2015 Fiscal Year Annual Research Report
Imaging GWAS: 日本人大脳皮質体積の全ゲノム解析
Project/Area Number |
25293250
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Research Institution | Osaka University |
Principal Investigator |
橋本 亮太 大阪大学, 連合小児発達学研究科, 准教授 (10370983)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
安田 由華 大阪大学, 医学部附属病院, 助教 (20448062)
山森 英長 大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (90570250)
藤本 美智子 大阪大学, 医学部附属病院, 医員 (50647625)
藤野 陽生 大阪大学, 人間科学研究科, 助教 (20707343)
工藤 紀子 大阪大学, 連合小児発達学研究科, 招へい研究員 (30751151)
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Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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Keywords | 統合失調症 / 全ゲノム関連解析(GWAS) / 脳 MRI / 大脳異質体積 / 右上前頭回皮質体積 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、Imaging GWASという全脳と全ゲノムを網羅的に調べる最新の解析法を用いてヒトの脳構造に影響を与える遺伝子多型を同定することで、統合失調症などの精神神経疾患の生物学的なメカニズムを明らかにすることを目的としている。 自己認識や感情に関与する上前頭回は統合失調症において体積の減少が報告されるため、上前頭回の体積と関連するSNPを同定する為に、統合失調症158例と健常者378例の脳MRIデータから、左右の上前頭回の灰白質体積を抽出しGWASを行った。1p36.12の5つのSNPsと右上前頭回の灰白質体積の間に、ゲノムワイドレベルで有意な関連があることを見出し、EIF4G3遺伝子のイントロンにあるrs4654899に最も強い関連が認められた。左上前頭回ではゲノムワイドで有意なSNPは見出されなかった。in silico解析により、rs4654899に代わるSNPがEIF4G3遺伝子の隣に位置するHP1BP遺伝子と2番染色体にあるCAPN14遺伝子の発現と強く関連し、これらの遺伝子はヒトの上前頭回に強く発現していることから、HP1BPとCAPN14遺伝子が、右上前頭回の灰白質体積の個人差に影響している可能性が示唆された。さらに、本年度は、研究代表者が代表を務めるCOCORO(Cognitive Genetics Collaborative Research Organization:認知ゲノム共同研究機構)の多施設のサンプルを用いて、再現性の検討を行い、rs4654899が右上前頭回の灰白質体積と関連することを同定した。なお 本研究成果は、Translational Psychiatryに掲載された。
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Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Causes of Carryover |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(71 results)
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[Journal Article] Association of copy number polymorphisms at the promoter and translated region of COMT with Japanese patients with schizophrenia.2016
Author(s)
Higashiyama R, Ohnuma T, Takebayashi Y, Hanzawa R, Shibata N, Yamamori H, Yasuda Y, Kushima I, Aleksic B, Kondo K, Ikeda M, Hashimoto R, Iwata N, Ozaki N, Arai H.
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Journal Title
Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet
Volume: 171(3)
Pages: 447-457
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Whole-exome sequencing and neurite outgrowth analysis in autism spectrum disorder.2016
Author(s)
Hashimoto R, Nakazawa T, Tsurusaki Y, Yasuda Y, Nagayasu K, Matsumura K, Kawashima H, Yamamori H, Fujimoto M, Ohi K, Umeda-Yano S, Fukunaga M, Fujino H, Kasai A, Hayata-Takano A, Shintani N, Takeda M, Matsumoto N, Hashimoto H.
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Journal Title
Journal of Human Genetics
Volume: 61(3)
Pages: 199-206
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Emerging Roles of ARHGAP33 in Intracellular Trafficking of TrkB and Pathophysiology of Neuropsychiatric Disorders.2016
Author(s)
Nakazawa T, Hashimoto R, Sakoori K, Sugaya Y, Tanimura A, Hashimotodani Y, Ohi K, Yamamori H, Yasuda Y, Umeda-Yano S, Kiyama Y, Konno K, Inoue T, Yokoyama K, Inoue T, Numata S, Ohnuma T, Iwata N, Ozaki N, Hashimoto H, Watanabe M, Manabe T, Yamamoto T, Takeda M, Kano M.
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Journal Title
Nat Commun
Volume: 7
Pages: 10594
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Glutamate Networks Implicate Cognitive Impairments in Schizophrenia: Genome-Wide Association Studies of 52 Cognitive Phenotypes.2015
Author(s)
Ohi K, Hashimoto R, Ikeda M, Yamamori H, Yasuda Y, Fujimoto M, Umeda-Yano S, Fukunaga M, Fujino H, Watanabe Y, Iwase M, Kazui H, Iwata N, Weinberger DR, Takeda M.
