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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of biosynthetic pathways towards tetrodotoxin and saxitoxin based on the structures of novel biosynthetic intermediates

Research Project

Project/Area Number 26292057
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

山下 まり  東北大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (50192430)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsテトロドトキシン / サキシトキシン / 生合成 / LC/MS / グアニジン
Outline of Annual Research Achievements

1. テトロドトキシン(TTX)の生合成研究:
これまで、TTXを有するイモリより、C10-C5が直接結合したTTX類縁体を発見し、単離、構造決定した。これらの化合物の構造は、これまでの予測TTX生合成経路に反し、Baeyer-Villiger monooxygenaseやC10-C5結合が開裂する反応で変換されると考えられた。また、これらのC10-C5結合を有するTTX類縁体の構造から、TTXの生合成前駆体は、モノテルペンであると推定した。本研究では2種の環構造を有する、微量の新規の環状グアニジン化合物を合計6種を単離、構造決定した。2種はTTXがモノテルペン由来であることを支持する構造を有し、他の4種はシャント化合物ではないかと考えた。また、これらの化合物が、日本、中国、米国の有毒イモリの6種に存在するかどうかをLC/MSで調べ、ほとんどが存在したため、これらの化合物はイモリにおけるTTX前駆体である可能性を示唆した。
2. サキシトキシン(STX)の生合成研究:
Neilanらが有毒藍藻の遺伝子よりSTXの生合成経路を推定したが、化学的に中間体の構造を十分に証明していなかった。我々はこれまで、STXの初期生合成中間体Int-A’,Int-C’2を化学合成して、LC/MSを用いて有毒藍藻および渦鞭毛藻類に存在することを初めて明らかにした。また、これらの中間体の15Nラベル体を合成して、有毒藍藻を用いて取り込み実験を行い、低毒のSTX類縁体のC1/C2に取り込まれることが証明できた。本研究では、さらに生合成経路でInt-C’2とC1/C2の間に存在すると考えられる化合物を、前述の15N体の取り込み実験をLC/MSにて精査し、Int-C’2の酸化物および3環性化合物の存在を推定し、新たな生合成経路を推定した。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (34 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (15 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 15 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 14 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Institute of Legal Medicine/University of Frankfurt/-(Germany)

    • Country Name
      Germany
    • Counterpart Institution
      Institute of Legal Medicine/University of Frankfurt/-
  • [Int'l Joint Research] Facultad de Bioquimica,Quimica,Farmacia/Universidad Nacional de Tucuma'n/-(アルゼンチン)

    • Country Name
      ARGENTINA
    • Counterpart Institution
      Facultad de Bioquimica,Quimica,Farmacia/Universidad Nacional de Tucuma'n/-
  • [Journal Article] A new sarasinoside congener, sarasinoside M2, from a marine sponge collected in the Solomon Islands2017

    • Author(s)
      Clyde Gorapava Puilingi, Yuta Kudo, Yuko Cho, Keiichi Konoki, and Mari Yotsu-Yamashita*
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 81 Pages: 222-225

    • DOI

      10.1080/09168451.2016.1246172

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Inhibition of veratridine-induced delayed inactivation of the voltage-sensitive sodium channel by synthetic analogs of crambescin B,2017

    • Author(s)
      Tadaaki Tsukamoto, Yukie Chiba, Atsuo Nakazaki, Yuki Ishikawa, Yoshiki Nakane, Yuko Cho, Mari Yotsu-Yamashita, Toshio Nishikawa, Minoru Wakamori, and Keiichi Konoki,*
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 27 Pages: 1247-1251

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2017.01.054

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Synthesis and identification of key biosynthetic intermediates for the formation of the tricyclic skeleton of saxitoxin2017

    • Author(s)
      Shigeki Tsuchiya, Yuko Cho, Renpei Yoshioka, Keiichi Konoki, Kazuo Nagasawa, Yasukatsu Oshima, and Mari Yotsu-Yamashita*
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1002/anie.201612461

