毛根チップによる、超非侵襲的ながんの監視・モニタリング

2014 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 25670086
• Research Institution: Center for Clinical and Biomedical Research, Sapporo Higashi Tokushukai Hospital
• Principal Investigator: 千葉 眞子 医療法人徳洲会札幌東徳洲会病院付属臨床研究センター, IVR・癌研究部, 研究員 (50647592)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 水上 裕輔 医療法人徳洲会札幌東徳洲会病院付属臨床研究センター, 臨床生体情報解析部, 部門長 (30400089) ; 佐々木 勝則 旭川医科大学, 医学部, 特任教授 (60336394)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2015-03-31
• Keywords: がん / 毛根

Outline of Annual Research Achievements

大腸がん患者と、年齢・性別をマッチさせた健常人より毛根を採取し、バルジ領域を含む毛根細胞からRNAを精製して、癌患者の毛根に特異的な遺伝子発現のパターンが見られるかを検証した。毛根部を含む毛髪20本程度を採取し、毛根部を切断し直ちにRNA laterによるRNA安定化処理を4Cにて一晩行った後に、安定化液を取り除き凍結処理した。これをRNeasy micro kit（Qiagen）を用いて精製したが、直接RNA-sequenceによる発現解析を行うのは困難であった。このためSMARTer Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing. v3を使用し、RNA 10ngを増幅後、IonTorrent PGMを用いてAmpliseqライブラリを作成し、RNA-sequenceを行った。これまでに大腸がん患者６人、健常人４人分のデータを得て、癌患者の毛根において特異的な遺伝子発現パターンが見られることを確認している。