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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular structures of the nuclear pore complex in Tetrahymena

Research Project

Project/Area Number 26291007
Research InstitutionNational Institute of Information and Communications Technology

Principal Investigator

原口 徳子  国立研究開発法人情報通信研究機構, 未来ICT研究所フロンティア創造総合研究室, 主任研究員 (20359079)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords細胞・組織 / 生体分子 / 蛋白質 / 発生・分化
Outline of Annual Research Achievements

繊毛虫テトラヒメナには、ひとつの細胞内に、大核・小核という構造と機能の異なる2種類の核が存在する。本研究は、核膜孔複合体の分子あるいは構造が、核機能分化に関与する仕組みとその構造的基盤を明らかにするものである。前年度に引き続き、次の2項目の解析を行った。
項目1)大小核の核膜孔複合体(NPC)を構成する全ヌクレオポリンを同定することで、大小核の核膜孔の構造的な違いを分子レベルで明らかにすることが目的である。これまでに、マススペクトル解析に加え、インシリコの実験を行うことにより、新たなクレオポリン候補タンパク質を同定した。それらの候補タンパク質のGFP融合タンパク質をテトラヒメナで発現し、既知のヌクレオポリンとの共局在性から新規ヌクレオポリンを同定した。GFP融合タンパク質の蛍光量を測定し、大小核に特異的なあるいは偏在するヌクレオポリンを明らかにした。大小核に特異的なヌクレオポリンとしてMacNup214, MicNup214, MacNup153, MicNup153, Pom121, Pom82を同定した。Pom121とPom82については、免疫電子顕微鏡法による解析を行い、核膜孔のどの位置に存在するか決定した。これらの解析によって、大小核NPCの構造的な違いを明らかにした。
項目2)受精後の核が大小核へ分化する過程を生細胞イメージングで解析し、核膜孔と核分化との時空間的な関係を明らかにすることが目的である。項目1)で発見された因子が分化に関与する可能性を探るために、受精後の核が大小核へ分化する過程を生細胞イメージング法で解析した。その結果、新規に発見したヌクレオポリンのひとつが、核分化に先立って分化予定核に出現することを見いだした。このヌクレオポリンの、核分化における役割を明らかにするために、遺伝子ノックアウト株の作製を行い、その表現型を解析した。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (25 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (15 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 15 results,  Open Access: 8 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Chicago University/Cornell University/University of California, Santa Barbara(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Chicago University/Cornell University/University of California, Santa Barbara
  • [Journal Article] Compositionally distinct nuclear pore complexes of functionally distinct dimorphic nuclei in ciliate Tetrahymena2017

    • Author(s)
      Iwamoto M, Osakada H, Mori C, Fukuda Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 130-10 Pages: 1822-1834

    • DOI

      10.1242/jcs.199398

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A late endosomal syntaxin and the AP-3 complex are required for formation and maturation of lysosome-related secretory organelles (mucocysts) in Tetrahymena thermophile2017

    • Author(s)
      Kaur H, Sparvoli D, Osakada H, Iwamoto M, Haraguchi T, Turkewitz A.P
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1091/mbc.E17-01-0018

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Function of nuclear membrane proteins in shaping the nuclear envelope integrity during closed mitosis.2017

    • Author(s)
      Yang H-J, Iwamoto M, Hiraoka Y, Haraguchi T
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry

      Volume: 161-1 Pages: 471-477

    • DOI

      10.1093/jb/mvx020

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Fission yeast APC/C activators Slp1 and Fzr1 sequentially trigger two consecutive nuclear divisions during meiosis.2017

    • Author(s)
      Chikashige Y, Yamane M, Okamasa K, Osakada H, Tsutsumi C, Nagahama Y, Fukuta N, Haraguchi T, Hiraoka Y
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 591-7 Pages: 1029-1040

    • DOI

      10.1002/1873-3468.12612

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vitro reconstitution and biochemical analyses of the Schizosaccharomyces pombe nucleosome.2017

    • Author(s)
      Koyama M, Nagakura W, Tanaka H, Kujirai T, Chikashige Y, Haraguchi T, Hiraoka Y, Kurumizaka H
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 482 Pages: 896-901

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.11.130.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lipid droplet dynamics during Schizosaccharomyces pombe sporulation and their role in spore survival.2017

    • Author(s)
      Yang H-J, Osakada H, Kojidani T, Haraguchi T, Hiraoka Y
    • Journal Title

      Biology Open

      Volume: 6 Pages: 217-222

    • DOI

      10.1242/bio.022384

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] ライブクレム顕微鏡法2017

    • Author(s)
      原口徳子、平岡泰
    • Journal Title

      生産と技術

      Volume: 69-2 Pages: 59-64

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Performance Evaluation of Leader-follower-based Mobile Molecular Communication Networks for Target Detection Applications.2016

    • Author(s)
      Nakano T, Okaie Y, Kobayashi S, Koujin T, Chan C-H, Hsu Y-H, Okaie Y, Obuchi T, Hara T, Hiraoka Y, Haraguchi T
    • Journal Title

