2014 Fiscal Year Research-status Report
網羅的ゲノム・エピゲノム解析による神経芽腫再発・治療抵抗性獲得のメカニズムの解明
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26462721
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| Research Institution | Chiba Cancer Center (Research Institute) |
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Principal Investigator |
菱木 知郎 千葉県がんセンター(研究所), 発がん研究部, 主任医長 (00375776)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
上條 岳彦 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 研究所長 (90262708)
吉田 英生 千葉大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (60210712)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 神経芽腫 / 再発 / 網羅的ゲノム解析 / 網羅的エピゲノム解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、次世代シークエンサーを用いた網羅的解析により神経芽腫が再発に至るメカニズムを解明することを目的とする。初発時および再発時の検体がセットで存在する神経芽腫症例につき、2点間のゲノム・エピゲノムレベルの変化を解析することによりクローン進化の機序を明白にし、神経芽腫が再発に至るプロセスで鍵となる分子の同定を目指す。
平成26年度は以下の研究を行った。
①倫理審査承認：共同研究に参画する３施設でそれぞれ倫理審査承認を得た。その上で初発・再発の双方の検体がペアで存在する症例を選出し、患者または患者家族の同意を得られる場合には同意を取得した。
②選出された症例の初発時サンプルに対し、従来行われてきた網羅的ゲノム解析法であるアレイCGH法を用いて神経芽腫の予後因子としてcriticalであるとされるMYCN遺伝子増幅の有無、DNA ploidy、1p loss、11q loss、17q partial gainを解析した。さらに236例の神経芽腫検体を元に作成されたgenomic signature(Tomiokaら、Oncoge 2008)を元に各症例の予後解析をおこなった。対象症例は６例あり、いずれもstage 4であった。4例はすでに腫瘍死しており、２例は再発生存中であった。MYCN増幅は5例にみとめた。Genomic signature解析は4例に対し行っており、1p lossは3例、11qLOHが2例、17q partial gainは2例に認められた。いずれも5年生存率30%以下と非常に予後の不良なグループに属する腫瘍であることがわかった。
③エクソームシークエンス解析：倫理審査承認に時間を要し、今回対象とする検体の解析を行うに至らなかった。そのため既存の検体を用い条件調整を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
倫理審査手続きに若干予想を上回る時間を要したこと、過去の検体調整に時間を要したことが計画より遅れている原因となっている。今後挽回できる遅れと考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初の予定どおり次世代シーケンサーを用いたエクソーム解析およびエピゲノム異常解析を行う予定である。
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| Causes of Carryover |
研究に用いる試薬を不足なく購入でき、次年度以降、本格的な解析を開始するにあたりより多くの予算が必要とされると判断したため、残額14971円を次年度に使用することにしました。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
サンプル調整試薬に用いる予定。
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Research Products
(14 results)
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[Journal Article] Receptor-type protein tyrosine phosphatase k (PTPRK) directly dephosphorylates CD133 and regulates downstream AKT activation2015
Author(s)
Osamu Shimozato, Miyuki Waraya, Kumiko Nakashima, Hiroaki Souda, Nobuhiro Takiguchi, Hiroshi Yamamoto, Hisanori Takenobu, Haruka Uehara, Eriko Ikeda, Serina Matsushita, Natsumi Kubo, Akira Nakagawara, Toshinori Ozaki, and Takehiko Kamijo
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Journal Title
Oncogene.
Volume: 34
Pages: 1949-60.
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Prognostic significance of Aminopeptidase-N (CD13) in hepatoblastoma.2015
Author(s)
Saida S, Watanabe KI, Kato I, Fujino H, Umeda K, Okamoto S, Uemoto S, Hishiki T, Yoshida H, Tanaka S, Adachi S, Niwa A, Nakahata T, Heike T.
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Journal Title
Pediatr Int.
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Unique expression features of cancer-type organic anion transporting polypeptide 1B3 mRNA expression in human colon and lung cancers2014
Author(s)
Sun Y, Furihata T, Ishii S, Nagai M, Harada M, Shimozato O, Kamijo T, Motohashi S, Yoshino I, Kamiichi A, Kobayashi K, Chiba K.
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Journal Title
Clin Transl Med.
Volume: 3
Pages: 37
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Histological features of primary tumors after induction or high-dose chemotherapy in high-risk neuroblastoma.2014
Author(s)
Hishiki T, Horie H, Higashimoto Y, Yotsumoto K, Komatsu S, Okimoto Y, Kakuda H, Taneyama Y, Saito T, Terui K, Mitsunaga T, Nakata M, Ochiai H, Hino M, Ando K, Yoshida H, Iwai J.
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Journal Title
Pediatric Surgery International
Volume: 30
Pages: 919-926
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] 半定量的MIBGスコアによる転移性神経芽腫治療反応性の判定と初期反応不良例の臨床的生物学的特徴2014
Author(s)
Tomoro Hishiki, Yasuyuki Higashimoto, Katsumi Yotsumoto, Shugo Komatsu, Yuri Okimoto, Harumi Kakuda, Yuichi Taneyama, Kazuki Furudate, Takeshi Saito, Keita Terui, Tetsuya Mitsunaga, Mitsuyuki Nakata, Hidemasa Ochiai, Moeko Koshino, Kumiko Ando, Hideo Yoshida, and Jun Iwai
Organizer
第52回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
岡山市
Year and Date
2014-11-28 – 2014-11-30
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[Presentation] TUMOR HISTOLOGY FOLLOWING INDUCTION CHEMOTHERAPY AND / OR HIGH-DOSE CHEMOTHERAPY AND ITS IMPACT ON THE OUTCOME OF PATIENTS WITH HIGH-RISK NEUROBLASTOMA2014
Author(s)
Tomoro Hishiki, Hiroshi Horie, Yasuyuki Higashimoto, Katsumi Yotsumoto, Shugo Komatsu, Yuri Okimoto, Harumi Kakuda, Yuichi Taneyama, Takeshi Saito, Keita Terui, Tetsuya Mitsunaga, Mitsuyuki Nakata, Hidemasa Ochiai, Moeko Hino, Kumiko Ando, Hideo Yoshida, and Jun Iwai
Organizer
46th annual congress of SIOP
Place of Presentation
トロント市（カナダ）
Year and Date
2014-10-22 – 2014-10-25
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