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2015 Fiscal Year Annual Research Report

新規ジペプチジルペプチダーゼ酵素群の発現と細胞内分布の解析

Research Project

Project/Area Number 25462894
Research InstitutionNagasaki University

Principal Investigator

根本 優子  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(歯学系), 准教授 (10164667)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 根本 孝幸  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(歯学系), 教授 (90164665)
木村 重信  岩手医科大学, 歯学部, 教授 (10177917)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsペプチダーゼ / 歯周病原性細菌 / ジペプチジルペプチダーゼ
Outline of Annual Research Achievements

本研究では,我々が発見した新規ジペプチジルペプチダーゼ(DPP)11を中心として,歯周病原性細菌であるPorphyromonas gingivalisの増殖と病原性に関与するジペプチド分解系の解明を目指し,DPP11およびその他DPP酵素群の発現と細胞内分布について検討した。P. gingivalis ATCC 33277株ゲノムDNAを鋳型としてDPP3, DPP4, DPP7, DPP11,及びAla-DPP遺伝子断片を調製し,各DPP遺伝子を大腸菌発現系により発現し精製した。組換えタンパク質の酵素活性をジペプチド-MCA蛍光基質を用いて測定し,kcat, Km等の酵素学的パラメーターを決定した。また,種々の薬剤耐性遺伝子カセットを該当遺伝子に挿入しDPP遺伝子破壊株を作成した。これらの野生株,遺伝子破壊株での検討から,全てのDPP活性はペリプラズム画分に存在すること,また,ジンジパインと異なり菌体外には分泌されないことを明らかにした。DPP欠失株の検討から,疎水性アミノ酸を基質とする新規のエキソペプチダーゼであるDPP5,及びN-末修飾ジペプチド及びトリペプチドを遊離するエキソペプチダーゼ(acylpeptidyl oligopeptidase, AOP)を発見し,それらの生化学的性状と酵素学的特性を決定し報告した。
本研究の結果,糖非発酵性でアミノ酸を炭素源・エネルギー源とするP. gingivalisでは,栄養源であるタンパク質は菌体外及び菌外壁に分布する2種のエンドペプチダーゼ(KgpとRgp)によってオリゴペプチドまで分解されるが,この分解に続いてオリゴペプチドはペリプラズム画分に移行し,同画分では種々のアミノ酸を基質とするエキソペプチダーゼ群(DPP, TPP, AOP)によってジペプチド,あるいはトリペプチドに分解され菌体内に取り込まれるというオリゴペプチド分解系の全容が明らかになった。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Porphyromonas gingivalis exopeptidases as crucial factors for its amino acid metabolism2016

    • Author(s)
      Nemoto, T.K., Ohara-Nemoto, Y.
    • Journal Title

      Jap. Dent. Sci. Rev.

      Volume: 52 Pages: 22-29

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1016/j.jdsr.2015.08.002

    • Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A Porphyromonas gingivalis periplasmic novel exopeptidase, acylpeptidyl oligopeptidase, releases N-acylated di- and tri-peptides from oligopeptides2016

    • Author(s)
      Nemoto, T.K., Ohara-Nemoto, Y., Bezerra, G. A., Shimoyama, Y., and Kimura, S.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 291 Pages: 5913-5925

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1016/j.jdsr.2015.08.002

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Oral bacteria and systemic diseases: Periodontopathic bacteria and type 2 diabetes mellitus2015

    • Author(s)
      Ohara-Nemoto, Y., and Nemoto, T.K.
    • Organizer
      1st Partnership Symposium of Nagasaki and Islamic Universities
    • Place of Presentation
      Kushtia (Bangladesh)
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Identification of exopeptidases expressed in periodontopathic bacteria, Porphyromonas gingivalis and Porphyromonas endodontalis2015

    • Author(s)
      Nemoto, T.K., and Ohara-Nemoto, Y.
    • Organizer
      1st Partnership Symposium of Nagasaki and Islamic Universities
    • Place of Presentation
      Kushtia (Bangladesh)
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] アシルオリゴペプチジルペプチダーゼ活性を有する歯周病原性細菌の新規ペプチダーゼ2015

    • Author(s)
      根本孝幸,根本優子
    • Organizer
      第57回歯科基礎医学会学術大会・総会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ( 新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-11 – 2015-09-13
  • [Presentation] 非RI蛍光試薬によるPorphyromonas gingivalisのアミノ酸とジペプチドの取り込みの評価2015

    • Author(s)
      小早川健,根本優子,馬場友巳,根本孝幸
    • Organizer
      第57回歯科基礎医学会学術大会・総会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ( 新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-11 – 2015-09-13
  • [Presentation] Tannerella forsythia のジペプチジルペプチダーセ4の性状解析2015

    • Author(s)
      中里茉那美,下山佑,根本優子,根本孝幸,高橋晋平,石河太知,佐々木実,八重柏隆,木村重信
    • Organizer
      第57回歯科基礎医学会学術大会・総会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ( 新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-11 – 2015-09-13
  • [Presentation] 歯周病原性‘red complex species’のビルレンス因子としてのプロテアーゼ2015

    • Author(s)
      下山佑,中里茉那美,根本優子,根本孝幸,石河太知,八重柏隆,佐々木実,木村重信
    • Organizer
      第69回 日本細菌学会東北支部総会
    • Place of Presentation
      郡山ビッグア( 郡山市)
    • Year and Date
      2015-08-21 – 2015-08-22
  • [Presentation] Towards the structural basis of peptide binding to dipeptidyl peptidases of Porphyromonas sp.2015

    • Author(s)
      Bezerra, G. A., Ohara-Nemoto, Y., Nemoto, T.K., Djinovic-Carugo, K.
    • Organizer
      2015 Annual Meeting - American Crystallographic Association
    • Place of Presentation
      Philadelphia (USA)
    • Year and Date
      2015-07-25 – 2015-07-29
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 原核生物で初めてジペプチジルペプチダーゼ5(DPP5)を発見

    • URL

      http://www.nagasaki-u.ac.jp/ja/about/info/science/science71.html

URL: 

Published: 2017-01-06  

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