      IEEE Transactions on Communications

      Volume: 65-2 Pages: 663-676

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatial organization of the Schizosaccharomyces pombe genome within the nucleus.2016

    • Author(s)
      Matsuda A, Asakawa H, Haraguchi T, Hiraoka Y
    • Journal Title

      Yeast

      Volume: 34-2 Pages: 55-66

    • DOI

      10.1002/yea.3217

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A genetically encoded probe for live-cell imaging of H4K20 monomethylation. Journal of Molecular Biology2016

    • Author(s)
      Sato Y, Kujirai T, Arai R, Asakawa H, Ohtsuki C, Horikoshi N, Yamagata K, Ueda J, Nagase T, Haraguchi T, Hiraoka Y, Kimura A, Kurumizaka H, Kimura H
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: 428-20 Pages: 3885-3902

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2016.08.010

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Live correlative light-electron microscopy to observe molecular dynamics in high resolution.2016

    • Author(s)
      Kobayashi S, Iwamoto M, Haraguchi T
    • Journal Title

      Microscopy (Oxf)

      Volume: 65-4 Pages: 296-308

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfw024

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Identification of conserved MEL-28/ELYS domains with essential roles in nuclear assembly and chromosome segregation.2016

    • Author(s)
      Gomez-Saldivar G, Fernandez A, Hirano Y, Mauro M, Lai A, Ayuso C, Haraguchi T, Hiraoka Y, Piano F, Askjaer P
    • Journal Title

      PLoS Genetics

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1006131

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Inner nuclear membrane protein Lem2 augments heterochromatin formation in response to nutritional conditions.2016

    • Author(s)
      Tange Y, Chikashige Y, Takahata S, Kawakami K, Higashi M, Mori C, Kojidani T, Hirano Y, Asakawa H, Murakami Y, Haraguchi T, Hiraoka Y
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 21 Pages: 812-832

    • DOI

      10.1111/gtc.12385

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Depletion of autophagy receptor p62/SQSTM1 enhances the efficiency of gene delivery in mammalian cells.2016

    • Author(s)
      Tsuchiya M, Ogawa H, Takako K, Kobayashi S, Mori C, Hiraoka Y, Haraguchi T
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 590 Pages: 2671-2680

    • DOI

      10.1002/1873-3468, 12262

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interphase adhesion geometry is transmitted to an internal regulator for spindle orientation via caveolin-1.2016

    • Author(s)
      Matsumura S, Kojidani T, Kamioka Y, Uchida S, Haraguchi T, Kimura A,Toyoshima F
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1038/ncomms11858

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 繊毛虫テトラヒメナの二種類の核を分ける核膜孔複合体の構造と動態2017

    • Author(s)
      岩本政明、平岡泰、原口徳子
    • Organizer
      日本藻類学会第41回大会
    • Place of Presentation
      高知大学(高知県、高知市)
    • Year and Date
      2017-03-23 – 2017-03-23
    • Invited
  • [Presentation] 癌で見られる微小核の形成と維持に対する核膜の役割2017

    • Author(s)
      原口徳子、荒神尚子、小坂田裕子、糀谷知子、舛本寛、平岡泰
    • Organizer
      第34回染色体ワークショップ・第15回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      かずさアカデミアホール(千葉県・木更津市)
    • Year and Date
      2017-01-12 – 2017-01-12
  • [Presentation] 機能の異なる2核をもつテトラヒメナの核膜孔複合体構造と核分化での核膜孔・核膜動態2016

    • Author(s)
      岩本政明、荒神尚子、小坂田裕子、森知栄、長尾恒治、小布施力史、平岡泰、原口徳子
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県、横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-01 – 2016-12-01
    • Invited
  • [Presentation] 癌で見られる微小核の形成と維持の仕組み:核膜の役割2016

    • Author(s)
      原口徳子、荒神尚子、小坂田裕子、糀谷知子、小林昇平、平岡泰
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城県、仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-25
    • Invited
  • [Presentation] Super-resolution imaging and precise distance measurements in live fission yeast cells.2016

    • Author(s)
      Matsuda A, Haraguchi T, Hiraoka Y
    • Organizer
      The 14th International Congress on Yeast
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県・淡路市)
    • Year and Date
      2016-09-14 – 2016-09-14
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Live CLEM imaging to observe molecular dynamics in high resolution: application to yeast cells.2016

    • Author(s)
      Haraguchi T, Asakawa H, Kojidani T, Hiraoka Y.
    • Organizer
      The 14th International Congress on Yeast
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県・淡路市)
    • Year and Date
      2016-09-14 – 2016-09-14
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] Fission Yeast: A Laboratory Manual2016

    • Author(s)
      Asakawa H, Ding DQ, Haraguchi T, Hiraoka Y
    • Total Pages
      487(230-235)
    • Publisher
      Cold Spring Harbor Laboratory Press
  • [Remarks] 情報通信研究機構 未来ICT研究所 生物情報グループ 発表リスト

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/frontier/seibutsu/CellMagic/publication.html

  • [Remarks] 情報通信研究機構 未来ICT研究所 生物情報グループ

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/frontier/seibutsu/CellMagic/

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-02-16  

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