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2015 Fiscal Year Annual Research Report

海産緑藻の配偶子の異型性と系統関係を考慮した種間形質の比較

Research Project

Project/Area Number 25257406
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

富樫 辰也  千葉大学, 海洋バイオシステム研究センター, 教授 (70345007)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 吉村 仁  静岡大学, 創造科学技術大学院, 教授 (10291957)
四ツ倉 典滋  北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 准教授 (60312344)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2018-03-31
Keywords異型配偶 / 性淘汰 / 性的二型
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、環境の異なる様々な海域において学術調査を行い、系統関係を考慮した種間形質比較を行うことによって、アオサ藻綱の海産緑色藻類に見られる同型配偶から顕著な異型配偶まで多様な配偶システムが進化した適応放散の過程を明らかにすることを目的にしている。これまでに、現生の海産緑藻類に見られる同型配偶には、2つのタイプがあることが明らかになっている。さらに、その後の理論解析によって、これらの2つのタイプの配偶システムいずれも最も原始的なものではないだろうことが示された。

平成27年度は、研究計画通り、アオサ藻綱の海産緑色藻類のなかでも、これまでの研究によってとりわけ精度の高い分子系統解析が可能となったハネモ目においてこれまでに行った研究データの解析を進めた。この目の構成種の多くは、顕著な異型配偶を行っているが、雌性配偶子のサイズには種間で大きな変異が見られるため、配偶子の異型性には幅広い多様性が見られる。ここでは雌性配偶子のサイズのみが重要であるように見られがちであるが、雄性配偶子は小型であるがゆえにわずかなサイズの変異も配偶子の異型性の度合いに大きな影響を与える。

野外調査は、研究代表者(富樫)が中心になって、(研究分担者 吉村、四ツ倉)の支援を受けながら、さらに多くの分類群の海産緑色藻類を対象にして、おもに北米大陸東海岸の米国・マサチューセッツ州の大西洋沿岸で行った。また、比較のための調査をオーストラリア・ビクトリア州のタスマン海沿岸において行った。採集した研究材料からDNAを抽出し、種レベルでの変異の存在が確認されているrbcL領域の塩基配列を解読して分子系統解析を行うとともに、実験室で人工気象器を使用して配偶体を培養することによって有性生殖を誘導し、配偶子のサイズをはじめとする配偶システムの特徴を調べている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究では、現在までに、アオサ藻綱の海産緑色藻類のなかでも雌雄の配偶子サイズに幅広い異型の度合いが見られるハネモ目(Bryopsidales)について、データの蓄積と解析を行うことに成功している。さらに、野外調査によって配偶子の異型性の弱い種を含むさらに多くの種についても雌雄ともに収集し、それぞれ単藻培養系を確立することに成功してきた。これらの株は人工気象器を用いて実験室で安定的に継代培養が出来ているうえ、淡水産緑色藻類のボルボックス目で見られるような保存株における配偶子形成能の消失も見られず、配偶システムに関する知見の蓄積も進んでいる。これらの保存株からDNAを抽出する作業においても、他の多くの藻類で見られるような二次的な代謝産物によるDNA抽出反応の阻害も起きていない。このため、ジェネティックアナライザーを用いて、抽出したDNAサンプルのRUBISCO large subunit (rbcL)領域を中心とした塩基配列の解読が進んでいる。この領域には系統解析を行うために必要な適度の変異もあるようだ。これによって、これまで発表された文献にある分子系統情報も活用しながら、信頼度の高い系統解析が出来ている。これらのデータを基にして、PIC(Phylogenetic Independent Contrast)法に続いてPGLS(Phylogenetic Generalized Least Squares)法を用いた実際の解析を行うことが出来た。

