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2015 Fiscal Year Annual Research Report

東アジアにおける『寒冷適応=肥満抗性仮説』の実証に向けたゲノム人類学研究

Research Project

Project/Area Number 26291096
Research InstitutionJichi Medical University

Principal Investigator

中山 一大  自治医科大学, 医学部, 講師 (90433581)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 渡邉 和寿  自治医科大学, 医学部, 助教 (60724416)
大橋 順  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (80301141)
西村 貴孝  長崎大学, 医歯(薬)学総合研究科, 助教 (80713148)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords人類学 / 遺伝学 / 進化 / 肥満 / 熱産生
Outline of Annual Research Achievements

27年度は前年度までの実験・解析で得たモンゴル人91名のゲノムワイドSNP遺伝型情報、および1000人ゲノム計画(Phase3)の東アジア人の全ゲノムSNP遺伝型情報を統合した約200万のSNP遺伝型情報について、進化遺伝学解析を実施し、モンゴル人のような北方アジア集団で特異的に正の自然選択を受けたゲノム領域の同定を行った。iHS, nSL, XP-EHHなどのハプロタイプ延長を考慮した統計量と、集団間の遺伝型頻度差を考慮した統計量であるFstを組み合わせることにより、集団特的な正の自然選択の痕跡を複数発見することに成功した。その中には、これまでに褐色脂肪細胞の分化過程に関わっていることが報告されているZIC1/ZIC4転写因子や、酸化的リン酸化経路のコンポーネントの1つであるNDUFAF2など、熱産生に寄与することが強く疑われる遺伝子が含まれていた。また、特に明瞭な自然選択の痕跡を認めた3番染色体のセントロメア近傍に位置するSNP群が、モンゴル人における肥満関連形質(ボディマス指数、腹囲径、腹囲臀囲径比、血中レプチン濃度)と強く関連していることを見出した。同領域の近傍にはシナプス形成に関与するCADM2遺伝子、脂肪細胞の分化・機能に関わるVGLL3遺伝子が存在しており、同定されたSNP群がこれらの遺伝子の発現量などに影響を及ぼすかどうかを見極めていく予定である。
また、来年度実施する予定の生理人類学実験の準備も引き続き行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

モンゴル人のゲノムワイドSNPデータを加えた進化遺伝学的解析によって、当初の予測通りに熱産生に関与する遺伝子群に自然選択の痕跡を発見することができた。また、脳機能に関与する遺伝子群にも自然選択の痕跡を発見しており、今後の発展が期待できる。

Strategy for Future Research Activity

28年度は、前年度までに北方集団特異的な自然選択の痕跡を認めたSNPについて、日本人、モンゴル人、タイ人、オセアニア人からなるゲノムパネルをもちいて、ボディマス指数、内臓脂肪面積、血液生化学検査値などの計測値との関連解析を行う。人工気候室を用いた生理人類学実験によって熱産生能力を測定した被験者に対してこれらのSNPの遺伝型判定を行い、表現型との関連を検証する。26年度から研究成果を統合し、”寒冷適応=肥満抵抗性仮説”の実証となる遺伝子を同定する。

Causes of Carryover

生理人類学実験の準備に当初の予定よりも時間がかかり、実施が最終年度にずれ込んだため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

生理人類学実験にかかる試薬・消耗品類費、研究分担者の旅費、および被験者への謝金などに充てる。

  • Research Products

    (11 results)

All 2016 2015

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Replication analysis of genetic association of the NCAN-CILP2 region with plasma lipid levels and non-alcoholic fatty liver disease in Asian and Pacific ethnic groups.2016

    • Author(s)
      Boonvisut S, Nakayama K, Makishima S, Watanabe K, Miyashita H, Lkhagvasuren M, Kagawa Y, Iwamoto S
    • Journal Title

      Lipids Health Dis.

      Volume: 15 Pages: 8

    • DOI

      10.1186/s12944-016-0181-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Associations between a fatty acid desaturase gene polymorphism and blood arachidonic acid compositionsin Japanese elderly.2016

    • Author(s)
      Horiguchi S, Nakayama K, Iwamoto S, Ishijima A, Minezaki T, Baba M, Kontai Y, Horikawa C, Kawashima H, Shibata H, Kagawa Y, Kawabata T
    • Journal Title

      Prostaglandins Leukot Essent Fatty Acids.

      Volume: 105 Pages: 9-14

    • DOI

      10.1016/j.plefa.2015.11.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Circadian-relevant genes are highly polymorphic in autism spectrumdisorder patients.2016

    • Author(s)
      Yang Z, Matsumoto A, Nakayama K, Jimbo EF, Kojima K, Nagata K, Iwamoto S,Yamagata T
    • Journal Title

      Brain Dev.

      Volume: 38 Pages: 91-99

    • DOI

      10.1016/j.braindev.2015.04.006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The role of TRIB1 in lipid metabolism; from genetics to pathways.2015

    • Author(s)
      Iwamoto S, Boonvisut S, Makishima S, Ishizuka Y, Watanabe K, Nakayama K
    • Journal Title

      Biochem Soc Trans.

      Volume: 43 Pages: 1063-1068

    • DOI

      10.1042/BST20150094

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sin3A-associated protein, 18 kDa, a novel binding partner of TRIB1, regulates MTTP expression. J Lipid Res.2015

    • Author(s)
      Makishima S, Boonvisut S, Ishizuka Y, Watanabe K, Nakayama K, Iwamoto S.
    • Journal Title

      J Lipid Res.

      Volume: 56 Pages: 1145-1152

    • DOI

      10.1194/jlr.M057802

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Genetic evidence for contribution of human dispersal to the genetic diversity of EBA-175 in Plasmodium falciparum.2015

    • Author(s)
      Yasukochi Y, Naka I, Patarapotikul J, Hananantachai H, Ohashi J
    • Journal Title

      Malaria Journal.

      Volume: 14 Pages: 293

    • DOI

      10.1186/s12936-015-0820-2

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification of Genetic Variants for Visceral Fat Accumulation in Japanese.2015

    • Author(s)
      Nakayama K
    • Organizer
      The 12th International Congress of Physiological Anthropology
    • Place of Presentation
      千葉県千葉市
    • Year and Date
      2015-10-29 – 2015-10-29
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 高密度SNPジェノタイピングによるモンゴル人特異的な自然選択の検出2015

    • Author(s)
      中山一大, 大橋順、ルハグワスレン・ムンフトルガ、岩本禎彦
    • Organizer
      第69回日本人類学会大会
    • Place of Presentation
      東京都港区
    • Year and Date
      2015-10-11 – 2015-10-11
  • [Presentation] 寒冷適応に関わるUCP1 遺伝子型間のヒトにおける熱産生反応の違い2015

    • Author(s)
      西村貴孝,勝村啓史,本井碧,太田博樹,綿貫茂喜
    • Organizer
      第69回日本人類学会大会
    • Place of Presentation
      東京都港区
    • Year and Date
      2015-10-11 – 2015-10-11
  • [Presentation] 新 規糖尿病感受性遺伝子Ildr2の機能解析2015

    • Author(s)
      渡邉和寿、中山 一大、Supichaya Boonvisut、Leibel Rudolph、岩本 禎彦
    • Organizer
      第58回日本糖尿病学会、
    • Place of Presentation
      山口県下関市
    • Year and Date
      2015-05-21 – 2015-05-24
  • [Book] つい誰かに教えたくなる人類学63の大疑問2015

    • Author(s)
      中山一大、市石博(編) 日本人類学会教育普及委員会(監修)
    • Total Pages
      187
    • Publisher
      講談社

URL: 

Published: 2017-01-06  

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