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2014 Fiscal Year Annual Research Report

東アジアにおける『寒冷適応=肥満抗性仮説』の実証に向けたゲノム人類学研究

Research Project

Project/Area Number 26291096
Research InstitutionJichi Medical University

Principal Investigator

中山 一大  自治医科大学, 医学部, 講師 (90433581)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 渡邉 和寿  自治医科大学, 医学部, 助教 (60724416)
大橋 順  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (80301141)
西村 貴孝  長崎大学, 医歯(薬)学総合研究科, 助教 (80713148)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsゲノム / 肥満 / 寒冷適応 / 進化 / 東アジア
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、北方系集団としてモンゴル人、日本人・中国漢人、南方系集団としてタイ人、パラオ人を対象として、北方集団で顕著に認められる正の自然選択の痕跡をゲノムワイドに探索した。その結果、 特に北方に位置するモンゴル人において著明な正の自然選択の痕跡を認めるゲノム領域計9個を同定した。その中には、既知の肥満関連遺伝子の他に、げっ歯類で褐色脂肪細胞の分化・機能に関与していることが報告されている遺伝子も含まれていた。現在は、日本人3013名をはじめとした東アジア・オセアニア人の大規模ゲノムコホートを用いて、当該領域に含まれるSNP遺伝型と肥満形質との関連を検討中である。
内臓脂肪面積は全身のエネルギーバランスに応じて素早く増減するため、ボディマス指標などで表される全身の肥満度に比べて、熱産生に関連する遺伝子多型の影響を強く受けていることを、UCP1 -3826G/Aを対象とした研究で既に報告している。かねてからヒトの寒冷適応への関与が指摘されてきたSNPであるUCP3-55C/TとRPTOR-26934C/Tについて、日本人3013名のゲノムコホートを用いて内臓脂肪面積との関連を調査した。その結果、これら2つのSNPの内臓脂肪面積への影響は観察されなかった。また、先の北方系アジア人でRPTORおよびUCP3周辺のハプロタイプ構造を調査した結果、自然選択の関与を示唆する多様性パターンは認められなかったことから、両SNPの寒冷適応形質への寄与は当初の想定よりも弱いと考えられた。
加えて、日本人の内臓脂肪面積に強い影響を与える新規の遺伝子多型として、消化管ホルモンであるGIPの遺伝子近傍のSNPを同定した。GIPには脂肪蓄積を促す作用がある一方、げっ歯類で寒冷刺激に対する代謝適応機構に関与していることが報告されているので、ヒトの寒冷適応機構での役割についても今後検討する。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ゲノムワイドなSNP情報を用いた進化遺伝学的解析により、寒冷適応に寄与したと考えられる興味深い遺伝子が複数捕捉できており、平成27年度以降の研究が当初の計画どおりに進行する算段が高くなった。また、いくつかの候補遺伝子解析でも一定の成果を挙げている。生理人類学実験の準備に少々の遅延があったが、次年度で十分に対応可能である。

Strategy for Future Research Activity

平成26年度で得られた、寒冷適応遺伝子多型の候補について、東アジア・オセアニア人の大規模ゲノムコホートを用いて、肥満形質との関連解析を行う。表現型との強い関連が認められた多型については、分子生物学・細胞生物学的手法を用いてその機能的意義を明らかにする。さらに、これらの遺伝子多型と寒冷適応能との関連を、人工気候室を用いた生理人類学実験により実証する。

Causes of Carryover

未使用額を用いて南方系アジア人であるタイ人のゲノムワイドSNP情報をさらに追加で48人分取得する予定だったが、公共データベース上で中国南部のタイ族のゲノムワイドSNP情報が利用可能になったために、タイピングを実施しなかった。加えて、生理人類学実験の準備が予定より遅れたので、これの費用も次年度使用とした。

Expenditure Plan for Carryover Budget

データベースから入手できるSNPデータセットが1集団につき概ね100人程度なのに対し、本課題で新たにタイピングしたモンゴル人のSNPデータは48人分なので、サンプルサイズのバランスを取るためにモンゴル人の追加48人分のゲノムワイドSNP解析費用に充てる。また、生理人類学実験の準備に充てる。

  • Research Products

    (17 results)

All 2015 2014

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 8 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Seasonal variation of non-shivering thermogenesis (NST) during mild cold exposure2015

    • Author(s)
      Nishimura T, Motoi M, Egashira Y, Choi D, Aoyagi K, Watanuki S.
    • Journal Title

      Journal of Physiological Anthropology

      Volume: 34 Pages: 11

    • DOI

      10.1186/s40101-015-0051-9.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Seasonal effects of the UCP3 and the RPTOR gene polymorphisms on obesity traits in Japanese adults.2014

    • Author(s)
      Nakayama K, Miyashita H, Iwamoto S
    • Journal Title

      Journal of Physiological Anthropology

      Volume: 33 Pages: 38

    • DOI

      10.1186/1880-6805-33-38

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Common variants of GIP are associated with visceral fat accumulation in Japanese adults2014