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Journal Title
Schizophr Bull
Volume: 41(4)
Pages: 909-18
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Dietary intake of sulforaphane-rich broccoli sprout extracts during juvenile and adolescence can prevent phencyclidine-induced cognitive deficits at adulthood.2015
Author(s)
Shirai Y, Fujita Y, Hashimoto R, Ohi K, Yamamori H, Yasuda Y, Ishima T, Suganuma H, Ushida Y, Takeda M, Hashimoto K.
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Journal Title
PLoS One
Volume: 24;10(6)
Pages: e0127244
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Atomoxetine reverses locomotor hyperactivity, impaired novel object recognition, and prepulse inhibition impairment in mice lacking pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (PACAP).2015
Author(s)
Shibasaki Y, Hayata-Takano A, Hazama K, Nakazawa T, Shintani N, Kasai A, Nagayasu K, Hashimoto R, Tanida M, Katayama T, Matsuzaki S, Yamada K, Taniike M, Onaka Y, Ago Y, Wschek J, Koves K, Reglodi D, Tamas A, Matsuda T, Baba A, Hashimoto H.
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Journal Title
Neuroscience
Volume: 297
Pages: 95-104
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The Piccolo Intronic Single Nucleotide Polymorphism rs13438494 Regulates Dopamine and Serotonin Uptake and Shows Associations with Dependence-like Behavior in Genomic Association Study.2015
Author(s)
Uno K, Nishizawa D, Seo S, Takayama K, Matsumura S, Sakai N, Ohi K, Nabeshima T, Hashimoto R, Ozaki N, Hasegawa J, Sato N, Tanioka F, Sugimura H, Fukuda K, Higuchi S, Ujike H, Inada T, Iwata N, Sora I, Iyo M, Kondo N, Won MJ, Naruse N, Uehara-Aoyama K, Itokawa M, Yamada M, Ikeda K, Miyamoto Y, Nitta A.
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Journal Title
Curr Mol Med
Volume: 15(3)
Pages: 265-74
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] p13 overexpression in pancreaticβ-cells ameliorates type 2 diabetes in high-fat-fed mice2015
Author(s)
Higashi S, Katagi K, Shintani N, Ikeda K, Suimoto Y, Tsuchiya S, Inoue N Tanaka S, Koumoto M, Kasai A, Nakazawa T, Hayata-Takano A, Hamagami K, Tomimoto S, Yoshida T, Ohkubo T, Nagayasu K, Ago Y, Onaka Y, Hashimoto R, Ichikawa A, Baba A, Hashimto H.
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Journal Title
Biochem Biophys Res Commun
Volume: 461
Pages: 612-617
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] DEGS2 polymorphism associated with cognition in schizophrenia is associated with gene expression in brain.2015
Author(s)
Ohi K, Ursini G, Li M, Shin J.H.,Ye T, Chen Q, Tao R, Kleinman JE., Hyde TM., Hashimoto R, Weinberger DR.
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Journal Title
Transl Psychiatry
Volume: 14;5
Pages: e550
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Comorbidity of psychiatric disorders in chronic pain.2015
Author(s)
Hashimoto R, Yasuda Y, Nakae A, Yamamori H, Fujimoto M, Ohi K, Kou K, Hagihira S, Miki K, Yukioka M, Takeda M.
Organizer
Symposium S-41: 12th World Congress of Biological Psychiatry 2015
Place of Presentation
Athens, Greece
Year and Date
2015-06-14 – 2015-06-18
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[Presentation] Intermediate phenotype strategy for discovering disease related gene network.2015
Author(s)
Hashimoto R, Ohi K, Ikeda M, Yamamori H, Yasuda Y, Fujimoto M, Fukunaga M, Fujino H, Watanabe Y, Iwata N, Takeda M.
Organizer
Symposium S-55: 12th World Congress of Biological Psychiatry 2015
Place of Presentation
Athens, Greece
Year and Date
2015-06-14 – 2015-06-18
Invited
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[Presentation] Predicting social functioning and subjective quality of life in patients with schizophrenia.2015
Author(s)
Fujino H, Sumiyoshi C, Sumiyoshi T, Yasuda Y, Yamamori H, Ohi K, Fujimoto M, Hashimoto R, Takeda M, Imura O.
Organizer
WPA regional congress
Place of Presentation
Osaka, Japan
Year and Date
2015-06-04 – 2015-06-06
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[Book] Springer2015
Author(s)
Ohi K, Hashimoto R, Yamamori H, Yasuda Y, Fujimoto M, Umeda-Yano S, Takeda M.
Total Pages
135-155
Publisher
Intermediate phenotypes approach for neuropsychiatric disorders.
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