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2013 Fiscal Year Annual Research Report

真核生物染色体DNAの複製開始機構

Research Project

Project/Area Number 25251005
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

荒木 弘之  国立遺伝学研究所, 細胞遺伝研究系, 教授 (20151160)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 日詰 光治  国立遺伝学研究所, 細胞遺伝研究系, 助教 (10378846)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
KeywordsDNA複製 / 酵母 / 染色体 / クロマチン / 複製開始
Research Abstract

真核生物の染色体DNA複製では、複製に関与する多数のタンパク質が複製開始領域に集合しDNA合成が開始するが、その詳細な機構については分かっていない。今期は以下の項目について研究を進めた。
1.出芽酵母細胞抽出液を用いたin vitro DNA複製系は、i) G1期細胞抽出液によるpre-Replicative complex (pre-RC)の形成、ii) DDKキナーゼによるpre-RCのリン酸化、iii) S期細胞抽出液によるDNA合成の開始の3つのステップからなる。この系では鋳型DNAをビーズに固定し、i)からii)への移行時にG1期抽出液を除く必要があり、複製効率も低い。そこでi)のステップを精製タンパク質で行い、非固定型の鋳型DNAを用いて、複製の効率化を行った。一方iii)のステップからDNAポリメラーゼε(Polε)を除き、精製したPolεを加えると、複製の減少と回復がおこる。そこに、DNAポリメラーゼ活性ドメインを欠いたPolεを加えると、複製は部分的に回復する。これは、Polεがポリメラーゼ活性以外の機能として複製開始に関与することを直接示すものである。同様の解析をSld3-Sld7, Mcm10タンパク質でも行い、精製標品がin vitro複製の活性を持つことが分かった。さらに、Sld3中央部の構造決定にも成功した。
2.精製ヒストンよりヌクレオソームを再構成したところ、pre-RCの形成及びin vitro複製系において、裸のDNA同様に鋳型となることが分かった。
3.複製開始に関与するDpb11は、CDKキナーゼによりリン酸化されたSld2とSld3がそれぞれN末、C末半分に結合する。同様にチェックポイントに関与するRad9もN末側に結合する。各タンパク質を精製しそれぞれの結合を調べたところ、Sld2がDpb11のC末側に結合するとRad9がN末側に結合しにくくなり、結果としてSld3がN末に結合し易くなることが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

in vitro複製系の効率化が進み、精製タンパク質の活性もわかり、本格的に解析が進める状態になったため。

Strategy for Future Research Activity

in vitro複製系を中心とした解析を今後も続ける。チェックポイントタンパク質との関連については、in vitroで得られた結果に対応するin vivoの結果が現時点では得られず、解析手法を再考する余地がある。

  • Research Products

    (16 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (12 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Concerted interaction between origin recognition complex (ORC), nucleosomes, and replication origin DNA ensures stable ORC-origin binding.2013

    • Author(s)
      Hizume, K., Yagura, M. and Araki, H.
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 18 Pages: 764-779

    • DOI

      10.1111/gtc.12073

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Connection between the initiation of DNA replication and structural change of chromatin2014

    • Author(s)
      Tanaka S., Araki H.
    • Organizer
      新学術「ゲノム普遍的制御」国際シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20140204-20140205
  • [Presentation] 真核生物DNA複製の開始制御におけるクロマチン上への複製開始因子集合の観察2013

    • Author(s)
      日詰光治、矢倉勝、荒木弘之
    • Organizer
      日本顕微鏡学会 走査型プローブ顕微鏡分科会
    • Place of Presentation
      新潟県南魚沼郡
    • Year and Date
      20131208-20131209
  • [Presentation] クロマチンファイバー上でのDNA複製のライセンシング:原子間力顕微鏡による可視化解析2013

    • Author(s)
      日詰光治、矢倉勝、荒木弘之
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] DNA複製開始制御とクロマチン構造変換の接点2013

    • Author(s)
      田中 誠司、大浪 真由美、荒木弘之
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] In vitro study of the initiation of chromosomal DNA replication in budding yeast2013

    • Author(s)
      Yagura, M. Araki H.
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] ORCの複製開始点特異的な結合に寄与するORC/nucleosome/複製開始点DNA間の協調的相互作用2013

    • Author(s)
      日詰光治、矢倉勝、荒木弘之
    • Organizer
      DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20131120-20131122
  • [Presentation] 試験管内反応系を用いた真核生物染色体DNA複製開始機構の解析2013

    • Author(s)
      矢倉勝、 田中尚美、 柳沢好美 、荒木弘之
    • Organizer
      DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20131120-20131120
  • [Presentation] Molecular mechanism of initiation of chromosomal DNA replication in eukaryotic cells2013

    • Author(s)
      Araki H., Makino N., Yagura M., Tanaka Y., Hizume K., and Tanaka S.
    • Organizer
      日本遺伝学会第85回大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20130919-20130921
    • Invited
  • [Presentation] Formation of active replicative helicase in budding yeast2013

    • Author(s)
      Araki H., Yagura M., Makino N., Tanaka Y., Itou H., Hizume K., and Tanaka S.
    • Organizer
      2013 Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on EUKARYOTIC DNA REPLICATION & GENOME MAINTENANCE
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, NY(USA)
    • Year and Date
      20130909-20130913
    • Invited
  • [Presentation] Dpb11/TopBP1-GINS interaction is required for efficient initiation of DNA replication2013

    • Author(s)
      Tanaka, S., Komeda,Y., Umemori,T., Kubota,Y., Takisawa,H., and Araki,H.
    • Organizer
      2013 Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on EUKARYOTIC DNA REPLICATION & GENOME MAINTENANCE
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, NY(USA)
    • Year and Date
      20130909-20130913
  • [Presentation] In vitro study of the initiation of chromosomal DNA replication in budding yeast2013

    • Author(s)
      Yagura, M. Araki H.
    • Organizer
      2013 Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on EUKARYOTIC DNA REPLICATION & GENOME MAINTENANCE
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, NY(USA)
    • Year and Date
      20130909-20130913
  • [Presentation] Establishment of replication forks at origins2013

    • Author(s)
      Araki, H.
    • Organizer
      ゲノム不安定性・進化・ヒトの疾病会議
    • Place of Presentation
      サンクトペテルブルグ、ロシア
    • Year and Date
      20130614-20130617
    • Invited
  • [Book] DNA replication2013

    • Author(s)
      Tanaka, S. and Araki, H.
    • Total Pages
      561 (81-94)
    • Publisher
      Cold Spring Harbor Press
  • [Remarks] Araki Lab.

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/MicGen/index.html

  • [Remarks] DNA複製のスタート地点の決定における、クロマチンの役割

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/Research-Highlights/1170/1270.html

URL: 

Published: 2015-05-28  

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