containing different size capsules2013

    • Author(s)
      H. Ito, Y. Imai, D. Matsunaga, T. Yamaguchi, T. Ishikawa
    • Organizer
      7th Asian Pacific Conference on Biomechanics
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      20130829-20130831
  • [Presentation] Margination of white blood cell in various sizes of circular micro-channel2013

    • Author(s)
      N. Takeishi, Y. Imai, T. Ishikawa, T. Yamaguchi
    • Organizer
      7th Asian Pacific Conference on Biomechanics
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      20130829-20130831
  • [Presentation] Mechanism of capsule migration near a plane wall2013

    • Author(s)
      S. Nix, Y. Imai, D. Matsunaga, T. Ishikawa, T. Yamaguchi
    • Organizer
      7th Asian Pacific Conference on Biomechanics
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      20130829-20130831
  • [Presentation] Modeling of cytoadhesion in malaria infection2013

    • Author(s)
      A. Ami, Y. Imai, T. Ishikawa, T. Yamaguchi
    • Organizer
      7th Asian Pacific Conference on Biomechanics
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      20130829-20130831
  • [Presentation] GPUを用いた生体流れの計算バイオメカニクス2013

    • Author(s)
      今井陽介
    • Organizer
      GPU Technology Conference Japan 2013
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20130730-20130730
    • Invited
  • [Presentation] A cellular flow simulation on graphics processing unit2013

    • Author(s)
      Y. Imai, N. Takeishi, A. Ami, T. Ishikawa, T. Yamaguchi
    • Organizer
      5th International Conference on Coupled Problems in Science and Engineering
    • Place of Presentation
      Ibiza, Spain
    • Year and Date
      20130617-20130619
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi