2016 Fiscal Year Annual Research Report
Chromatin dynamics induced by inflammatory stimulation
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26250041
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
和田 洋一郎 東京大学, アイソトープ総合センター, 教授 (10322033)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
藤井 穂高 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (30302665)
神吉 康晴 東京大学, アイソトープ総合センター, 助教 (00534869)
興梠 貴英 自治医科大学, 医学部, 准教授 (40401046)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | ゲノム解析技術 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
転写複合体（転写ファクトリー）という概念は、英国のCookらによって1970年代に提唱されたが、その実体については明らかになっていない点が多い。酵母では2012年にKageyらによってメディエーター複合体という巨大な複合装置が報告されている。我々は哺乳動物を対象とした実験により、転写複合体の存在を示唆する“転写の波”を報告（和田＆大田ら、PNAS, 2009, Science, Editor’s choice, 2009）し、これがクロマチン構造変化を伴うことを見出し、これを引き起こす原動力となる転写複合体の実体の解明を進めてきた(Papantonis & Kohroら、EMBO J, 2012)。
転写ファクトリーは複数の遺伝子群を同時に転写するため、クロマチン相互作用を引き起こし、これによって転写サイクルの進展に伴うクロマチン構造変化が生じる。そこで、本研究では、ヒト細胞の転写複合体の本体を明らかにする為、従来と同一の血管内皮細胞の炎症刺激系において、活性型RNAポリメレースII（Pol II）抗体を用いた網羅的クロマチン相互作用解析を行う。そのために、免疫沈降効率の良いモノクローナル抗体を樹立する。そして得られた近接する二点間の情報に基づいて、クロマチン全体の構造を推測する。そして、炎症刺激に応じて近接関係の変動を示す等、特異的なゲノム上領域に特異的に結合する蛋白複合体の同定を行い、その機能解析を行う事を目的としている。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Dynamically and epigenetically coordinated GATA/ETS/SOX transcription factor expression is indispensable for endothelial cell differentiation.2017
Author(s)
Kanki Y, Nakaki R, Shimamura T, Matsunaga T, Yamamizu K, Katayama S, Suehiro JI, Osawa T, Aburatani H, Kodama T, Wada Y, Yamashita JK, Minami T
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Journal Title
Nucleic Acids Res.
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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