2015 Fiscal Year Research-status Report
臨床解析と分子細菌学的手法による敗血症発症因子の解明と予測法の確立
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25670277
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| Research Institution | Gihu University of Medical Science |
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Principal Investigator |
中山 章文 岐阜医療科学大学, 保健科学部, 教授 (70536721)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
水野 文子 奈良県立医科大学, 医学部, 講師 (70271202)
山本 惠三 奈良県立医科大学, 医学部, 准教授 (90254490)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 新生児髄膜炎 / 大腸菌病原因子 / ゲノム解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
平成27年度は、新生児髄膜炎由来大腸菌株の次世代シークエンサーによるゲノム解析によって得られた17種類の新規遺伝子の内9種類について、血液由来大腸菌株、尿路由来大腸菌株、健康人由来大腸菌株での保有状況を調べた。その結果、8種類の遺伝子について血液由来、尿路由来、健康人由来大腸菌株での保有を認めず、ゲノム解析に用いた新生児髄膜炎由来大腸菌株に特有の遺伝子であることが推定された。この中でAFH37372についてBlastp, tblastn, ExPaSy, InterProによってアミノ酸の相同配列を検索したが、有意な結果が得られなかった。そこで、Sequences Annotated by Structure（SAS）を使用して、２次構造予測を行い、既に立体構造がわかっているデータについて検索した結果、構造上相同性のある部分を有するタンパク質として核酸またはリン酸エステルを認識する酵素蛋白が検索された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
職位の昇格に伴う学内業務の増加により、実験・研究の遂行を予定通りに行うことが困難であった。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、残り8種類の遺伝子について血液由来大腸菌株、尿路由来大腸菌株、健康人由来大腸菌株での保有状況を調べ、新生児髄膜炎由来大腸菌株に特有の遺伝子を検索する。
また、新生児髄膜炎由来大腸菌株に特有な遺伝子について、コードされているタンパク質の機能の解明を試みる。
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