2016 Fiscal Year Annual Research Report
Value-added advance of pathogenic fungus resources by comprehensive analysis of DNA as the indicator of species diversity
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25290079
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
矢口 貴志 千葉大学, 真菌医学研究センター, 准教授 (60361440)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
廣瀬 大 日本大学, 薬学部, 准教授 (20513922)
田中 玲子 千葉大学, 真菌医学研究センター, 助教 (60143319)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 次世代シーケンサー / 種多様性 / DNA / 病原真菌 / マイクロサテライト |
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| Outline of Annual Research Achievements |
千葉大学真菌医学研究センターでは病原真菌を世界規模で収集、保存、提供している。その保存株を系統的に維持管理するには正確な分類・同定が必須である。また、同種でも生物学的、遺伝的性状は多様である。保存株において、真菌の分類・同定にその一部分の塩基配列が使用されているリボゾームおよびミトコンドリア DNA の全塩基配列において、次世代シーケンサーを使用して決定し、種同定の精度を高め、高次元な分類を行う。さらに個体識別に有効なマイクロサテライト解析と統合し、種の多様性について詳細に検討する。病原真菌は、菌株に様々な情報（患者の背景、治療経過、菌株の遺伝情報、薬剤感受性、病原性に強弱、地域性など）が付加されることよって、資源として有効に活用できる。本研究は、これまで世界規模で収集された貴重な保存株、主要な病原真菌であるAspergillus fumigatus、A. niger およびそれら関連種に新たな情報を付加し、その価値をさらに高めることを目的とする。これら菌種において当センターで保存している臨床株、環境株の中から薬剤感受性株、耐性株を選択し、次世代シーケンサーを使用して全ゲノム配列を解析した。得られた塩基配列データのち、薬剤耐性に関連する遺伝子配列と薬剤感受性データの相関を検討した。また、リボゾームタンパク質をターゲットとしたMALDI-TOF-MS（マトリックス支援レーザー脱離イオン化－飛行時間型質量分析法）による検討を行い、これらの菌種が検出できることを確認し、A. viridinutansの種細分化の妥当性を検討した。当センターですでに公開している保存株の情報（臨床情報、病原性、薬剤感受性などの性状）とともに新たに得られた結果を追加し、データベースとして整理し公開する。菌株と合わせてこれら情報は、研究者コミュニティにとって利用価値が高く、新たな研究の展開に貢献できる。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Asnovolins A-G, spiromeroterpenoids isolated from the fungus Aspergillus novofumigatus, and suppression of fibronectin expression by asnovolin E.2016
Author(s)
Ishikawa K, Sato F, Itabashi T, Wachi H, Takeda H, Wakana D, Yaguchi T, Kawai K, Hosoe T.
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Journal Title
J Nat Prod.
Volume: 79
Pages: 2167-2174
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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