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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Genetic anthropology of skin functions and microbiome in Asian populations

Research Project

Project/Area Number 26291095
Research InstitutionUniversity of the Ryukyus

Principal Investigator

木村 亮介  琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (00453712)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大橋 順  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (80301141)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords細菌叢 / 皮膚 / 多様性 / ヒト / ゲノム
Outline of Annual Research Achievements

1)沖縄在住の健常ボランティアを対象に、本年度7月(116名)および2月(46名)にアクネ菌の代謝物であるポルフィリンの量を計測し、皮膚の油分量、水分量、色(メラニン量)などとの関連を調べた。昨年度までに収集したデータと合わせて重回帰分析をおこなった結果、額のポルフィリン強度は、額の油分量が多いほど、また皮膚色が淡いほど有意に大きくなることが示された。鼻のポルフィリン強度に関しては、皮膚色および季節(夏よりも冬で大きい)と強い関連が示された。皮膚色がポルフィリン強度(鼻)と関連するメカニズムについては、①紫外線による殺菌効果あるいは②メラニンの抗菌効果が関与していることが考えられる。今後、更なる研究により、皮膚色とポルフィリン強度およびアクネ菌増殖との因果関係を明らかにする必要がある。
2)リアルタイムPCR法を用いて、皮膚細菌叢サンプルにおける細菌由来DNAの定量分析方法を確立した。細菌由来DNA量は、16SrRNA解析の細菌由来配列リード数、Propionibacteriumの割合、ポルフィリン強度と相関することを確認した。
3)ABCC11およびEDARの多型と額のポルフィリン強度との関連を調べた結果、両遺伝子のアジア型変異はともに顔面の油分量を抑える働きがあること、ポルフィリン量に関して、EDARの遺伝子型は、ABCC11の遺伝子型によって逆の効果をもつことが判明した。つまり、ABCC11とEDARの多型の間には、皮膚形質において独立した効果だけでなく、共通の効果および交互作用効果が存在し、両遺伝子座でアジア型変異をもつことが有利となる可能性が示された。しかしながら、ABCC11 とEDARの多型が皮膚細菌叢の構成に与える効果については、統計的に有意な結果は得られなかった。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Polymorphisms associated with a tropical climate and root crop diet induce susceptibility to metabolic and cardiovascular diseases in Solomon Islands.2017

    • Author(s)
      Furusawa T, Naka I, Yamauchi T, Natsuhara K, Eddie R, Kimura R, Nakazawa M, Ishida T, Ohtsuka R, Ohashi J
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 12 Pages: e0172676

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0172676

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Whole-body patterns of the range of joint motion in young adults: masculine type and feminine type.2016

    • Author(s)
      Moromizato K, Kimura R, Fukase H, Yamaguchi K, Ishida H
    • Journal Title

      Journal of Physiological Anthropology

      Volume: 35 Pages: 23

    • DOI

      10.1186/s40101-016-0112-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Interpopulation differentiation and neutrality in the human face.2017

    • Author(s)
      Kimura R
    • Organizer
      Workshop Human evolution in Eurasia elucidated through Genetics, Archeology, and Linguistics
    • Place of Presentation
      National Institute of Genetics, Shizuoka
    • Year and Date
      2017-03-15 – 2017-03-19
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] アジア・オセアニア集団で観察される古代人ハプロタイプの適応的遺伝子移入2016

    • Author(s)
      中 伊津美, 木村亮介, 古澤拓郞, 山内太郎, 夏原和美, 中澤港, 安高雄治, 石田貴文, 稲岡司, 松村康弘, 大塚柳太郎, 大橋順
    • Organizer
      第70回日本人類学会大会
    • Place of Presentation
      NSG学生総合プラザSTEP(新潟県新潟市)
    • Year and Date
      2016-10-08 – 2016-10-10
  • [Remarks] 琉球大学大学院医学研究科人体解剖学講座

    • URL

      http://w3.u-ryukyu.ac.jp/anatomy1/

  • [Remarks] 亜熱帯島嶼の時空間ゲノミクス -環境・微生物・家畜・ヒトの相互作用から疾病の内因と外因を探る-

    • URL

      http://w3.u-ryukyu.ac.jp/anthropology/jikuukan/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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