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Biosynthetic route towards saxitoxin and shunt pathway2016

    • Author(s)
      Shigeki Tsuchiya, Yuko Cho, Keiichi Konoki, Kazuo Nagasawa, Yasukatsu Oshima and Mari Yotsu-Yamashita,*
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: -

    • DOI

      10.1038/srep20340

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The praying mantis (Mantodea) as predator of the poisonous red-spotted newt Notophthalmus viridescens (Amphibia: Urodela: Salamandridae)2016

    • Author(s)
      Dietrich Mebs*, Mari Yotsu-Yamashita and Osamu Arakawa
    • Journal Title

      Chemoecology

      Volume: 26 Pages: 121-126

    • DOI

      10.1007/s00049-016-0211-3

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Spectroscopic and structural investigation on intermediates species structurally associated to the tricyclic bisguanidine compound and to the toxic agent, saxitoxin2016

    • Author(s)
      Davide Romani, Shigeki Tsuchiya, Mari Yotsu-Yamashita, Silvia A. Brandon*
    • Journal Title

      Journal of Molecular Structure

      Volume: 1119 Pages: 25-38

    • DOI

      10.1016/j.molstruc.2016.04.039

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Cyclic Guanidine Compounds From Newts Support the Hypothesis that Tetrodotoxin is Derived From Monoterpene2016

    • Author(s)
      Yuta Kudo, Takeshi Yasumoto, Dietrich Mebs, Yuko Cho, Keiichi Konoki, and Mari Yotsu-Yamashita*
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 55 Pages: 8728-8731

    • DOI

      10.1002/ange.201602971.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Effect of carbon chain length in acyl coenzyme A on the efficiency of enzymatic transformation of okadaic acid to 7-O-acyl okadaic acid2016

    • Author(s)
      Sachie Furumochi, Tatsuya Onoda, Yuko Cho, Haruhiko Fuwa, Makoto Sasaki, Mari Yotsu-Yamashita, and Keiichi Konoki*
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 26 Pages: 2992-2996

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2016.05.027

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The voltage-gated sodium ion channel inhibitory activities of a new tetrodotoxin analogue, 4,4a-anhydrotetrodotoxin, and three other analogues evaluated by colorimetric cell-based assay2016

    • Author(s)
      Shogo Saruhashi, Keiichi Konoki, and Mari Yotsu-Yamashita*
    • Journal Title

      Toxicon

      Volume: 119 Pages: 72-76

    • DOI

      10.1016/j.toxicon.2016.05.012

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Asymmetric synthesis of crambescin A_C carboxylic acids and their inhibitory activity on voltage-gated sodium channels2016

    • Author(s)
      Atsuo Nakazaki, Yoshiki Nakane, Yuki Ishikawa, Mari Yotsu-Yamashita and Toshio Nishikawa*
    • Journal Title

      Org. Biomol. Chem.

      Volume: 14 Pages: 5304-5309

    • DOI

      10.1039/c6ob00914j

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Two Cytochrome P450 Monooxygenases Catalyze Early Hydroxylation Steps in the Potato Steroid Glycoalkaloid Biosynthetic Pathway2016

    • Author(s)
      Naoyuki Umemoto*, Masaru Nakayasu, Kiyoshi Ohyama, Mari Yotsu-Yamashita, Masaharu Mizutani, Hikaru Seki, Kazuki Saito, and Toshiya Muranaka
    • Journal Title

      Plant Physiol.

