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2014 Fiscal Year Annual Research Report

異常mRNA由来のタンパク質分解促進機構の解析

Research Project

Project/Area Number 26291002
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

稲田 利文  東北大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (40242812)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords品質管理 / 翻訳伸長阻害 / シャペロン / mRNA分解 / リボソーム / ユビキチン化 / プロテアソーム
Outline of Annual Research Achievements

正確な遺伝子発現は生命現象の根幹であり、その破綻や異常は様々な疾患の原因となる。本研究課題では、最も初期のタンパク質品質管理機構である異常mRNA由来の遺伝子産物の分解機構を解析した。平成26年度にはナンセンス変異を持った異常mRNA由来の短鎖型タンパク質分解機構の解析により、以下の結果が得られた。
①Upf複合体による短鎖型異常タンパク質の分解促進におけるユビキチン化の役割:Upf複合体による短鎖型タンパク質の分解促進には、ユビキチン化が必須であることが強く示唆された。
②Upf複合体による短鎖型異常タンパク質の認識機構の解明:出芽酵母におけるUnfoldタンパク質のモデルタンパク質であるヒトVHLタンパク質を用い、Upf複合体が短鎖型異常タンパク質のUnfoldな状態を維持し、プロテアソームによる分解を促進する可能性を検証した。VHL遺伝子の下流に異常な長い3’UTR(非翻訳領域)を挿入した場合、VHLタンパク質のプロテアソームによる分解がUpf1によって促進された。さらにElonginB/C複合体を同時に発現させ正しい折りたたみが起こった場合にUpf1による分解促進が抑制された。
③短鎖型異常タンパク質の分解促進を担う因子の同定:短鎖型異常タンパク質と共精製される因子を同定し、分解促進における機能を検証した。異常に長い3’UTRに依存して、Upf1 とHsp70が短鎖型異常タンパク質と特異的に共精製された。さらに、短鎖型異常タンパク質と共精製される因子としてが質量分析により同定された。Hsp70と複合体を形成し、ADP/ATPの交換反応と共役して基質のフォールディング反応を促進することが示されているSse1が短Upf1による短鎖型異常タンパク質の分解促進に必要であった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

(1)ノンストップmRNA由来の異常タンパク質分解機構の解明:リボソームとLtn1複合体のクライオ電顕による構造解析の結果が複数の研究室から報告され、基質認識機構の詳細が明らかとなっため、研究計画の変更することとなった。しかしながら、(2)ナンセンス変異を持った異常mRNA由来の短鎖型タンパク質分解機構の解析、については上記の3つの点を解明できた。特に、Upf1による短鎖型異常タンパク質の分解促進に、Hsp70のコシャペロンであるSse1が必須であることが明らかになり、分子機構の理解が進んだ。従って、本研究課題は、全体として概ね順調に進展していると自己評価する。

Strategy for Future Research Activity

最も初期のタンパク質品質管理機構である異常mRNA由来の遺伝子産物の分解機構の解明を目指し、以下の2項目について研究を実施する。
(1)ノンストップmRNA由来の異常タンパク質分解機構の解明:
①ユビキチンライゲースLtn1による分解機構の解明:E3ユビキチンライゲースLtn1は、60Sサブユニットに特異的に結合して異常タンパク質をユビキチン化する。リボソームとLtn1複合体のクライオ電顕による構造解析の結果が複数の研究室から報告され、基質認識機構の詳細が明らかとなった。研究代表者は、異常タンパク質分解機構に関与するE3ユビキチンライゲースとして Hel2を同定したため、ノンストップmRNA由来の異常タンパク質分解におけるHel2の機能を解析する。
②異常翻訳を認識し解消する分子機構の解析:研究代表者は、新規翻訳複合体Dom34:Hbs1複合体がノンストップmRNAの3’末端で停滞したリボソームのAサイトに結合し、サブユニットの解離を担う因子であることを証明した。Dom34:Hbs1は、リボソームを解離させることでノンストップmRNAの迅速な分解へ導くと同時に、終止コドンに依存しないペプチド鎖の解離反応にも必須であるが、ペプチド鎖解離活性自体は保持しない。ノンストップmRNA由来の異常タンパク質分解機構の理解に必須な、終止コドン非依存のペプチド鎖解離因子の同定をめざす。
(2)ナンセンス変異を持った異常mRNA由来の短鎖型タンパク質分解機構の解析
研究代表者は、Upf1による短鎖型異常タンパク質の分解促進には、Hsp70と複合体を形成し、ADP/ATPの交換反応と共役して基質のフォールディング反応を促進するSse1が必須であることを見出した。Sse1の各種変異体を用いて、Upf1によってシャペロン群の活性が制御され、短鎖型異常タンパク質がUnfold状態に維持されるモデルを検証する。

  • Research Products

    (9 results)

All 2014 Other

All Presentation (8 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] 翻訳伸長複合体の運命決定機構2014

    • Author(s)
      稲田 利文
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [Presentation] Ubiquitylation of ribosomal proteins governs the fate of stalled ribosomes2014

    • Author(s)
      Toshifum Inada
    • Organizer
      Joint Australia and Japan RNA meeting
    • Place of Presentation
      University of Technology,Sydney,Australia
    • Year and Date
      2014-11-02 – 2014-11-05
    • Invited
  • [Presentation] 翻訳伸長複合体の品質管理機構におけるユビキチン化の新規機構2014

    • Author(s)
      稲田 利文
    • Organizer
      第87回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館・グランドプリンスホテル京都
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-18
  • [Presentation] Hel2 induces ribosome quality control by ubiquitination of 40S ribosomal proteins in stalled ribosomes2014

    • Author(s)
      Toshifum Inada
    • Organizer
      Translational Control
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor Laboratory,NY,USA
    • Year and Date
      2014-09-02 – 2014-09-06
    • Invited
  • [Presentation] Ribosome assosiated E3 ubiquitin ligase complex is required for mRNA and protein quality control systems induced by translation arrest2014

    • Author(s)
      Toshifum Inada
    • Organizer
      Post-Transcriptional Control of Gene Expression: Mechanism of mRNA Decay
    • Place of Presentation
      BigSky,Montana,USA
    • Year and Date
      2014-07-06 – 2014-07-11
  • [Presentation] 新生鎖依存の翻訳アレストによる品質管理機構におけるユビキチン因子複合体の新規機能2014

    • Author(s)
      稲田 利文
    • Organizer
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ワークピア横浜 横浜産貿ホール マリネリア
    • Year and Date
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • Invited
  • [Presentation] Ribosome ubiquitination induces protein quality control by translation arrest2014

    • Author(s)
      Toshifum Inada
    • Organizer
      Ubiquitin and Cellular Regulation
    • Place of Presentation
      Saxtons River,Vermont,USA
    • Year and Date
      2014-06-15 – 2014-06-20
  • [Presentation] Ribosome as a hub for protein and mRNA quality control2014

    • Author(s)
      Toshifum Inada
    • Organizer
      第66回日本細胞生物学会大会国際シンポジウム
    • Place of Presentation
      奈良県新公会堂・東大寺総合文化センター
    • Year and Date
      2014-06-11 – 2014-06-13
    • Invited
  • [Remarks] 東北大学大学院薬学研究科遺伝子制御薬学分野

    • URL

      http://www.pharm.tohoku.ac.jp/~idenshi/inada_lab_HP/Home.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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