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2013 Fiscal Year Research-status Report

転移因子を抑制する新規小分子RNA機能の解析

Research Project

Project/Area Number 25830134
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

岩崎 由香  慶應義塾大学, 医学部, 助教 (80612647)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywords小分子RNA / 転移因子 / 遺伝子発現制御 / RNAサイレンシング / 生殖組織 / Argonauteタンパク質
Research Abstract

ヒトなど哺乳類のゲノムの40%以上といった膨大な領域はレトロトランスポゾン(転移因子)によって占められており、その適切な制御がゲノムの品質管理の鍵となる。ショウジョウバエ生殖細胞などにおいては、piRNAやesiRNA (endogenous siRNA) といった小分子RNA群が主なレトロトランスポゾン制御因子として報告されている。一方、哺乳類における小分子RNAを介したレトロトランスポゾン抑制に関しては研究が進んでおらず、未知の部分が多い。そこで、本研究では次世代シーケンサを用いて哺乳類モデル生物として知られているコモンマーモセット精巣由来の小分子RNA配列を網羅的に解析した。結果、コモンマーモセット精巣において、トランスポゾン領域由来のmiRNAなどの新規miRNAを同定すると同時に、発現している小分子RNAの大部分がpiRNAに占められていることを見いだした。そこで、マーモセットPIWIタンパク質 (PIWIL1/MARWI) に対するモノクローナル抗体を作製し、これに結合する小分子RNAを解析した。同定されたpiRNAの多くは、特定のゲノム領域(piRNAクラスター)やトランスポゾンに由来していた。加えて、特定のtRNAおよび偽遺伝子から産生されているpiRNAを確認し、これらが遺伝子の発現調節を担っている可能性を見いだした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

コモンマーモセット精巣を用いた小分子RNAの網羅的解析により、多数の新規piRNAおよびmiRNAを含む、霊長類精巣小分子RNAプロファイルを見いだした。加えて、小分子RNAと複合体を形成するArgonauteタンパク質のうち、コモンマーモセット精巣で最も発現量が高いPIWIL1/MARWI 結合小分子RNAについてRIP-seqを用いて詳細に解析し、ゲノム中の新規小分子RNAコード領域(piRNAクラスター領域)などを同定した。

Strategy for Future Research Activity

今後はこれまでに同定された小分子RNAの実験的な検証を行う。さらに、小分子RNAが標的とする遺伝子、並びに関与し得る生命現象について、引き続き解析をすすめる。

  • Research Products

    (4 results)

All 2013 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] DmGTSF1 is necessary for Piwi-piRISC-mediated transcriptional transposon silencing in the Drosophila ovary2013

    • Author(s)
      Ohtani H, Iwasaki YW, Shibuya A, Siomi H, Siomi MC, Saito K
    • Journal Title

      Genes and Development

      Volume: 27 Pages: 1656-1661

    • DOI

      10.1101/gad.221150.113

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Global microRNA elevation by inducible Exportin 5 regulates cell cycle entry2013

    • Author(s)
      Iwasaki YW, Kiga K, Kayo H, Fukuda-Yuzawa Y, Weise J, Inada T, Tomita M, Ishihama Y, Fukao T
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 19 Pages: 490-497

    • DOI

      10.1261/rna.036608.112

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 小分子RNAを介したゲノムレベルの自己と非自己の認識2013

    • Author(s)
      岩崎由香、齋藤都暁
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 31 Pages: 98-106

  • [Presentation] 霊長類生殖組織における小分子RNAの統合的解析

    • Author(s)
      岩崎由香、平野孝昌、Zachary Yu-Ching Lin, 今村公紀、佐々木えりか、岡野栄之、齋藤都暁、塩見美喜子、塩見春彦
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

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