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2014 Fiscal Year Annual Research Report

転移因子を抑制する新規小分子RNA機能の解析

Research Project

Project/Area Number 25830134
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

岩崎 由香  慶應義塾大学, 医学部, 助教 (80612647)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywords小分子RNA / 転移因子 / 遺伝子発現制御 / 生殖組織 / 非コードRNA / RNAサイレンシング / Argonauteタンパク質 / トランスポゾン
Outline of Annual Research Achievements

様々な生物種においてゲノムの大きな割合をトランスポゾン(転移因子)が占めており、これらを適切に制御することがゲノムの品質管理の鍵となる。しかしながら、ヒトをはじめとした霊長類においてどのような小分子RNAが発現し、トランスポゾンを抑制しているかについては未知の部分が大きい。そこで、霊長類モデル生物コモンマーモセット (Callithrix jacchus) の小分子RNAを次世代シーケンサにより網羅的に解析した。その結果、コモンマーモセット精巣において、トランスポゾン領域由来のmiRNAなどの新規miRNAを同定すると同時に、発現している小分子RNAの大部分がpiRNAに占められていることを見いだした。piRNAについてより詳細な解析を行うために、マーモセットPIWIタンパク質に対するモノクローナル抗体を作製し、これに結合するpiRNAを次世代シーケンサにより同定した。同定されたpiRNAの一部は、特定のtRNAおよび偽遺伝子から産生されており、これらがトランスポゾン並びにタンパク質コード遺伝子の発現調節を担う可能性を示した。一方で、piRNAの多くは、トランスポゾンと相同性が高いゲノム領域やトランスポゾンに由来していた。そこで、トランスポゾンの転移能とそこから発現するpiRNA量などの特徴を解析し、piRNA産生領域にトランスポゾンが転移することによりトランスポゾンを標的とするpiRNAが産生される、という抑制モデルを提唱した。

  • Research Products

    (9 results)

All 2015 2014

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Respective Functions of Two Distinct Siwi Complexes Assembled during PIWI-Interacting RNA Biogenesis in Bombyx Germ Cells2015

    • Author(s)
      Nishida K.M., Iwasaki Y.W., Murota Y., Nagao A., Mannen T., Kato Y., Siomi H., Siomi M.C.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 10 Pages: 193-203

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2014.12.013

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] PIWI-interacting RNA: Its Biogenesis and Functions2015

    • Author(s)
      Iwasaki Y.W., Siomi M.C., Siomi H.
    • Journal Title

      Annual Review of Biochemistry

      Volume: 84 Pages: 25.1-25.29

    • DOI

      10.1146/annurev-biochem-060614-034258

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Small RNA profiling and characterization of piRNA clusters in the adult testes of the common marmoset. a model primate2014

    • Author(s)
      Hirano T., Iwasaki Y.W., Lin Z.Y., Imamura M., Seki N.M., Sasaki E., Saito K., Okano H., Siomi M.C., Siomi H.
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 20 Pages: 1223-1237

    • DOI

      10.1261/rna.045310.114

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Yb integrates piRNA intermediates and processing factors into perinuclear bodies to enhance piRISC assembly2014

    • Author(s)
      Murota Y., Ishizu H., Nakagawa S., Iwasaki Y.W., Shibata S., Kamatani M.K., Saito K., Okano H., Siomi H., Siomi M.C.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 8 Pages: 103-113

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2014.05.043

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Epigenetic silencing of miR-210 increases the proliferation of gastric epithelium during chronic Helicobacter pylori infection.2014

    • Author(s)
      Kiga K., Mimuro H., Suzuki M., Shinozaki-Ushiku A., Kobayashi T., Sanada T., Kim M., Ogawa M., Iwasaki Y.W., Kayo H., Fukuda-Yuzawa Y., Yashiro M., Fukuyama M., Fukao T., Sasakawa C.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 5 Pages: 4497

    • DOI

      10.1038/ncomms5497

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] miRNA regulatory ecosystem in early development2014

    • Author(s)
      Iwasaki Y.W., Siomi H.
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 56 Pages: 615-616

    • DOI

      DOI 10.1016/j.molcel.2014.11.010

    • Open Access
  • [Presentation] Piwi-piRNA regulates association of linker histone H1 with target transposon loci in Drosophila2015

    • Author(s)
      Iwasaki Y.W., Ishizu H., Shibuya A., Iyoda Y., Siomi M.C., Siomi H., Saito K.
    • Organizer
      The Twentieth Annual Meeting of the RNA Society (RNA2015)
    • Place of Presentation
      Madison, Wisconsin, USA
    • Year and Date
      2015-05-26 – 2015-05-31
  • [Presentation] Piwi-piRNA regulates association of histone H1 with target chromatin loci2014

    • Author(s)
      Iwasaki Y.W., Shibuya A., Ohtani H., Siomi M.C., Siomi H., Saito K.
    • Organizer
      Cell Symposia Regulatory RNAs
    • Place of Presentation
      Berkeley, California, USA
    • Year and Date
      2014-10-19 – 2014-10-24
  • [Presentation] 霊長類生殖組織におけるトランスポゾン抑制小分子RNAの解析2014

    • Author(s)
      岩崎由香、平野孝昌、Lin Zachary Yu-Ching, 今村公紀、關菜央美、佐々木えりか、齋藤都暁、岡野栄之、塩見美喜子、塩見春彦
    • Organizer
      日本遺伝学会第86回大会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学、長浜
    • Year and Date
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • Invited

URL: 

Published: 2016-06-01  

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