2015 Fiscal Year Annual Research Report
プロテオミクスと遺伝学の融合によるゲノム恒常性維持マシナリーの解明
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25281021
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan University |
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Principal Investigator |
廣田 耕志 首都大学東京, 理工学研究科, 教授 (00342840)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 染色体 / ゲノム / 複製 / 質量分析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、ゲノム安定性の維持に重要な働きをする複製停止トレランス機構の解明を目指し以下の研究を行っている。(1) 損傷部位での複製停止からの回復に関わる、損傷乗り越え経路における各種のポリメラーゼのネットワークの解明、(2) i-POND法による複製停止時にフォークに集合する蛋白質の解明、(3)質量分析手法と遺伝学研究を合わせた方法による複製停止領域でのポリメラーゼネットワークの解析、(4)DNA損傷に応答するユビキチン化ネットワークの解明。
これまでの研究で以下の成果を上げた。
(1)複製ポリメラーゼδの３番目のサブユニットp66はポリメラーゼζのサブユニットとしても機能し、損傷乗り越えの促進に寄与することが知られているが、p66がポリメラーゼζとは独立して損傷乗り越えに寄与することを発見した(Hirota et al Nucleic acids Res 2015)。(2) 複製ポリメラーゼδは損傷箇所で機能停止すると信じられているが、損傷を乗り越えて複製を継続することができる。(3) 複製ポリメラーゼδによる乗り越え反応はポリメラーゼζやηによる乗り越え経路のバックアップとして機能する。(4) 複製ポリメラーゼδは正確な複製のためにDNA合成活性中心が狭い構造となっているが、損傷箇所で乗り越え反応を行う際には、構造変換をしてエラープローンな複製を行う（フィデリティースイッチ仮説）。
これらの研究成果を現在論文投稿を行っている。さらに、ポリメラーゼネットワークの研究から複製ポリメラーゼεが複製末端に取り込んだチェーンターミネーターやリボ核酸の除去を行うことでゲノムメンテナンスに寄与することを突き止めており、論文発表のための準備を行っている。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Abacavir, an anti-HIV-1 drug, targets TDP1-deficient adult T cell leukemia.2015
Author(s)
Tada K, Kobayashi M, Takiuchi Y, Iwai F, Sakamoto T, Nagata K, Shinohara M, Io K, Shirakawa K, Hishizawa M, Shindo K, Kadowaki N, Hirota K, Yamamoto J, Iwai S, Sasanuma H, Takeda S, Takaori-Kondo A.
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Journal Title
Sci Adv
Volume: 1(3)
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Relative contribution of four nucleases, CtIP, Dna2, Exo1 and Mre11, to the initial step of DNA double-strand break repair by homologous recombination in both the chicken DT40 and human TK6 cell lines.2015
Author(s)
Hoa NN, Akagawa R, Yamasaki T, Hirota K, Sasa K, Natsume T, Kobayashi J, Sakuma T, Yamamoto T, Komatsu K, Kanemaki MT, Pommier Y, Takeda S, Sasanuma H.
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Journal Title
Genes Cells
Volume: 20(12)
Pages: 1059-1076
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] The POLD3 subunit of DNA polymerase δ can promote translesion synthesis independently of DNA polymerase ζ.2015
Author(s)
Hirota K, Yoshikiyo K, Guilbaud G, Tsurimoto T, Murai J, Tsuda M, Phillips L, Narita T, Nishihara K, Kobayashi K, Yamada K, Nakamura J, Pommier Y, Lehmann A, Sale J, Takeda S.
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Journal Title
Nucleic Acids Res
Volume: 43(3)
Pages: 1671-83
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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