A multiplex system using highly polymorphic INDEL markers in Japanese population and its forensic application

2016 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 25460866
• Research Institution: Gifu University
• Principal Investigator: 永井 淳 岐阜大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (00207961)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: INDEL多型 / 個人識別 / 日本人集団

Outline of Annual Research Achievements

INDEL多型とは数bpから十数bp程度の短い塩基配列の挿入もしくは欠失により生ずるDNA多型のことであり、新しいDNAマーカーとして様々な領域でその利用が期待されている。本研究の目的は、日本人に最適化された、識別能の高いマルチプレックスINDEL多型検出システムを開発し、法医鑑定実務に応用することである。
これまでに、インターネット上のデータベースサイトならびに既報のデータをもとに常染色体の非遺伝子領域にある12種類のINDEL多型マーカー（rs1160956、rs2308137、rs35769550、rs2308020、rs33917182、rs3047269、rs2307708、rs1160963、rs2307978、rs1160886、rs10688868、rs35605984）を選択し、PCR条件ならびに日本人集団における多型性について検討した。その結果、これらのPCR産物のサイズは75 bpから160 bpと小さく、いずれも一方のアレルの出現頻度は0.5から0.6を示すことから、選択した12種類のINDELマーカーは日本人集団において高い多型性を有し、法医学的個人識別に有効と考えられた。
本年度は、選択したINDEL多型マーカーを用いたマルチプレックス検出法の確立を目指し、マルチプレックスPCRを行うための最適な条件を検討したが、有効な検出法を確立するに至らなかった。そこで、新たなINDEL多型マーカーの組み合わせも視野に入れ、本研究の対照となる市販の30種のINDELマーカーの多型性に関する基礎的データを得ることを目的として、日本人非血縁者225人について30種のINDEL多型を解析するとともに、得られたデータを他の複数の人種集団と統計学的に比較した。
研究期間内に目的とした成果が得られなかったので、今後は他の研究者の協力も仰ぎながら、本研究を完遂する所存である。