    • Author(s)
      Nakayama K, Watanabe K, Boonvisut S, Makishima S, Miyashita H, Iwamoto S
    • Journal Title

      American Journal of Physiology Gastrointestinal and Liver Physiology

      Volume: 307 Pages: G1108-G1114

    • DOI

      10.1152/ajpgi.00282.2014

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 健診集団試料を用いたMLXIPL Gln241His多型の適応的意義の検討2014

    • Author(s)
      中山 一大, 宮下 洋, 岩本禎彦
    • Journal Title

      日本生理人類学会誌

      Volume: 19 Pages: 63-67

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Effects of chronic leptin infusion on subsequent body weight and composition in mice: can body weight set point be reset?2014

    • Author(s)
      Watanabe K, Mueller BR, Skowronski AA, Rosenbaum M, Leibel RL
    • Journal Title

      Molecular Metabolism

      Volume: 3 Pages: 432-440

    • DOI

      10.1016/j.molmet.2014.02.003

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Effects of a novel MC4R agonist on maintenance of reduced body weight in diet induced obese mice.2014

    • Author(s)
      2.Skowronski AA, Morabito MV, Mueller BR, Lee S, Hjorth S, Lehmann A, Watanabe K, Zeltser LM, Ravussin Y, Rosenbaum M, Leduc CA, Leibel RL
    • Journal Title

      Obesity

      Volume: 22 Pages: 1287-1295

    • DOI

      10.1002/oby.20678

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Beta cell dysfunction due to increased ER stress in a stem cell model of Wolfram syndrome.2014

    • Author(s)
      3.Shang L, Hua H, Foo K, Martinez H, Watanabe K, Zimmer M, Kahler DJ, Freeby M, Chung W, LeDuc CA, Goland R, Leibel RL, and Dieter Egli
    • Journal Title

      Diabetes

      Volume: 63 Pages: 923-933

    • DOI

      10.2337/db13-0717

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Relationship between mitochondrial haplogroup and seasonal changes of physiological responses to cold.2014

    • Author(s)
      Nishimura T, Watanuki S.
    • Journal Title

      Journal of Physiological Anthropology

      Volume: 33 Pages: 27

    • DOI

      10.1186/1880-6805-33-27.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Genetics of fat distribution and metabolism: Perspectives from human evolution2015

    • Author(s)
      Nakayama K
    • Organizer
      International Symposium on Human Adaptation to Environment and Whole-body Coordination 2015
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市
    • Year and Date
      2015-03-15
    • Invited
  • [Presentation] アジア・オセアニア人における代謝特性の民族差の理解を目指したゲノムワイドSNP研究2014

    • Author(s)
      中山 一大、大橋順、香川靖雄、岩本禎彦
    • Organizer
      第68回日本人類学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2014-11-01
  • [Presentation] Genetic variation of the Tribbles family and metabolic syndrome2014

    • Author(s)
      Nakayama K
    • Organizer
      The 11the International Nikko Symposium
    • Place of Presentation
      栃木県下野市
    • Year and Date
      2014-10-30
  • [Presentation] GIPおよびGIPRの遺伝的多型は日本人成人の内臓脂肪蓄積と関連する2014

    • Author(s)
      中山一大、宮下洋、渡邉和寿、巻島咲穂、Boonvisut Supichay、岩本禎彦
    • Organizer
      第35回日本肥満学会
    • Place of Presentation
      宮崎県宮崎市
    • Year and Date
      2014-10-25
  • [Presentation] 新規糖尿病感受性遺伝子Ildr2の機能解析2014

    • Author(s)
      渡邉和寿、中山 一大、Leibel Rudolph、岩本 禎彦
    • Organizer
      第35回日本肥満学会
    • Place of Presentation
      宮崎県宮崎市
    • Year and Date
      2014-10-24
  • [Presentation] ヒトの生理値から集団を科学する2014

    • Author(s)
      西村貴孝
    • Organizer
      日本生理人類学会第70会大会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      2014-06-21
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム多様性情報からヒト集団を科学する。2014

    • Author(s)
      中山一大
    • Organizer
      日本生理人類学会第70会大会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      2014-06-21
    • Invited
  • [Presentation] 新規糖尿病感受性遺伝子Ildr2の機能解析2014

    • Author(s)
      渡邉和寿、Millings Elizabeth、Fischer Stuart、 Leduc Charles、中山 一大、Leibel Rudolph、岩本 禎彦
    • Organizer
      第68回 日本栄養・食糧学会
    • Place of Presentation
      北海道札幌市
    • Year and Date
      2014-05-31
  • [Presentation] モンゴル人と東アジア農耕民族の代謝特性の解明を目指したゲノム人類学研究2014

    • Author(s)
      中山 一大、大橋 順、Munkhtulga Lkhagvasuren、宮下 洋、岩本 禎彦
    • Organizer
      第68回日本栄養・食糧学会大会 
    • Place of Presentation
      北海道札幌市
    • Year and Date
      2014-05-31

URL: 

Published: 2016-06-01  

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