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2015 Fiscal Year Research-status Report

エンドソームにおけるユビキチンホメオスタシス制御

Research Project

Project/Area Number 26440070
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

木村 洋子  静岡大学, 農学部, 教授 (80291152)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsユビキチン / 熱ストレス / エンドソーム / ホメオスタシス / 酵母 / V ドメイン
Outline of Annual Research Achievements

ユビキチンはタンパク質の機能を制御する必須の修飾分子である。ユビキチンの発現は環境に応じて変動し適切な量に調節されており、ユビキチン量が調節されていること(ユビキチンホメオスタシス)は、生命活動の維持に重要であり、この調節メカニズムの研究を進めている。出芽酵母においてRfu1(Regulator for free chains)は、エンドソームに局在し脱ユビキチン化酵素Doa4を阻害することによって、細胞内の単量体ユビキチンレベルを制御している。ESCRT補助因子でBro1は、Doa4とRfu1の両方のエンドソームへの局在や活性を制御していることが他の研究室や我々の研究により明らかになり、さらにBro1がユビキチン結合タンパク質でもあることが報告されたため、Bro1の解析を進めた。Bro1とRfu1は、Bro1のVドメインとRfu1のYPEL モチーフを介して結合している。Bro1の哺乳類ホモログであるAlixのV ドメインでは、Phe残基を中心とする疎水性の溝がYP(X)nLモチーフとの結合箇所であることが報告されている。そこで、Bro1 VドメインのPhe残基に変異を導入したところ、Rfu1との結合が顕著に低下することがわかった。さらに、酵母におけるV ドメインとYP(X)nLモチーフとの相互作用の普遍性を確かめるためにアルカリストレス応答に関与するRim20とRim101の相互作用も検討した。Rim20はVドメイン、Rim101はYP(X)nLモチーフを有している。この2つの分子についても、V ドメインとYP(X)nLモチーフが直接の結合に必要であることを明らかにし、またアルカリストレス応答においても、この相互作用が重要であることを示した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

Bro1とRfu1の相互作用を詳細に明らかにすることができた。さらに、酵母におけるV ドメインとYP(X)nLモチーフの相互作用の重要性をアルカリストレスに関わるRim20とRim101においても示すことができた。

Strategy for Future Research Activity

Rfu1は熱ストレスによって分解されるが、これにはRsp5ユビキチンリガーゼが必要である。精製したRfu1とRsp5を混ぜてもRfu1のユビキチン化が起きないこと、多くのRsp5の基質のユビキチン化においてアダプタータンパク質が必要であることから、Rfu1の場合もアダプター分子が介在してユビキチン化が起きる可能性がある。そこで、アダプター分子の探索を行う。今まで報告されているRsp5のアダプター分子をコードする20種類弱の遺伝子の欠損変異株にRfu1-3xFlagを発現させ、熱ショックによる分解が阻害される変異株を選ぶ。同定できた場合は、その遺伝子をタグ付きタンパク質で発現するように改変し、免疫沈降により直接の結合が見られるかどうか検討する。また、当該遺伝子を大腸菌で発現させて、リコンビナントのタンパク質を得て、in vitroでRfu1のユビキチン化反応がおきるかどうか検討する。

  • Research Products

    (3 results)

All 2015

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Conserved Mode of Interaction between Yeast Bro1 Family V Domains and YP(X)nL Motif-Containing Target Proteins2015

    • Author(s)
      Yoko Kimura, Mirai Tanigawa, Junko Kawawaki, Kenji Takagi, Tsunehiro Mizushima, Tatsuya Maeda, Keiji Tanaka
    • Journal Title

      Eukaryotic Cell

      Volume: 14 Pages: 976-982

    • DOI

      10.1128/EC.00091-15

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Conserved Mode of Interaction between Yeast Bro1 Family V Domains and YP(X)nL Motif-Containing Target Proteins2015

    • Author(s)
      Yoko Kimura, Mirai Tanigawa, Junko Kawawaki, Kenji Takagi, Tsunehiro Mizushima, Tatsuya Maeda, Keiji Tanaka
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市中央区)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] 酵母Bro1およびRim20のV ドメインの解析2015

    • Author(s)
      木村 洋子、谷川美頼、川脇純子、高木賢治、水島恒裕、前田達哉・田中啓二
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム
    • Place of Presentation
      広島大学〈広島県東広島市)
    • Year and Date
      2015-08-31 – 2015-09-02

URL: 

Published: 2017-01-06  

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