Strategy for Future Research Activity

これまで主に配偶子のサイズ異型性の強いアオサ藻綱ハネモ目(Bryopsidales)の海産緑色藻類を対象にして習得したPICやPGLSなどの系統関係を考慮した種間形質の比較手法を用いて、今後は研究の中心をわずかな異型配偶や同型配偶を行う種に移していく。そこでも、これまで確立してきた手法を応用して、従来のデータに加えて本研究で新たに加えることが出来た種から抽出したDNAを使ってRUBISCO large subunit (rbcL)領域の塩基配列の解読を行う。解読した塩基配列データを基にして、系統解析を行って、系統樹の樹形ならびにそれぞれの枝の長さを求める。得られた系統樹の樹形と枝長のデータを使って、Rを用いたプログラミングを行って、系統関係を考慮しながら、配偶子サイズ、ならびに海産緑色藻類では特にそれと密接に関係している走光性と性フェロモンの組み合わせからなる配偶子の行動と生息場所の環境(特に水深)、ならびに体サイズなどの生活史形質について、種間比較を行う。系統樹の樹形や枝の長さはどのような手法で系統解析を行うかによっても多少の違いが出てくることが一般的であるため、系統解析方法の違いによって種間形質の比較結果がどのような影響を受けるかについても注意しながら結果の考察を行っていく。野外調査計画の立案に当たっては、効率的に配偶体を採集することが出来るよう対象種のフェノロジーに引き続き十分注意する。これによって、本研究の最終的な目的の達成に近づいていく。

  • Research Products

    (31 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (19 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Peer Reviewed: 19 results,  Open Access: 12 results,  Acknowledgement Compliant: 19 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Liverpool(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Liverpool
  • [Journal Article] Seasonal induction of alternative principal pathway for rose flower scent2016

    • Author(s)
      Hiroshi Hirata, Toshiyuki Ohnishi, Kensuke Tomida, Haruka Ishida, Momoyo Kanda, Miwa Sakai, Jin Yoshimura, Hideyuki Suzuki, Takamasa Ishikawa, Hideo Dohra & Naoharu Watanabe
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep20234

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Lazy workers are necessary for long-term sustainability in insect societies2016

    • Author(s)
      Eisuke Hasegawa, Yasunori Ishii, Koichiro Tada, Kazuya Kobayashi & Jin Yoshimura
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep20846

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Host-parasite Red Queen dynamics with phase-locked rare genotypes2016

    • Author(s)
      Jomar Fajardo Rabajante, Jerrold Tubay, Hiromu Ito, Takashi Uehara, Satoshi Kakishima, Satoru Morita, Jin Yoshimura & Dieter Ebert
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 2 Pages: -

    • DOI

      10.1126/sciadv.1501548

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Catch and cultivation of Saccharina japonica in Northern Hokkaido, Japan, and southern Sakhalin and Primorye, Russia2016

    • Author(s)
      Tadashi Kawai, Dmitrii Galanin, Tatiana N Krupnova, Norishige Yotsukura
    • Journal Title

      Algal Resources

      Volume: 8 Pages: 155-163

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Genetic differences among varieties of Saccharina japonica in northern Japan as determined by AFLP and SSR analyses2016

    • Author(s)
      Norishige Yotsukura, Takashi Maeda, Tsuyoshi Abe, Masahiro Nakaoka, Tadashi Kawai
    • Journal Title

      Journal of Applied Phycology

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1007/s10811-016-0807-6

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Evidence for equal size cell divisions during gametogenesis in a marine green alga, Monostroma angicava2015

    • Author(s)
      Togashi, T., Y. Horinouchi, H. Sasaki and J. Yoshimura
    • Journal Title

      Scientific Report

      Volume: 5 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep13672

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Red Queen dynamics in multi-host and multi-parasite interaction system2015

    • Author(s)
      Jomar F. Rabajante, Jerrold M. Tubay, Takashi Uehara, Satoru Morita, Dieter Ebert and Jin Yoshimura
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep10004

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Geographic body size variation in the periodical cicadas Magicicada: implications for life cycle divergence and local adaptation2015

    • Author(s)
      T. Koyama, H. Ito, S. Kakishima, J. Yoshimura, J. R. Cooley, C. Simon and T. Sota
    • Journal Title

      Journal of Evolutionary Biology

      Volume: 28 Pages: 1270-1277

    • DOI

      10.1111/jeb.12653

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Advantage or disadvantage of migration in a prey-predator system2015

