2012 Fiscal Year Research-status Report
新規ｉｎ ｓｉｔｕバイオフィルムモデルにおけるエピガロカテキンガレートの影響
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24792020
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
朝日 陽子 大阪大学, 歯学部附属病院, 助教 (50456943)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | バイオフィルム / in situ device |
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| Research Abstract |
これまでのバイオフィルムに関する研究はほとんど単一菌種バイオフィルムによるものであり，複数菌種バイオフィルムモデルに関しても，用いる細菌種に限りがありデンタルプラークとは異なるものであった。一方，本研究で開発したin situバイオフィルムモデルはヒト口腔細菌のバイオフィルムを作製するもので，デンタルプラークを可及的に再現できるシステムであり，デンタルプラーク形成メカニズムを解明する糸口になると考えられる。本研究では，デンタルバイオフィルム形成過程における構成細菌の量，種類の動態を明らかとするために，in situバイオフィルム形成装置を用いて可及的に再現したデンタルバイオフィルムを，経時的に取り出し，定量的解析，走査型電子顕微鏡および透過型電子顕微鏡による形態学的観察を行った。
1.real-time PCRを用いて定量的解析を行った。細菌数は，それぞれ１時間後 6.62E+05 /mm2，４時間後 2.02E+06 /mm2，８時間後 3.18E+06 /mm2，１２時間後 1.22E+07 /mm2，１６時間後 1.05E+07 /mm2，２０時間後 1.26E+07 /mm2，２４時間後 2.34E+07 /mm2，４８時間後 4.70E+08 /mm2であった。バイオフィルム形成１２時間まで急速な増殖が認められたが，その後の増殖は緩やかなものであった。
2.形態学的観察においては，４時間でマイクロコロニーの形成が認められ，８時間後に球菌主体のバイオフィルムが観察された。１２時間後には糸状菌が出現，１６時間後にはマトリックス様構造物で被覆された像が観察された。２４時間および４８時間後には球菌，糸状菌，桿菌の多様な形態から構成されたバイオフィルム形成が認められた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度の研究計画は，in situバイオフィルム形成系を開発し，定量的解析および走査型電子顕微鏡を用いた経時的解析を行うことであったが，バイオフィルム形成系を確立し，経時的に定量的解析および走査型電子顕微鏡と透過型電子顕微鏡によるバイオフィルムの観察を行ったため，おおむね順調に進展していると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後，確立したバイオフィルム形成系を用いて，３次元的検索および定性的解析を行う予定である。
１．３次元的検索１）バイオフィルム形成細菌の生死の観察：バイオフィルムサンプルをLive/Dead® BacLightTM Bacterial Viability Kitsにて染色し，共焦点レーザー顕微鏡（現有設備，右図）を用いてバイオフィルム内の細菌の生・死を解析することでEGCgが，バイオフィルム形成に与える影響を評価する。また，共焦点レーザー顕微鏡で得た画像を立体構築ソフト(Imaris) にて処理し，バイオフィルムの3次元的画像を構築し，EGCgがバイオフィルムの厚みや密度等の立体構造に及ぼす影響について検索を行う。２）バイオフィルム形成細菌種の立体的配置の観察：Fluorescence in situ hybridizationにより，経時的なバイオフィルム構成細菌の変化を3次元的に観察する。バイオフィルムサンプルを，固定・脱水・ハイブリダイズを行った後，共焦点レーザー顕微鏡にて観察する。その後，得られた画像をImarisにて立体構築するとともに，構成細菌の比率を計算する。また，EGCg作用群と比較することで，EGCgがバイオフィルム構成細菌に及ぼす影響を検討する。
２．バイオフィルム構成細菌種の定性解析：バイオフィルムサンプルよりゲノムDNAを回収し，抽出する。得られるDNAより16S rRNA遺伝子を増幅する。PCR産物を大腸菌への形質転換し，プラスミドライブラリーを作成する。その後プラスミドDNAを回収し，シークエンサーによりそれぞれのインサートの塩基配列を決定する。得られる塩基配列を，NCBI database BlastN Programにて照合し，配列解析ソフトによりマルチアライメントを行い，配列間の進化距離を計算して系統樹を作成する。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
３次元的解析の用いる染色キットおよび試薬・器材の購入に使用する予定である。また遺伝子工学的な解析は研究室で行うのに比べて安価かつ時間の短縮が可能なため，外注費を予定している。
本研究で得られる研究成果を，国内外の学会で発表するとともに，国際学術雑誌に投稿し，世界に発信する予定であり，学会経費および投稿経費を計上している。
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Research Products
(2 results)
