原発開放隅角緑内障における視野障害パターン別全ゲノム解析

2015 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 26462666
• Research Institution: Kyoto Prefectural University of Medicine
• Principal Investigator: 池田 陽子 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 客員講師 (00433243)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 田代 啓 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10263097) ; 木下 茂 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30116024) ; 森 和彦 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (40252001) ; 上野 盛夫 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (40426531) ; 中野 正和 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (70381944)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: 遺伝子 / 視野障害 / 緑内障

Outline of Annual Research Achievements

既にアフィメトリクス1000Kチップの全ゲノムのジェノタイプデータを取得している広義原発開放隅角緑内障（正常眼圧緑内障を含む）の1100症例について、昨年度は視野障害パターンを決定している。本年度はそれらの視野障害パターン別の全ゲノム解析の実施を行い、視野障害パターンを規定するバリアントの同定を試みた。1100症例の中には視野障害パターンを判別することが難しい症例も含まれているため、片眼の視野パターン判定が不明なものを除外した。両眼とも視野障害パターンが中心視野障害型を示した症例は２８例であったが、症例数が少ないために解析から除外した。両眼の視野障害型が判別でき、少なくとも片眼の視野障害型が上方障害型、または下方障害型を示した６３５例を今回の解析対象とした。解析パターン１として、「下方障害型を優先し、左右眼で視野障害型のパターンが異なった場合は下方障害型と分類して解析」、またパターン２として「左右眼で視野障害型が異なっているものは解析から除外して解析」と規定した。パターン１の解析対象は６３５例(上方障害型３３１例、下方障害型３０４例、男女比１．１、平均年齢６１．３±１３．８歳）パターン２の解析対象は５１５例（上方障害型３２７例、下方障害型１８８例、男女比１．２、平均年齢６１．３±１４．０歳）であった。しかしながらボンフェローニ補正を超える有意なバリアントは同定することができなかった。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

視野障害パターン別の全ゲノム解析を実施できた。しかしながらボンフェローニを超える有意なバリアントは同定できなかった。

Strategy for Future Research Activity

今年度は今回の全ゲノム解析で有意なバリアントの同定を行うことができなかった。視野障害が中期を超えてくると視野障害の範囲が広範囲となってくるため、視野障害パターン以外に視野の病期を決定し、中期までの視野障害を示す症例に限定し、視野障害パターンが明瞭に判別できる症例に限って全ゲノム解析を行い、再現性取得実験を行っていく。

Research Products

• [Journal Article] 緑内障セミナー：落屑症候群／落屑緑内障に関連する新規遺伝子 (2015)
  • Author(s): 中野正和、池田陽子
  • Journal Title: あたらしい眼科 Volume: 32 Pages: 1147-1148
• [Journal Article] Trinucleotide Repeat Expansion in the TCF4 Gene in Fuchs’ Endothelial Corneal Dystrophy in Japanese. (2015)
  • Author(s): Nakano M, Okumura N, Nakagawa H, Koizumi N, Ikeda Y, Ueno M, Yoshii K, Adachi H, Aleff RA, Butz ML, Highsmith WE, Tashiro K, Wieben ED, Kinoshita S, Baratz KH.
  • Journal Title: Invest Ophthalmol Vis Sci. Volume: ５６ Pages: 4865-4869
  • DOI: 10.1167/iovs.15-17082
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] A common variant mapping to CACNA1A is associated with susceptibility to exfoliation syndrome. (2015)
  • Author(s): Aung T, Ozaki M, Mizoguchi T, Allingham RR, Li Z, Haripriya A, Nakano S et.al
  • Journal Title: Nature Genetics Volume: 47 Pages: 387-392
  • DOI: 10.1038/ng.3226.
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Presentation] 国際コンソーシアム共同研究で得られた広義原発開放隅角緑内障に関連するバリアント (2015)
  • Author(s): 池田陽子
  • Organizer: 第69回日本臨床眼科学会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2015-10-22 – 2015-10-25
• [Presentation] NOVEL VARIANTS ASSOCIATED WITH EXFOLIATION SYNDROME/EXFOLIATION GLAUCOMA IN JAPANESE (2015)
  • Author(s): Yoko Ikeda, Masakazu Nakano, Kazuhiko Mori, Morio Ueno, Kojiro Imai, Yuichi Tokuda, Hiroko Adachi,Ryuichi Sato, Natsue Omi, Kei Tashiro, Shigeru Kinoshita.
  • Organizer: 6th World Glaucoma Congress
  • Place of Presentation: Hong Kong
  • Year and Date: 2015-06-09 – 2015-06-09
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] New susceptible genetic variants of exfoliation syndrome/exfoliation glaucoma in a Japanese population. (2015)
  • Author(s): Yoko Ikeda, Masakazu Nakano, Kazuhiko Mori, Morio Ueno, Kojiro Imai, Natue Omi, Yuichi Tokuda, Hiroko Adachi, Kei Tashiro, Shigeru Kinoshita.
  • Organizer: The Association Research in Vision and Ophthalmology
  • Place of Presentation: Denver
  • Year and Date: 2015-05-05 – 2015-05-05
  • Int'l Joint Research