    • Author(s)
      K. Sato, T. Hasegawa, S. Morita, J. Yoshimura and K. Tainaka
    • Journal Title

      Far East Journal of Applied Mathematics

      Volume: 93 Pages: 109-121

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.17654/FJAMNov2015_109_121

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Social penalty promotes cooperation in a cooperative society2015

    • Author(s)
      Hiromu Ito & Jin Yoshimura
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep12797

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Evolution of periodicity in periodical cicadas2015

    • Author(s)
      Hiromu Ito, Satoshi Kakishima, Takashi Uehara, Satoru Morita, Takuya Koyama, Teiji Sota, John R. Cooley & Jin Yoshimura
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep14094

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Anthropogenic effects on a tropical forest according to the distance from human settlements2015

    • Author(s)
      Ananya Popradit, Thares Srisatit, Somboon Kiratiprayoon, Jin Yoshimura, Atsushi Ishida, Masae Shiyomi, Takehiko Murayama, Pranom Chantaranothai, Somkid Outtaranakorn & Issara Phromma
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep14689

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The contribution of seed dispersers to tree species diversity in tropical rainforests2015

    • Author(s)
      Satoshi Kakishima, Satoru Morita, Katsuhiko Yoshida, Atsushi Ishida, Saki Hayashi, Takahiro Asami, Hiromu Ito, Donald G. Miller, Takashi Uehara, Shigeta Mori, Eisuke Hasegawa, Kenji Matsuura, Eiiti Kasuya, Jin Yoshimura
    • Journal Title

      Royal Society Open Science

      Volume: 2 Pages: -

    • DOI

      10.1098/rsos.150330

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Microhabitat locality allows multi-species coexistence in terrestrial plant communities2015

    • Author(s)
      Jerrold M. Tubay, Keisuke Suzuki, Takashi Uehara, Satoshi Kakishima, Hiromu Ito,Atsushi Ishida, Katsuhiko Yoshida, Shigeta Mori, Jomar F. Rabajante, Satoru Morita,
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep15376

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A simple model for factory distribution: Historical effect in an industry city2015

    • Author(s)
      Takashi Uehara, Kazunori Sato, Satoru Morita, Yasunobu Maeda,Jin Yoshimura, Kei-ichi Tainaka
    • Journal Title

      Physica A

      Volume: 444 Pages: 213-216

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The Distribution of Periodical Cicada (Hemiptera: Cicadidae:Magicicada) Brood II in 2013: Disjunct Emergences Suggest Complex Brood Origins2015

    • Author(s)
      John R. Cooley, Chris Simon, Chris T. Maier, David Marshall, Jin Yoshimura, Stephen M. Chiswell, Marten Edwards, Chuck Holliday, Richard Grantham, John Zyla, Robert L. Sanders, Michael Neckermann, Gerry Bunker
    • Journal Title

      American Entomologist

      Volume: 61 Pages: 245-251

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1093/ae/tmv070 245-251

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 北海道泊村沿岸表層におけるホソメコンブ遊走子の移送と空間的分布2015

    • Author(s)
      秋野秀樹・川井唯史・四ツ倉典滋・河野時廣
    • Journal Title

      水産工学

      Volume: 52 Pages: 1-9

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Assessment of genetic relationships among cultivated and wild Rubusaccessions using AFLP markers2015

    • Author(s)
      Tomoya Miyashita, Hisato Kunitake, Norishige Yotsukura, Yoichiro Hoshino
    • Journal Title

      Scientia Horticulturae

      Volume: 193 Pages: 165-173

    • DOI

      10.1016/j.scienta.2015.07.004

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Potential resource of Saccharina bongardiana for kelp fisheries in South Kamchatka2015

    • Author(s)
      Tadashi Kawai, Nobu Nagai, Nina G. Klochkoba, Norishige Yotsukura
    • Journal Title

      Algal Resources

      Volume: 8 Pages: 59-64

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 北海道西日本海沿岸で持続的に形成されるホソメコンブ藻場の海洋環境について2016