      Volume: 171 Pages: 2458-2467

    • DOI

      10.1104/pp.16.00137

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Total Synthesis of 11-Saxitoxinethanoic Acid and Evaluation of its Inhibitory Activity on Voltage-gated Sodium Channels2016

    • Author(s)
      Chao Wang; Mana Oki, Toru Nishikawa, Daisuke Harada, Mari Yotsu-Yamashita and Kazuo Nagasawa*
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 55 Pages: 11600-11603

    • DOI

      10.1002/anie.201604155

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Diastereoselective Ring-Closing Metathesis as a Means to Construct Medium-Sized Cyclic Ethers: Application to the Synthesis of a Photoactivatable Gambierol Derivative2016

    • Author(s)
      Yu Onodera, Kazuaki Hirota, Yuto Suga, Keiichi Konoki, Mari Yotsu-Yamashita, Makoto Sasaki, and Haruhiko Fuwa*
    • Journal Title

      J. Org. Chem.

      Volume: 81 Pages: 8234-8252

    • DOI

      10.1021/acs.joc.6b01302

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Column switching combined with hydrophilic interaction chromatography-tandem mass spectrometry for the analysis of saxitoxin analogues, and their biosynthetic intermediates in dinoflagellates2016

    • Author(s)
      Yuko Cho*, Shigeki Tsuchiya, Renpei Yoshioka, Takuo Omura, Keiichi Konoki, Yasukatsu Oshima, Mari Yotsu-Yamashita
    • Journal Title

      Journal of Chromatography A

      Volume: 1474 Pages: 109-120

    • DOI

      10.1016/j.chroma.2016.10.065

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Tetrodotoxin concentrations in rough-skinned newts,;Taricha granulosa, from populations of their northern distribution range.2016

    • Author(s)
      Mebs, D.,* M. Yotsu-Yamashita, J. Ream, B. K. Zajac & R. Zehner
    • Journal Title

      Salamandra

      Volume: 52 Pages: 255-260

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] モヨウフグ(Arothron)属3種およびオキナワフグ(Chelonodon patoca)血漿中のテトロドトキシン類とPSTBP類似タンパク質の解析2017

    • Author(s)
      長岡佑真、村本光二、長由扶子、此木敬一、○山下まり
    • Organizer
      平成29年度日本水産学会春季大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学品川キャンパス(東京都品川区)
    • Year and Date
      2017-03-28 – 2017-03-28
  • [Presentation] 渦鞭毛藻Alexandrium tamarense有毒、無毒株比較研究、推定STX生合成酵素SxtAの免疫化学的手法によるタンパク発現解析2017

    • Author(s)
      ○長 由扶子・土屋成輝・日出間志寿 大村卓朗・小池一彦・及川 寛・此木敬一・大島泰克・山下まり
    • Organizer
      平成29年度日本水産学会春季大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学品川キャンパス(東京都品川区)
    • Year and Date
      2017-03-27 – 2017-03-27
  • [Presentation] 記憶喪失性貝毒ドウモイ酸新規関連化合物の探索2017

    • Author(s)
      ○海老根 優香理、小瀧 裕一、寺田 竜太、長 由扶子、此木 敬一、山下 まり
    • Organizer
      日本農芸化学会大会2017
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-20 – 2017-03-20
  • [Presentation] 有毒藍藻 Anabaena circinalis(TA04)からの未知麻痺性貝毒サキシトキシン類縁体の探索2017

    • Author(s)
      ○美野輪 高之、長 由扶子、土屋 成輝、此木 敬一、大島 泰克、山下 まり
    • Organizer
      日本農芸化学会大会2017
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-20 – 2017-03-20
  • [Presentation] フグにおける新規テトロドトキシン関連化合物の探索2017

    • Author(s)
      ○上山 望、杉本 敬太、長 由扶子、此木 敬一、山下 まり
    • Organizer
      日本農芸化学会大会2017
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-20 – 2017-03-20
  • [Presentation] クロイソカイメン共生菌が生産する新規有毒二次代謝産物の探索2017

    • Author(s)
      ○菊池 颯、岡田 華弥、長 由扶子、山下 まり、此木 敬一
    • Organizer
      日本農芸化学会大会2017
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-19 – 2017-03-19
  • [Presentation] ベラトリジンによる電位依存性ナトリウムチャネルの不活性化遅延作用に対するクランベシンB類縁体の抑制効果2017

