ターゲットリシークエンスを利用した統合失調症感受性遺伝子の同定

2013 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 24689046
• Research Institution: Fujita Health University
• Principal Investigator: 池田 匡志 藤田保健衛生大学, 医学部, 講師 (60424933)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2014-03-31
• Keywords: 精神科遺伝学

Research Abstract

統合失調症のリスクとなりうる遺伝要因は、頻度の高い遺伝子多型のみでは説明できないことが判明し、現在では「稀かつ効果の大きい」変異による疾患への関与を想定するMultiple rare variant仮説が提唱されている。
本研究では、ターゲットとなりうる領域を過去の知見を基に、1）MRや自閉症とのpleiotrophyを考慮したCNV領域、　2）統合失調症全ゲノムSNP研究のmega解析(PGC, 2011, Nat Genet)、などの遺伝子群の２５９遺伝子に絞込み（3067領域、おおよそ900Mb）、そのエクソン領域のターゲットリシークエンスを行うことを目的した。統合失調症503名[若年発症型（EOS）302名と晩年発症型(LOS）201名]及び296名のコントロールを対象とし、全体の変異の個数がcaseで多いかどうかを検討するburden解析（統合失調症全体あるいはEOS）を施行した。
その結果、Quality controlにより、確度の高い変異（nonsense、frame shiftを起こすins/del）が53個同定された。統合失調症全体（EOS+LOS）とコントロールの比較では有意なenrichmentは見られなかったが、EOSとコントロールの比較では、EOSにそれら変異が多い傾向にあった（P=0.087: singletonのみを対象）。しかし、サンプル数を拡大した追試研究では、同じ傾向は認められるものの有意ではなかったため、今後さらにサンプル数を増やした追試研究が必要である。

Current Status of Research Progress

Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Genetic association study between the detected risk variants based upon type II diabetes GWAS and psychotic disorders in the Japanese population (2014)
  • Author(s): Kajio Y, Kondo K, Saito T, Iwayama Y, Aleksic B, Yamada K, Toyota T, Hattori E, Ujike H, Inada T, Kunugi H, Kato T, Yoshikawa T, Ozaki N, Ikeda M and Iwata N
  • Journal Title: Journal of human genetics Volume: 59(1) Pages: 54-6
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.116
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genome-wide association study of cognitive decline in schizophrenia (2013)
  • Author(s): Hashimoto R, Ikeda M, Ohi K, Yasuda Y, Yamamori H, Fukumoto M, Umeda-Yano S, Dickinson D, Aleksic B, Iwase M, Kazui H, Ozaki N, Weinberger DR, Iwata N and Takeda M
  • Journal Title: Am J Psychiatry Volume: 170(6) Pages: 683-4
  • DOI: 10.1176/appi.ajp.2013.12091228
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Implication of a rare deletion at distal 16p11.2 in schizophrenia (2013)
  • Author(s): Guha S, Rees E, Darvasi A, Ivanov D, Ikeda M, Bergen SE, Magnusson PK, Cormican P, Morris D, Gill M, Cichon S, Rosenfeld JA, Lee A, Gregersen PK, Kane JM, Malhotra AK, Rietschel M, Nothen MM, Degenhardt F, Priebe L, Breuer R, Strohmaier J, Ruderfer DM, Moran JL, Chambert KD, Sanders AR, Shi J, Kendler K, Riley B, O'Neill T, Walsh D, Malhotra D, Corvin A, Purcell S, Sklar P, Iwata N, Hultman CM, Sullivan PF, Sebat J, McCarthy S, Gejman PV, Levinson DF, Owen MJ, O'Donovan MC, Lencz T and Kirov G
  • Journal Title: JAMA Psychiatry Volume: 70(3) Pages: 253-60
  • DOI: 10.1001/2013.jamapsychiatry.71
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genome-wide association study implicates NDST3 in schizophrenia and bipolar disorder (2013)
  • Author(s): Lencz T, Guha S, Liu C, Rosenfeld J, Mukherjee S, Derosse P, John M, Cheng L, Zhang C, Badner JA, Ikeda M, Iwata N, Cichon S, Rietschel M, Nothen MM, Cheng AT, Hodgkinson C, Yuan Q, Kane JM, Lee AT, Pisante A, Gregersen PK, Pe'er I, Malhotra AK, Goldman D and Darvasi A
  • Journal Title: Nat Commun Volume: 4 Pages: 2739
  • DOI: 10.1038/ncomms3739
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Further evidence of an association between a genetic variant in BMP7 and treatment response to SSRIs in major depressive disorder (2013)
  • Author(s): Esaki K, Kondo K, Hatano M, Saito T, Kishi T, Umene-Nakano W, Yoshimura R, Nakamura J, Ozaki N, Ikeda M and Iwata N
  • Journal Title: Journal of human genetics Volume: 58(8) Pages: 568-9
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.52
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genome-wide association study of atypical psychosis (2013)
  • Author(s): Kanazawa T, Ikeda M, Glatt SJ, Tsutsumi A, Kikuyama H, Kawamura Y, Nishida N, Miyagawa T, Hashimoto R, Takeda M, Sasaki T, Tokunaga K, Koh J, Iwata N and Yoneda H
  • Journal Title: American journal of medical genetics. Part B, Neuropsychiatric genetics : the official publication of the International Society of Psychiatric Genetics Volume: 162B(7) Pages: 679-86
  • DOI: 10.1002/ajmg.b.32164
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genetic variants on 3q21 and in the Sp8 transcription factor gene (SP8) as susceptibility loci for psychotic disorders: a genetic association study. (2013)
  • Author(s): Kondo K, Ikeda M, Kajio Y, Saito T, Iwayama Y, Aleksic B, Yamada K, Toyota T, Hattori E, Ujike H, Inada T, Kunugi H, Kato T, Yoshikawa T, Ozaki N and Iwata N
  • Journal Title: PLos One Volume: 8(8) Pages: e70964
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0070964