    • Author(s)
      安永倫明・秋野秀樹・秦 安史・吉田秀嗣・中多章文・三原行雄・大崎正二・四ツ倉典滋
    • Organizer
      平成28年度日本水産学会春季大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学(東京都港区)
    • Year and Date
      2016-03-29 – 2016-03-29
  • [Presentation] 海産緑藻エゾヒトエグサにおいて新たに発見した生活史経路2016

    • Author(s)
      堀之内祐介、杉井優太郎、若菜雄、茂呂竜太郎、富樫辰也
    • Organizer
      第63回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(仙台市)
    • Year and Date
      2016-03-20 – 2016-03-24
  • [Presentation] 海産緑藻配偶システムの進化に見る偶然と必然2016

    • Author(s)
      富樫辰也
    • Organizer
      第63回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(仙台市)
    • Year and Date
      2016-03-20 – 2016-03-24
  • [Presentation] 周期ゼミ(素数ゼミ)の周期性進化メカニズムの解明2016

    • Author(s)
      伊東啓, 柿嶋聡, 上原隆司, 守田智, 小山卓也, 曽田貞滋, John R. Cooley, 吉村仁
    • Organizer
      日本生態学会第63回全国大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(仙台市)
    • Year and Date
      2016-03-20 – 2016-03-24
  • [Presentation] コンブ目重要海域の選定-その多様性・将来分布予測をもとに-2016

    • Author(s)
      渡辺健太郎・四ツ倉典滋・山北剛久・仲岡雅裕
    • Organizer
      日本生態学会大会第63回仙台大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(仙台市)
    • Year and Date
      2016-03-20 – 2016-03-24
  • [Presentation] An Example of the Contradiction between Dynamic Optimization and the Traditional Maximization of Future Expectation2016

    • Author(s)
      Jin Yoshimura
    • Organizer
      Complexity, Informatics and Cybernetics: IMCIC 2016
    • Place of Presentation
      Orlando(USA)
    • Year and Date
      2016-03-08 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Comparison between dynamic utility optimization and dynamic programing2016

    • Author(s)
      Jin Yoshimura
    • Organizer
      Complexity, Informatics and Cybernetics: IMCIC 2016
    • Place of Presentation
      Orlando(USA)
    • Year and Date
      2016-03-08 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 個体ベースモデルを用いた6年周期一斉開花の進化に おける繁殖干渉仮説の検証2015

    • Author(s)
      柿嶋聡、高橋尚也、渥美宏太、内貴章世、西田佐知子、吉村仁
    • Organizer
      第47回種生物シンポジウム
    • Place of Presentation
      かんぽの宿岐阜羽島(岐阜市)
    • Year and Date
      2015-12-04 – 2015-12-06
  • [Presentation] 周期ゼミの周期性進化メカニズムの解明2015

    • Author(s)
      伊東啓、柿嶋聡、上原隆司、守田智、小山卓也、曽田貞滋、John R. Cooley、吉村仁
    • Organizer
      第31 回個体群生態学会大会
    • Place of Presentation
      滋賀県立大学(彦根市)
    • Year and Date
      2015-10-10 – 2015-10-12
  • [Presentation] ボンド・サイト同時破壊に対するネットワークモデルの頑健性2015

    • Author(s)
      伊東啓、赤池祐樹、守田智、吉村仁
    • Organizer
      第12回ネットワーク生態学シンポジウム
    • Place of Presentation
      山喜旅館(伊東市)
    • Year and Date
      2015-08-03 – 2015-08-04
  • [Presentation] Fisheries Biology of Saccharina bongardiana, South Kamchatka, Far-east Russia2015

    • Author(s)
      Tadashi Kawai, Anna V. Klimova, Nobu Nagai, Nina G. Klochkova, Norishige Yotsukura
    • Organizer
      日本応用藻類学会第14回大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学(東京都港区)
    • Year and Date
      2015-05-15 – 2015-05-15

URL: 

Published: 2017-01-06   Modified: 2022-02-07  

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