• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2014 Fiscal Year Annual Research Report

染色体構成の急速な変化がみられる霊長類:反復配列の関与に関する仮説の検証

Research Project

Project/Area Number 25650152
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

古賀 章彦  京都大学, 霊長類研究所, 教授 (80192574)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywords反復配列 / 増幅 / 霊長類 / セントロメア
Outline of Annual Research Achievements

平成25年度に、ヨザルに特有の大規模反復配列であるOwlRepに関して種々の解析を行い、論文として発表していた (DNA Research 2014)。主な結果は、内部に複雑な構造をもつこと、アクロセントリック染色体の短碗の主要成分であること、染色体から染色体に伝播して広がったと推察されることである。
平成26年度は、マーモセットのアルファサテライトDNAを対象とした。アルファサテライトDNAは、霊長類のセントロメア反復配列の主要DNA成分である。マーモセットのアルファサテライトDNAは、反復単位間の塩基配列の類似度が高い。霊長類全般で70-90%であるのに対して、99%以上の値を示す。これは、アルファサテライトDNAが最近急速な増幅を遂げたことを意味する。類似度が高いこと、および内部に高次構造がみられることを論文にまとめて、受理に至っている(Scientific Reports 2015予定)。また、プラスミドをベクターとするクローンを維持した場合に崩壊が起こりやすいことも、新たな発見となった。これに付随して、崩壊を避けてクローンとして維持する方法を開発し、論文として発表した (Genetice Research 2014)。

  • Research Products

    (6 results)

All 2015 2014

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Higher-order repeat structure in alpha satellite DNA occurs in New World monkeys and is not confined to hominoids2015

    • Author(s)
      Sujiwattanarat P, Thapana W, Srikulnath K, Hirai Y, Hirai H, *Koga A
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Reduction in the structural instability of cloned eukaryotic tandem-repeat DNA by low-temperature culturing of host bacteria2014

    • Author(s)
      Thapana W, Sujiwattanarat P, Srikulnath K, Hirai H, *Koga A
    • Journal Title

      Genetics Research

      Volume: 96 Pages: e13

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1017/S0016672314000172

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Locational diversity of alpha satellite DNA and intergeneric hybridization aspects in the Nomascus and Hylobates genera of small apes2014

    • Author(s)
      Baicharoen S, Miyabe-Nishiwaki T, Arsaithamkul V, Hirai Y, Duangsa-ard K, Siriaroonrat B, Domae H, Srikulnath K, Koga A, *Hirai H
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 9 Pages: e109151

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0109151

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] DNA-based transposable elements as natural mutators in vertebrate genomes2014

    • Author(s)
      Akihiko Koga
    • Organizer
      2014 International Conference of the Korean Society for Molecular and Cellular Biology
    • Place of Presentation
      COEX (Seoul, Korea)
    • Year and Date
      2014-10-21 – 2014-10-23
    • Invited
  • [Presentation] Higher-order repeat structure in centromeric repetitive DNA is not confined to central regions2014

    • Author(s)
      Penporn Sujiwattanarat, Watcharaporn Thapana, Kornsorn Srikulnath, 平井啓久, 古賀章彦
    • Organizer
      日本進化学会第16回大阪大会
    • Place of Presentation
      高槻現代劇場(大阪府高槻市)
    • Year and Date
      2014-08-21 – 2014-08-24
  • [Presentation] ヨザルの染色体変異に関与したと考えられる大規模反復配列2014

    • Author(s)
      古賀章彦, Ornjira Prakhongcheep, Nampech Chaiprasertsri, 平井百合子, 平井啓久
    • Organizer
      第30回日本霊長類学会大会
    • Place of Presentation
      大阪科学技術センター(大阪市)
    • Year and Date
      2014-07-04 – 2014-07-06

URL: 

Published: 2016-06-01  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi