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2013 Fiscal Year Research-status Report

核様体に局在する酸化ストレス消去タンパク質群によるゲノムDNA維持システムの解明

Research Project

Project/Area Number 25840002
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

大庭 良介  筑波大学, 医学医療系, 助教 (30447883)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords核様体 / 酸化ストレス / 細菌 / 染色体
Research Abstract

酸化ストレスからのゲノムDNAの保護は、細胞生命の維持にとって重要である。申請者は、細菌の核様体(染色体)タンパク質の網羅的解析から、様々な酸化ストレス消去タンパク質が、核様体に局在することを見出した。本研究では、酸化ストレス消去タンパク質がゲノムDNA上に局在し、活性酸素種の無効化や発生阻止によって、ゲノムDNAを保護するという仮説を検証する。環境が変化するとゲノムに局在する酸化ストレス消去タンパク質が入れ替わることから、いくつかの酸化ストレス無効化システムが環境に応じて使い分けられていることが示唆される。そこで、「環境変化に応答したゲノム上の酸化ストレス無効化システムの変化」の分子機序を解明し、生物の酸化ストレス応答における新戦略を明らかにすることを目的としていた。平成25年度は、1.酸化ストレス消去タンパク質のゲノム上の局在領域の決定、2.局在様式間のクロストーク解析、3.核様体への局在制御因子の決定、を計画していた。ここで、大腸菌のSodA&B, TrxA&Bの抗体で架橋・断片化した核様体を免疫沈降する必要があり、これら抗体の準備が必須であった。コマーシャルに入手できないことから、独自にHisタグ付きタンパク質を発現させ、ニッケルカラム及びイオン交換クロマトによってタンパク質を精製し、ウサギポリクローナル抗体を作成した。作成した抗体はウエスタン解析により評価し、個々のタンパク質を十分に認識することを確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

抗体の準備に時間がかかった。

Strategy for Future Research Activity

抗体が作成できたので、今後は計画を遂行していく予定である。

  • Research Products

    (4 results)

All 2013

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Atomic force microscopy analysis of the role of major DNA-binding proteins in organization of the nucleoid in Escherichia coli.2013

    • Author(s)
      Ohniwa RL, Muchaku H, Saito S, Wada C and Morikawa K
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 8 Pages: e72954

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0072954

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conservation of two distinct types of 100S ribosome in bacteria.2013

    • Author(s)
      3. Ueta M, Wada C, Daifuku T, Sako Y, Bessho Y, Kitamura A, Ohniwa RL, Morikawa K, Yoshida H, Kato T, Miyata T, Namba K, Wada A.
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 18 Pages: 554-574

    • DOI

      10.1111/gtc.12057

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A genomic DNA protection system2013

    • Author(s)
      Ryosuke L. Ohniwa, Yuri Ushijima, Kazuya Morikawa.
    • Organizer
      1st Singapore-Japan-India Joint Symposium on Protein-DNA interactions in Prokaryotic nucleoid and Eukaryotic chromatin
    • Place of Presentation
      National University of Singapore
    • Year and Date
      20130722-20130723
    • Invited
  • [Presentation] Althernative cardiolipin synthase Cls1 compensates for stalled Cls2 function in Staphylococcus aureus under conditions of acute acid stress2013

    • Author(s)
      Ryosuke L. Ohniwa, Kana Kibatayashi, Kazuya Morikawa
    • Organizer
      7th International Conference on Gram-Positive Microorganisims
    • Place of Presentation
      Italy (Tsucany)
    • Year and Date
      20130623-20130627

URL: 

Published: 2015-05-28  

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