2016 Fiscal Year Annual Research Report
Development of statistical method for case-cohort design when measurements of interests are known to be missing
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25330039
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| Research Institution | Shiga University |
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Principal Investigator |
和泉 志津恵 (大久保志津恵) 滋賀大学, データサイエンス教育研究センター, 教授 (70344413)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
玉腰 暁子 北海道大学, 医学研究科, 教授 (90236737)
伊藤 陽一 北海道大学, 医学研究科, 准教授 (10334236)
野間 久史 統計数理研究所, データ科学研究系, 准教授 (70633486) [Withdrawn]
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 医薬生物 / ゲノム統計解析 / ビッグデータ活用 / ゲノム疫学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年，膨大なゲノムデータを用いて，疾病に関連する遺伝子の探索が可能になっている。ケース・コホート研究では，コホート全体ではなく一部の選択された対象者のみから高価なゲノム情報を測定することにより，研究のコスト・労力が大幅に節減できる。しかし，対象者から観測されるデータには頻繁に欠測値が含まれるため，データ解析に困難を伴う。本研究では，欠測を伴うコホートデータに対応した，ケース・コホート研究の新規な理論的枠組みの開発を行い，提案方法の特性を数値実験により検証し，汎用プリケーションを開発し，国内外の大規模なゲノム疫学研究への提案方法の応用を検討することを目的とする。
平成２８年度（4年度目）は，平成２５年度から平成２６年度に開発した（１）新規のサンプリングデザイン，統計解析の方法，加えて標本数（サブコホートサイズ）の設計方法，（２）数値実験により検証された提案方法の特性，（３）統計解析ソフトウェアRでの汎用的なアプリケーションを用いて，平成２７年度に（４）ゲノム疫学研究への応用を試み，（５）研究成果の考察を行った。乳幼児を対象とした北海道スタディやエコチル調査のように，コホート内の多数の対象者における反応変数の値が欠測となると事前に分かっている場合，幾つかのシナリオのもとで、反応変数が欠測となる影響を補正し，共変量の効果を推定する方法を用いた研究デザインを提案した。その成果を国際学会にて報告し，論文にまとめた。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] Effects of prenatal exposure to perfluoroalkyl acids on prevalence ofallergic diseases among 4-year-old children2016
Author(s)
Goudarzi, H., Miyashita, C., Okada, E., Kashino, I., Kobayashi, S., Chen, C. J., Ito, S., Araki, A., Matsuura, H., Ito, Y. M., Kishi, R.
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Journal Title
Environment International
Volume: 94
Pages: 124-132
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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