2016 Fiscal Year Annual Research Report
Regulation of helper/cytotoxic lineage choice by chromatin structures
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26293109
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
谷内 一郎 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, グループディレクター (20284573)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | T細胞分化 / クロマチン構造 / 転写因子 / 細胞分化 / 系列決定 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
胸腺内でのヘルパー/キラー系列機構はTCR信号を細胞運命決定機構に変換する制御機構を理解する為の優れたモデルと言える。本研究課題では、ヘルパー/キラー系列に重要なThpok/ Runx3遺伝子に着目し、３次元的なクロマチン構造変化を介したこれら遺伝子の発現制御機構を明らかにすることを目的とし、研究を行った。これまでにinsertion ChIP(iChiP)法によりThpok遺伝子座はキラー系列特異的に制御領域が近接した位置に配置されるクロマチン構造をとること、Thpok遺伝子座と近接する事なる染色体上に位置する遺伝子座の同定を行った。またiChIP法によりThpok遺伝子に近接する遺伝子座から転写させるRNAの会合も検出し、これらの結果から核内でT細胞分化制御に関与する遺伝子群が近接した位置で転写されるfociが形成されている事が示唆された。またBcl11b転写因子のC末端Znフィンガー構造を介して胸腺細胞分化初期過程にThpok遺伝子のクロマチン構造がT細胞型にprimingされることが重要であり、胸腺細胞初期分化過程でのBcl11bを介したThpok遺伝子の発現抑制は従来のサイレンサー領域非依存性であることを見出した。また生化学的手法によりThpokサイレンサー結合因子遺伝子として同定したSATB1はゲノムオーガナイザーとして知られていたが、遺伝子改変マウスの表現型解析、ChIP-seq等の解析により、SATB1はThpok、Runx3、Foxp3、CD4、CD8遺伝子といったが胸腺細胞の系列決定に重要な遺伝子群の発現制御に必須であることを見出した。またThpok遺伝子とCd4遺伝子座間でサイレンサーを入れ替えたアレルの解析から、制御領域の機能発現には遺伝子座特異的な特性が関与していることを見出した。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Guidance of regulatory T cell development by Satb1-dependent super-enhancer establishment.2017
Author(s)
Kitagawa Y, Ohkura N, Kidani Y, Vandenbon A, Hirota K, Kawakami R, Yasuda K, Motooka D, Nakamura S, Kondo M, Taniuchi I, Kohwi-Shigematsu T, Sakaguchi S.
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Journal Title
Nature Immunology
Volume: 18
Pages: 173-183
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Essential roles of SATB1 in specifying T lymphocyte subsets2017
Author(s)
Kakugawa K, Kojo S, Tanaka H, Seo W, Endo T, Kitagawa Y, Muroi S, Teno M, Yasmin N, Kohwi Y, Sakaguchi S, Kowhi-Shigematsu, T and Taniuchi I.
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Journal Title
Cell Reports
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Runx3 guards cytotoxic CD8+ effectors against Tfh deviation in acute viral infection2017
Author(s)
Shan Q, Zeng Z, Xing S, Li F, Hartwig S, Gullicksrud J, Su Y, Kurup S, Badovinac N, Su Y, Martin M, Taniuchi I, Harty J, Peng W, Badvinac V and Xue H-H
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Journal Title
Nature Immunology
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
Peer Reviewed / Open Access
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