    • Author(s)
      ○塚本匡顕、千葉雪絵、中崎敦夫、石川裕生、中根嘉祈、長由扶子、西川俊夫、山下まり、此木敬一
    • Organizer
      ベラトリジンによる電位依存性ナトリウムチャネルの不活性化遅延作用に対するクランベシンB類縁体の抑制効果
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-18 – 2017-03-18
  • [Presentation] Prediction of biosynthetic pathways of tetrodotoxin and saxitoxin on the basis of the structures of their intermediates2016

    • Author(s)
      ○Mari Yotsu-Yamashita, Yuta Kudo, Shigeki Tsuchiya, Yuko Cho, and Keiichi Konoki
    • Organizer
      8th US-Japan symposium 21st century innovations in Natural Products
    • Place of Presentation
      University of Hawaii Cancer center, Hawaii Honolulu USA
    • Year and Date
      2016-11-14 – 2016-11-17
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] トラフグ属(Takifugu)以外の属のフグ血漿中のPSTBP類似タンパク質2016

    • Author(s)
      ○長岡 佑真、村本 光二、長 由扶子、此木 敬一、山下 まり
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部第151回大会
    • Place of Presentation
      山形大学農学部(山形県鶴岡市)
    • Year and Date
      2016-10-09 – 2016-10-09
  • [Presentation] 麻痺性貝毒生合成中間体の同定と生合成経路の解明2016

    • Author(s)
      ○土屋成輝, 長由扶子, 吉岡廉平, 美野輪高之,此木敬一, 長澤和夫, 大島泰克, 山下まり
    • Organizer
      第58回天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      東北大学百周年記念会館川内萩ホール(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-14 – 2016-09-16
  • [Presentation] A new sarasinoside from marine sponge Melophlus sarasinorum collected in the Solomon Islands2016

    • Author(s)
      ○Clyde Gorapava Puilingi, Yuta Kudo, Keiichi Konoki, Yuko Cho and Mari Yotsu-Yamashita
    • Organizer
      Tohoku University Campus Asia Summer School
    • Place of Presentation
      東北大学理学研究科(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-08-18 – 2016-08-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Screening of the biosynthetic intermediates of paralytic shellfish toxins using stable isotope-labeled precursors2016

    • Author(s)
      ○Shigeki Tsuchiya, Yuko Cho, Keiichi Konoki, and Mari Yotsu-Yamashita
    • Organizer
      Tohoku University Campus Asia Summer School
    • Place of Presentation
      東北大学理学研究科(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-08-18 – 2016-08-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 麻痺性貝毒生合成経路及び生合成中間体の排出経路の推定2016

    • Author(s)
      土屋 成輝, 長 由扶子, 此木 敬一, 長澤 和夫, 大島 泰克, 山下 まり
    • Organizer
      第63回トキシンシンポジウム
    • Place of Presentation
      山形県天童市
    • Year and Date
      2016-07-14 – 2016-07-14
    • Invited
  • [Presentation] 電位依存性ナトリウムチャネルに対するテトロドトキシンおよび類縁体の阻害活性評価2016

    • Author(s)
      塚本匡顕・千葉雪絵・安立昌篤・榊原 良・所 聖太・今津拓也・佐竹佳樹・;長 由扶子・西川俊夫・山下まり・◯此木敬一
    • Organizer
      化学生態学研究会
    • Place of Presentation
      北海道函館市
    • Year and Date
      2016-07-01 – 2016-07-02
  • [Presentation] 新規麻痺性貝毒生合成関連化合物の合成と同定2016

    • Author(s)
      ○土屋成輝、長由扶子、吉岡廉平、此木敬一、長澤和夫、大島泰克、山下まり
    • Organizer
      第27回万有仙台シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-06-25 – 2016-06-25
  • [Remarks] 東北大学大学院農学研究科天然物生命化学分野

    • URL

      http://www.agri.tohoku.ac.jp/bukka/index-j.html

  • [Remarks] LaboratoryofBioorganicChemistryofNaturalProducts

    • URL

      http://www.agri.tohoku.ac.jp/bukka/English%20Version.htm

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-02-16  

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