2012 Fiscal Year Research-status Report
CNV解析による一卵性双生児の個人識別‐aCGH法とリアルタイムPCR法による‐
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24790645
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Research Institution | Nihon University |
Principal Investigator |
伊澤 光 日本大学, 歯学部, 助教 (30514103)
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Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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Keywords | aCGH / 一卵性双生児 / 個人識別 |
Research Abstract |
2011年までに実施した2組の一卵性双生児の試料に加え、2012年度は3組の双生児の試料を採取した。その3組の一卵性双生児の性染色体(Y:16ローカス、X:8ローカス)および常染色体(15ローカス)上に位置するSTR型検査により、一卵性双生児の確認を行った。3組の双生児はすべて一卵性双生児との申告であったが、1組の双生児は2卵生双生児であることが確定された。2組の一卵性双生児と1組の二卵性双生児のDNAをマイクロアレイを用いたarray comparative genomic hybridization(aCGH法)によるcopy number variation(CNV)解析により個人識別を行った。一卵性双生児のaCGH法解析結果は、おおよその見当がついていたが、二卵性双生児のaCGH法によるCNV解析結果はおこなったことがなく、結果がどのようなものになるのかを知るために、申請時には書かれてはいないが、行っている。 二卵性双生児のaCGH法によるCNV解析結果は、DNAのほぼ全ての部位においてコピー数の変化がみられ、別人であることが確認できた。また、一卵性双生児の2組においては、1組は10箇所、もう1組においては12箇所の部位にCNVが確認され、個人識別は可能であることが確認できた。すでに終了していた2組の一卵性双生児のCNV解析では2組に共通してみられたコピー数の変化があったが、4組に共通するCNV解析によるコピー数の変化はみられなかった。このことにより、一卵性双生児に普遍的なCNV解析によるコピー数の変化は存在しない可能性がでてきた。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
一卵性双生児に普遍的なCNVを検索することにより、リアルタイムPCR装置による相対的定量法による一卵性双生児の個人識別を簡単におこなう予定であったが、今回までの4組の一卵性双生児のaCGH法によるCNV解析結果では共通する部位の普遍的なコピー数の変化を検索することができなかった。このことにより、DNAの特定の部位だけをリアルタイムPCR装置による相対的定量法をおこなうだけでは、個人識別は不可能であると思われる。そのために、複数のプライマーを使用したマルチプレックスにより、一度に数箇所の部位のCNVを検索できるシステムを構築しなければならないことになったが、昨年度までの実験では特に支障はなかったために、順調に進展していると考えた。
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Strategy for Future Research Activity |
一卵性双生児に普遍的なCNVを検索することにより、リアルタイムPCR装置による相対的定量法による一卵性双生児の個人識別を簡単におこなう予定であったが、今回までの4組の一卵性双生児のaCGH法によるCNV解析結果では共通する部位の普遍的なコピー数の変化を検索することができなかった。このことにより、DNAの特定の部位だけをリアルタイムPCR装置による相対的定量法をおこなうだけでは、個人識別は不可能であると思われる。そのために、複数のプライマーを使用したマルチプレックスにより、一度に数箇所の部位のCNVを検索できるシステムを構築しなければならない。また、一個人間での組織・臓器間において同一のCNV解析結果が得られるかを行うことにより、個人識別法をさらに精度の高いものにする必要がある。
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Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
一卵性双生児の症例数を増やすしながらaCGH法を行うとともに、リアルタイムPCR装置による相対定量法による個人識別を行うためにプライマーの設計を行う。
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